Amir Zarrinpar

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文章数：10篇

胆汁酸代谢

肠道菌群的胆汁酸调节及其与疾病的关联（综述）

Gastroenterology上发表的一篇综述，详细介绍了肠道菌群的胆汁酸代谢产物（尤其是短链脂肪酸）如何调控宿主的生理过程，并讨论了肠道菌群的胆汁酸代谢与多种疾病（非酒精性脂肪性肝病、IBS、结直肠癌、神经炎症、衰老等）的关联及背后机制。

胆汁酸代谢综述

肠道菌群干预

Cell：改造“原住”肠菌，实现对宿主生理的持久影响

活菌疗法（如益生菌、工程菌）旨在通过向宿主肠道中植入有益的外源细菌来改善疾病。然而，这些“外来”菌通常难以适应“严酷”的肠道环境，竞争不过肠道中的“原住”菌群，从而难以在宿主肠道中定居和存活，无法稳定、持续地发挥有益作用，这是目前活菌治疗所面临的一大障碍。Cell最新发表了来自加州大学圣地亚哥分校Amir Zarrinpar团队的一项概念验证研究，表明可以对小鼠和人的“原住”大肠杆菌进行基因改造，这种改造的“原住”肠菌具有很强的肠道适应性，可以稳定植入宿主肠道，并对宿主生理产生持久影响，例如改善糖尿病小鼠的胰岛素敏感性。该研究不仅为活菌疗法研发提供了新思路，也为在复杂菌群背景下研究特定细菌基因的功能、对宿主生理的影响和作用机制，提供了一套可用的方法。

肠道菌群干预工程菌菌群操作菌群疗法

Cell子刊：高脂饮食破坏回肠菌群和基因表达的节律性，限食进食来改善

Cell Reports发表的这项小鼠研究表明，不限时间的高脂饮食会使小肠（回肠）菌群和宿主基因表达丧失昼夜节律变化，而限时进食可部分恢复这些有害变化，包括恢复回肠菌群震荡、昼夜节律基因、胆汁酸信号和GLP-1调节。

昼夜节律小肠菌群限时进食高脂饮食胆汁酸

益生菌植物乳杆菌HNU082

张家超+Rob Knight：趋同进化vs.差异调节-益生菌的适应性突变

益生菌在宿主肠道内定植适应的机理尚不清晰，特别是缺乏其遗传进化的体内研究。海南大学张家超团队与UCSD的Rob Knight合作在Microbiome上发表文章，以植物乳杆菌HNU082(Lp082)为益生菌模型菌株，揭示其在不同宿主肠道中高度趋同的适应过程和策略。相反，宿主肠道菌群对Lp082的引入呈现出不同反应与互作。而作为‘暂驻菌’，益生菌的引入对肠道常驻菌群遗传组成的影响常常被忽略。

益生菌植物乳杆菌HNU082 进化适应研究论文

南昌大学徐振江等：微生物组或可预测人的实际年龄

研究表明，肠道微生物组会随着年龄的增长而变化，甚至会加速成年人的衰老。与身体其他部位相比，肠道微生物组的年龄相关变化是否更为显著？能否从微生物组样本中预测一个人的实际年龄？目前并没有定论。最近mSystems发表南昌大学徐振江与UCSD的Rob Knight团队合作的研究，结合了来自包括中国、美国等不同国家的几项大型队列研究，以确定身体哪个部位（肠道、口腔和皮肤）的微生物组可以最准确地预测成年个体的实际年龄。结果发现，皮肤微生物组的预测结果最佳。本研究为进一步研究微生物组在加速或减缓衰老过程中的作用，及在与年龄相关的疾病易感性中的作用奠定了基础，并有助于开发潜在的微生物靶向治疗策略，延缓衰老。推荐阅读。

衰老肠道菌群皮肤菌群口腔菌群预测年龄

面向临床医生的肠道菌群研究解读（综述）

Clinical Gastroenterology and Hepatology的这篇综述介绍了“肠道菌群”的定义和组成、临床取样方法、检测方法和数据分析方法，还提到了临床上解读数据时候可能遇到的陷阱以及解决办法，值得临床医生一读。

gut microbiome Clinician Study design prognosis Diagnosis.

抗生素导致的菌群缺失（AIMD）

Nature子刊：抗生素导致的菌群缺失影响宿主代谢稳态

利用抗生素来清除菌群是肠道菌群领域常用的研究手段。本研究通过检测菌群缺失后宿主的葡萄糖稳态、肠腔内小分子物质含量、肠道细胞转录谱和相关信号激素变化状况，发现抗生素导致的菌群缺失可能通过改变肠细胞的代谢类型，导致宿主的葡萄糖稳态的变化。该研究指出，利用抗生素来清除肠道菌群会引起宿主的代谢变化，对肠道菌群相关的实验设计和结果解读均具有参考价值，值得专业人士关注。

抗生素导致的菌群缺失（AIMD）葡萄糖稳态肠细胞代谢 GLP-1 信号反馈 Esther Garcia-Esquinas

Nature Reviews：肥胖会如何影响IBD？（综述）

关于IBD中的肥胖问题的必读综述，强烈推荐。

肥胖减肥 IBD Maozhang He Congying Chen

YJBM：通过粪菌移植治疗肥胖等代谢综合征（综述）

Yale Journal of Biology & Medicine 是一个还没有被SCI收录的杂志，但今年他们推出的菌群专刊，大牛云集，16篇文章都非常精彩，再次强烈推荐给大家阅读。

粪菌移植肥胖代谢综合征 Pauline Luczynski John F Cryan

Cell子刊：饮食和摄食信号如何影响肠道菌群节律？

① 肠道菌群是高度动态的，其组成和多样性的周期性变化呈每日周期性变化；② 饮食诱导的肥胖能够扰乱肠道菌群节律，并减少周期性波动；③ 限时进食（TRF），摄食在夜间阶段，能够部分恢复周期性波动，并可通过恢复关键的菌群，改变粪便代谢产物，进而改善肥胖和代谢性疾病；④ 摄食/禁食节律引起的肠道菌群的周期性变化可能是肠道菌群影响宿主代谢的潜在机制；⑤ 除饮食外，喂养模式和取样时间，也评估微生物组对宿主代谢的影响的重要参数。

饮食肠道菌群生物节律 David N O'Dwyer Bethany B Moore