Jonathan Thorsen

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Jonathan Thorsen

文章数：15篇

非独生子女的生命早期菌群或更健康

本研究探索了一个有趣的问题：已有兄弟姐妹的非独生子女在生命早期呼吸道、肠道菌群变化过程中，是否有其独特性呢？本研究发现，与最近一位兄弟姐妹年龄差是生命早期菌群的重要影响因素；而生命早期的菌群将影响未来哮喘等过敏性疾病的风险。因此，未来在研究儿童肠道菌群时，应该关注收集其家庭中兄弟姐妹的年龄情况。

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阴道菌群失调或增加剖宫产风险

本研究通过纵向阴道菌群的评估，揭示了女性孕期阴道菌群结构的变化规律，具有重要的临床意义。同时，本研究还创造了一套阴道微生态失调评分系统，该评分与紧急剖宫产风险之间存在关联，具有较大的临床推广价值。

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抗生素耐药组

Cell子刊：哪些因素影响了婴儿肠道耐药组

Cell Host and Microbe上发表的一项最新研究，通过分析662名丹麦新生儿1岁之前的肠道菌群，发现婴儿的肠道耐药组受到多种因素的影响：大肠杆菌的相对丰度、环境因素、肠道菌群成熟度、哮喘相关细菌组成。

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菌群-免疫互作

城市化相关菌群变化可能增加婴儿的特应性疾病风险

城市化与特应性疾病的风险增加相关。一种假说机制是，城市化导致婴儿生命早期的有益菌暴露减少，从而导致免疫系统失调。Journal of Allergy and Clinical Immunology上发表的一项前瞻性队列研究结果，对700名生活在城市或乡村的婴儿的生命早期（1岁前）呼吸道菌群及肠道菌群进行分析，发现生命早期的菌群组成与生活环境密切相关，且城市化相关的菌群变化可能通过影响免疫系统发育，从而增加婴儿6岁时的哮喘及特应性疾病风险。

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Science子刊：剖腹产相关菌群变化可能增加儿童哮喘风险

Science Translational Medicine上发表的一项前瞻性出生队列研究，对700名新生儿出生后1年内的肠道菌群变化进行分析，并在随访6年期间关注哮喘的发病。对于剖腹产婴儿，出生后1周及1个月的粪便菌群组成显著不同于顺产婴儿，而在出生后1年时这种差异变得很小。而对于部分在1岁时仍有着与顺产儿显著不同的菌群组成的剖腹产儿，其哮喘风险较高。这些发现提示，帮助剖腹产婴儿在1岁时恢复正常的肠道菌群发育和成熟，或有助于减少之后的哮喘风险。

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过敏性鼻炎

上呼吸道菌群如何影响过敏性鼻炎风险

Journal of Allergy and Clinical Immunology近期发表的文章，通过对出生1周、1个月、3个月的婴儿上呼吸道菌群和上呼吸道粘膜细胞的DNA甲基化，以及6岁时是否罹患过敏性鼻炎进行调查，发现上呼吸道菌群可影响CpG的甲基化，进而对6岁时是否罹患过敏性鼻炎造成影响。

过敏性鼻炎上呼吸道菌群 DNA甲基化

皮肤微生物组

mBio：人真皮微生物群组成

由于个体间的差异，皮肤微生物被描述为微生物指纹图谱。目前对皮肤微生物的理解是基于对表皮最外层的采样，而其余皮肤层的微生物群尚未得到充分研究。mBio近期的研究，对皮肤的表皮和真皮微生物组成进行了分析，结果显示，表皮和真皮之间的组成和功能有所不同。真皮在个体间通常含有较多的同源微生物组成，是表皮微生物群的一个特定亚群。猜测真皮微生物能直接接触到人体宿主的免疫应答，研究宿主与菌群之间的互作，如皮肤疾病和慢性感染等，可以真皮为研究对象。

