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文章数：11篇

甲基化修饰

Nature子刊：鞭毛蛋白甲基化修饰促进细菌粘附

鞭毛作为细菌的运动器官，在细菌运动、致病性及分类上具有重要作用。鞭毛蛋白的糖基化修饰可促进某些致病细菌的粘附、生物膜形成和躲避宿主免疫。而作为引起急性胃肠炎主要病原菌之一的鼠伤寒沙门氏菌（Salmonella typhimurium，St），其鞭毛蛋白缺少糖基化修饰，而是具有甲基化修饰。发表在《Nature Communications》上的一项研究表明，尽管St的鞭毛性状（装配、数量、运动能力）不受鞭毛蛋白甲基化与否的影响，但细菌对宿主上皮细胞的粘附和侵袭则依赖于甲基化修饰。甲基化的鞭毛蛋白通过疏水作用对宿主细胞进行粘附，或可作为抗感染药物的新靶点。

甲基化修饰鞭毛蛋白 Bacterial structural biology Cellular microbiology Pathogens

Nature：基因毒性大肠杆菌导致大肠癌的新证据

Colibactin存在于携带pks毒力基因岛的大肠杆菌中，是近两年来研究得比较多的促大肠癌细菌产物。研究显示，Colibactin具有基因毒性，可导致DNA双链断裂，从而引起宿主细胞基因突变，但由其造成的基因突变究竟具有哪些特征尚不清楚。Nature上周上线的一项最新研究，以人类肠道类器官作为研究模型，首次从基因突变特征的角度为这类大肠杆菌与大肠癌之间的因果性关联，提供了直接的支持性证据，为防治大肠癌提供了新的参考信息。值得注意的是，传统益生菌大肠杆菌Nissle 1917中也存在pks毒力基因岛，而且有研究显示该菌的某些益生作用与pks存在关联，提示该益生菌的长期安全性还需要进一步研究。

结直肠癌 cancer genetics Cancer microenvironment Cancer models intestinal stem cells

婴儿肠道菌群

Nature：剖腹产对新生儿肠道菌群的不良影响

婴儿出生后，会迅速定植来自母亲和环境中的微生物。此前对生命早期肠道菌群的研究大多受限于16S分析的分辨率和较小的样本量，且对新生儿期（≤1月龄）的研究不足。Nature上线的最新研究，发表了迄今为止最大规模的新生儿肠道菌群的宏基因组学研究。这项来自英国的研究发现，分娩方式是影响新生儿期肠道菌群组成的最主要因素，剖腹产使新生儿的菌群中富集医院环境相关的机会致病菌，且破坏了母婴间的拟杆菌传递，证实了剖腹产对早期肠道菌群的不良影响，但这些变化是否有长期健康影响还需进一步研究。

婴儿肠道菌群 Clinical microbiology metagenomics Microbiome paediatrics

鸡盲肠菌群

盲肠菌群多样性研究有助于鸡育种

鸡盲肠菌群显著影响宿主对食物的消化吸收和对病原菌的防御。本研究通过比较商品鸡和印度本土鸡盲肠菌群的差别，发现饲养环境和宿主品系对盲肠菌群的结构具有重要的影响，菌群的结构功能具有显著的品系特异性，这为联合不同鸡品系的肠道菌群优势进行定向育种提供了理论基础，值得专业人士关注。

鸡盲肠菌群菌群的品系特异性育种 16S rRNA gene Amplicon sequencing

Nature子刊：高纤维饮食或能治疗艰难梭菌感染

粪菌移植治疗艰难梭菌感染（CDI）取得的成功，打开了菌群干预疗法的大门。Nature Microbiology刚刚上线来自斯坦福大学医学院的最新研究，探索了用饮食干预方法治疗CDI的可能性。食用富含菌群可利用的碳水化合物（MAC，主要是膳食植物多糖）或菊粉的饲料，可在12天内清除小鼠肠道内的艰难梭菌，该过程与菌群组成改变和短链脂肪酸富集有关。用饮食干预改善肠道菌群和肠道生理，或许在未来的疾病治疗中将大放光彩。

饮食干预艰难梭菌感染高膳食纤维短链脂肪酸 BACTERIAL PATHOGENESIS

北京基础医学研究所：金黄色葡萄球菌感染如何引发胰岛素抵抗

有动物研究表明，感染金黄色葡萄球菌可诱发糖尿病。来自北京基础医学研究所的最新研究，探索了背后的机制：这种细菌产生一种蛋白LtaS，其胞外结构域可结合胰岛素，从而引起胰岛素抵抗和糖耐量异常。值得注意的是，胰岛素抵抗可增加金黄色葡萄球菌定殖风险，或许二者互相促进加速了糖尿病的进展。该研究昨天发表在Nature Microbiology，值得关注。

糖尿病胰岛素抵抗金黄色葡萄球菌葡萄糖耐量细菌-宿主互作

临床宏基因组学

BMCB：在临床诊断中快速鉴定病原体的新方法

这是中国疾控中心团队在BMC Bioinformatics[IF：2.448]发表16S测序数据分析新方法16SPIP的文章，推荐专业人士阅读。

临床宏基因组学 16s 16SPIP Comprehensive analysis pipeline high-throughput sequencing

结核分枝杆菌

MCP：高通量筛选结核分枝杆菌的效应蛋白

来自上海交大团队的工作：通过高通量筛选鉴定出一种新的结核分枝杆菌效应蛋白，或可作为新靶点助力抗结核药物的研发。

结核分枝杆菌蛋白质芯片 Host-Pathogen Interaction Immunology* Mtb proteome microarray

微生物考古学

ARGHG：如何进行微生物考古学研究（综述）

① 在高通量测序时代，微生物考古学盛行，揭示毁灭性的历史瘟疫背后的病原体、鉴定史前病原体的神秘变化、重组人类祖先的菌群；② 本综述引入学科的基本概念和理论框架，讨论从考古学样本中进行病原学鉴定和菌群特征描述的方法学；③ 微生物考古学研究分为二大类：病原基因组学及微生物组研究；④ 特别关注采用高通量DNA测序数据进行鉴别、证实、鉴定的程序；⑤ 最后，概述指导该领域进一步研究的七个标准和预防措施。

微生物考古学古DNA ancient DNA metagenomics Microbiology

临床微生物学

Nature Reviews：一图读懂呼吸道菌群（必读综述）

火爆朋友圈的一图读懂，特别再次推荐给大家。

临床微生物学感染性疾病流行病学病原体呼吸道疾病

Microbiome：薄荷醇影响香烟中的菌群

一个很特别的研究，研究对象是带来健康害处的香烟，感兴趣的人可以好好看看，会有特别的收获。

薄荷醇香烟菌群 16S rRNA Cigarette Menthol