Didier Raoult

人体菌群培养 culture strategies Human microbiota bacteria Archaea

结肠癌（CC）的预后取决于肿瘤浸润的淋巴细胞，包括滤泡辅助T（TFH）细胞，以及化疗诱导的免疫反应效果。目前尚不清楚肠道微生物是否有助于诱导TFH细胞驱动的免疫反应。最新发表在Nature Medicine的研究发现，在CC患者和结肠癌小鼠模型中，回肠内微生物组可塑造回肠上皮细胞的免疫原性，并辅助激活TFH细胞免疫应答。该研究成果表明，免疫原性回肠细胞凋亡有助于提高CC化疗的预后。

结肠癌预后免疫原性肠道微生物组脆弱拟杆菌

肿瘤免疫治疗

肠道菌群组成影响肾细胞癌患者对肿瘤免疫治疗的应答

多项研究报道了肠道菌群组成影响癌症患者对免疫检查点抑制剂（ICI）治疗的应答，但尚无在肾细胞癌中的相关研究。European Urology上发表的一项最新研究，在接受纳武单抗治疗的69名肾细胞癌患者中发现，近期抗生素使用可改变肠道菌群组成，并降低患者的客观应答率。将应答患者的菌群或有益于ICI治疗的菌种（在应答患者中富集）移植给荷瘤小鼠可增强后者对ICI治疗的应答。另外，在使用纳武单抗之前使用酪氨酸激酶抑制剂，也可能引发不利于ICI治疗的菌群变化。

肿瘤免疫治疗 Kidney cancer Renal cell carcinoma microbiota Nivolumab Antibiotics

抗生素耐药细菌

Lancet子刊：由抗生素耐药性引起的死亡，真的那么严重吗？

抗生素耐药性问题对人类是一个严峻的挑战，基于模型评估的研究报告认为，抗生素耐药菌相关的死亡数已不容忽视。但《The Lancet Infectious Diseases》近期发表的一篇通讯文章对此提出了质疑，认为临床真实情况远没有那么严重，须在国家层面对相关临床数据进行记录，以合理地分析抗生素耐药菌感染和死亡情况。

抗生素耐药细菌抗生素耐药细菌死亡率 Diane Mathis Christophe Benoist

培养组学

联合使用培养组学和质谱方法鉴定致病菌

法国法赛的一家临床实验室近六年使用MOLDI-TOF方法鉴定致病菌，在培养组学的帮助下，取得了不少新的认识，引发了对传统意义科赫法则的思考。

培养组学 MALDI-TOF JoAnn E Manson JoAnn E Manson

培养组学

Nature Reviews：一文读懂用于人体菌群研究的培养组学（综述）

近年来培养组学的快速发展，使得可培养的人体细菌增加了几百种，拓展了人们对宿主-细菌关系的认知。Nature Reviews Microbiology近期发表综述，重点讨论了培养组学在人体菌群研究中的应用，值得专业人士关注。

培养组学人体菌群 Jeffrey M Friedman Jeffrey M Friedman

培养组学

培养组学在微生物研究中的重要作用（综述）

在宏基因组学迅速发展的今天，微生物培养仍具有不可替代的优势。Microbiome上的一篇综述文章详细介绍了培养组学的最新发展情况，以及在微生物研究中不可获取的重要性。

培养组学

肿瘤免疫治疗

Science：一文+一图读懂菌群在癌症免疫治疗中的作用（必读综述）

抗生素可削弱免疫检查点抑制剂的疗效，某些特定菌种的存在与免疫检查点抑制剂的疗效相关，这些重磅发现，将肿瘤免疫治疗和肠道菌群这两个火热的研究领域连接在了一起。Science上发表的这篇综述详细介绍了菌群在肿瘤免疫治疗中的作用，包括作为诊断工具及干预靶点，值得仔细读读。

肿瘤免疫治疗 Xiao Ding Qianqian Li Xiang Lu Faming Zhang

培养组学

SR：培养组学+测序，分析人肠道真菌

这是Scientific Reports[IF：4.259]发表的人体肠道真菌研究，值得专业人士特别关注。

培养组学宏基因组肠道真菌

免疫抑制剂

Science：抗PD-1抑制剂+肠道Akk菌↑，肿瘤生存期升84%！

免疫抑制剂抗肿瘤药物 AKK菌 PD-1 Wei Li

严重急性营养不良

FM：利用益生菌防治营养不良

利用益生菌能应对营养不良？这项研究给出了少许肯定答案。

严重急性营养不良宏基因组学菌群多样性益生菌粪菌移植

细菌

Nature Reviews：细菌如何促进癌症？（综述）

严格来说，这篇综述不是讲菌群与癌症，讲的是细菌与癌症。不过细菌终归是菌群一员，所以这样的综述也是大家应该必读一下的。

细菌宿主细胞肿瘤 Claire L McMurray Claire L McMurray

EJE：尿路菌群与膀胱癌之间有联系吗？

一篇关于尿路菌群与膀胱癌关系的小文章，推荐阅读。

尿路菌群

EJE：尿路菌群与膀胱癌之间有联系吗？

一篇关于尿路菌群与膀胱癌关系的小文章，推荐阅读。

尿路菌群膀胱癌 Adrian Giordani Christina Sadler

培养组学

Nature子刊：强大的培养组学，让可培养肠道微生物增加一倍！

培养肠道菌群中的特定物种，是这个领域研究非常重要的基础性技术工作，以前，很多人认为绝大多数微生物难以培养，但组学的进步和培养条件的摸索，让更多微生物得以培养。这个研究中，利用培养组学，至少被分离并培养一次的肠道物种增加了一倍。

培养组学肠道菌群无法培养的细菌 Emma Elison Emma Elison

海氏肠球菌

Immunity：两种帮助环磷酰胺抗癌的细菌被鉴定

海氏肠球菌 Barnesiella intestinihominis 环磷酰胺肿瘤免疫治疗抗癌药物

饮食

HMJ：饮食如何影响肠道菌群和营养紊乱性疾病（综述）

来自新杂志Human Microbiome Journal的新综述，对饮食和肠道菌群的关系做了一些重要总结，非常值得一看。

饮食肠道菌群 Nicholas J Talley Nicholas J Talley

沙特

SR：在沙特，狒狒和传统生活方式的人的菌群相似

不同的膳食结构对沙特人和狒狒的肠道菌群会有什么影响呢？可以看看这篇文章。

沙特狒狒发酵乳制品生活方式西式生活方式

多糖

多糖对肠道宏基因组研究中的DNA提取产生影响

① 粪便中存在的细菌产生的胞外多糖会对DNA提取及宏基因组研究产生影响； ② 本文研究对比通过10种不同DNA提取方法得到的肠道菌群组成的结果； ③ DNA提取方法影响门水平的相对丰度； ④ 提取DNA时是否降解多糖会显著影响最后的测序结果，建议在机械裂解粪便的同时降解多糖。

多糖 DNA提取宏基因组

肿瘤

Science：肠道脆弱拟杆菌，帮助抗CTLA-4抑制剂抗癌

这是2015年的发表在Science的重磅研究，在小鼠身上明确了脆弱拟杆菌在CTLA-4抑制剂发挥抗癌作用时的重要辅助作用。这是启发今天我们能够看到的在人身上的研究的重要文献，值得回顾阅读。

肿瘤癌症免疫治疗 CTLA-4 拟杆菌

蠕形螨

红斑痤疮病人与健康人的蠕形螨菌群

蠕形螨细菌红斑痤疮 Katerina Vlantis Manolis Pasparakis