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膳食补充剂

Nature子刊：孕期服用膳食补充剂，对婴儿呼吸道菌群有什么影响？

研究表明，孕妇补充鱼油和维生素D可以减少后代哮喘和喘息的发病率，这可能是通过改变孕妇或婴儿的微生物组成实现的。Nature communication最近的研究，给736名孕妇补充n-3长链多不饱和脂肪酸和/或维生素D，或安慰剂，并对695对母婴的菌群（母亲妊娠期阴道菌群、婴儿粪便和呼吸道菌群）进行了分析。结果表明，膳食补充剂能影响婴儿呼吸道菌群组成和呼吸道免疫（如影响鼻内CCL4、TNF-α和CXCL8等细胞因子和趋化因子浓度）。这些膳食补充剂也影响婴儿气道菌群的成熟和特定细菌属的相对丰度。本研究结果提示，孕期膳食补充剂或可调节婴儿呼吸道菌群。

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呼吸道菌群

Nature子刊：早期的呼吸道菌群或能预测儿童哮喘风险

哮喘可能源于生命早期的免疫发育异常，与这一时期的环境因素对呼吸道菌群的影响有关。Nature Communications近期发表一项来自丹麦的前瞻性队列研究，分析了700名儿童生命早期的呼吸道菌群组成，鉴定出特征菌属并构建模型，可预测6岁时的哮喘风险，并揭示了菌群特征与呼吸道免疫之间的关系，为生命早期的菌群-免疫互作对哮喘风险的影响提供了进一步的证据。

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阿奇霉素对儿童肠道菌群具有短期影响

大环内酯类抗生素通常用于儿童呼吸道感染和哮喘发作。虽然已证明其临床益处，但其治疗用途的副作用仍令人担忧。本文评估了阿奇霉素对幼儿肠道微生物群的短期和长期影响。结果表明，阿奇霉素治疗14天后会诱导肠道微生物群的变动，但对肠道微生物群的组成没有长期影响。不过，其分析的样本数量有限。

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NC：肠道菌群发育不成熟，或触发儿童哮喘的遗传风险

这是Nature Communications[IF：12.124]发表的一项重要的“卫生假说”相关研究，发现菌群发育不成熟，或让儿童在5岁时的哮喘风险增加，特别是在母亲也患有哮喘的儿童中，一开始的菌群刺激不够，更是多触发了哮喘的遗传风险。很值得关注的研究，特别推荐。

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化脓性汗腺炎

JAMA子刊：化脓性汗腺炎患者的毛囊皮肤菌群

① 下一代测序检测化脓性汗腺炎（HS）患者和健康者毛囊皮肤菌群；② HS患者的病灶和非病灶毛囊皮肤菌群明显区别于健康对照组；③ 共鉴定出5种皮肤菌群组成：冠状杆菌属（I型）、不动杆菌和莫拉菌属（II型）、表皮葡萄球菌（III型）、卟啉单胞菌和Peptoniphilus菌属（IV型）和痤疮丙酸杆菌（V型）；④ 病灶皮肤菌群主要为I型和IV型，健康皮肤菌群未检测出IV型；⑤ HS的痤疮丙酸杆菌相对丰度显著高于健康对照组，表明其可能是HS发病机制的部分原因。

化脓性汗腺炎毛囊皮肤菌群

Airway microbiome

Microbiome：健康婴儿的咽下菌群特征

健康婴儿的咽下菌群长什么样，有哪些细菌，看看这篇文章哦。

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NEJM：孕期摄入鱼油，显著降低儿童哮喘风险

最近几天非常火的文章，小秘书特别推荐一下，也再次推荐专题：http://mc.gutgutgut.cn/discovery/recommend/1188474528

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Microbiome：16S 测序数据分析，哪种统计方法最给力？

生物信息学相关文献，我们都很头疼，为此这篇专门请了谱元科技的覃俊杰博士做解读，方才实现分享，特别推荐给大家。

16S sequencing Benchmark Beta-diversity Differential relative abundance Microbiome