Jun Chen

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文章数：11篇

功能性胃肠疾病

Nature子刊：功能性胃肠病相关的肠道菌群失调

小肠细菌过生长与功能性胃肠病有关。《Nature Communications》近期发表研究，发现功能性胃肠疾病患者的小肠菌群发生了改变，且低纤维、高糖饮食可能有助于病症恶化。该结果对于开发针对性菌群干预、饮食干预手段具有参考价值。

功能性胃肠疾病小肠菌群菌群失调 Jia Sun Li‐Long Pan

肠道丝氨酸蛋白酶扰乱肠道屏障功能并加剧IBS症状

《Gut》上发表的一项最新研究，在部分IBS患者中发现其粪便中的蛋白水解活性较高，而这部分患者的肠道屏障功能失调、肠道菌群多样性降低且症状更严重。进一步研究发现，引起上述效应的是肠道中的丝氨酸蛋白酶，且与肠道菌群密切相关。

IBS IBS 治疗靶点蛋白酶丝氨酸蛋白酶

菌群差异分析

分析成对、纵向样本菌群差异性的R语言程序包

人类肠道内的微生物环境对于人的健康具有重要的影响。《Bioinformatics》近期发表的文章介绍了一种基于UniFrac距离的差异性评估的新方法，可分析成对样品、同一个体不同时间段样品中的菌群差异，有助于减小宿主个体差异对菌群相关研究的影响。

菌群差异分析方法学 Ping Lan Jingrong Weng Yichen Li

艰难梭菌感染

Science子刊：肠道菌群失调促艰难梭菌感染的新机制

Science Translational Medicine上发表的一项最新研究，发现在腹泻患者中，肠道菌群失调可增加肠道中的游离氨基酸（特别是脯氨酸），艰难梭菌可利用这些氨基酸作为能量来源，从而促进艰难梭菌感染。另外，在一项对腹泻患者的回顾性队列研究中，鉴定出一些临床风险因素（抗生素、住院、免疫抑制、先前的CDI），可预测肠道菌群失调及更高的CDI易感性。

艰难梭菌感染艰难梭菌感染脯氨酸氨基酸 Peng Zheng

梅奥学报：肠道菌群可影响减肥

同样的减肥方法，为什么对有些人有效，对另一些人无效？Mayo Clinic Proceedings发表的一项最新研究表明，肠道菌群中特定细菌的丰度以及菌群代谢碳水化合物的能力，可能是影响减肥效果的重要原因。虽然仍需更大规模的试验来验证，但这些发现提示，个性化减肥应考虑菌群因素。

减肥肠道菌群功能肠道菌群组成减肥干预 Lisa Ronan

非甾体抗炎药引起肠道屏障及菌群变化，男女有别

FASEB Journal上发表的一项最新研究，发现健康女性与健康男性的肠道屏障通透性及肠道菌群多样性存在差异，在服用非甾体抗炎药——吲哚美辛后，男女之间的菌群变化也存在差异。

性别差异非甾体抗炎药肠道屏障功能 gender indomethacin

Bioinformatics：检测人体菌群中介效应的新方法

环境、菌群与健康和疾病间有复杂的互作关联，如何确定菌群的中介效应是一个需要解决的关键问题。Bioinformatics[IF：7.307]近期发表的华人研究，针对这一问题，提出了一种新的统计学方法，并在现有的数据中进行应用，表明饮食纤维摄入和BMI间的关联是由肠道菌群所介导，这一方法或可用于病因学和临床研究。

中介效应距离度量 Mark Fox Mark Fox

生物有机肥

福建农林团队：太子参要丰收，根围菌群要给力

前面，我们分享过了西洋参如何影响人的菌群（http://mc.gutgutgut.cn/papers/read/1079323400），这篇文章，我们来看看太子参，不过是看看太子参的根围菌群，看看植物相关菌群如何影响太子参的产量。

生物有机肥太子参根围细菌群落 Petra Louis Harry James Flint

多发性硬化

SR：多发性硬化患者的肠道菌群有什么特别？

① 多发性硬化（MS）是一种受遗传和环境因素影响的免疫疾病；② 肠道菌群在MS发病中可能起重要作用；③ 比较31名MS患者与36名健康人的肠道菌群；④ 枝动杆菌属、嗜血杆菌属等5个属的细菌丰度在MS患者中显著增加，普氏菌属等3个属的细菌显著减少。

多发性硬化肠道菌群 Edward C Deehan Jens Walter

微生物组数据

GM：更好的测试菌群、健康和疾病相关的测试方法

新的多元测试方法——aMiSPU，转数据分析师重点看看。

微生物组数据自适应关联测试

微生物丰度

AJHG：检验微生物组丰度的新方法MiRKAT

① 高通量测序技术为揭示人体微生物组在疾病机理中的作用提供基于群体的研究可能；② 本文构建了一种新的方法MiRKAT，一种半参数核回归框架，可以将研究结果很好地回归对应到微生物组丰度上；③ 它使用方差分量打分统计方法来检验基于P值分析的关联；④ 这种方法在文中的案例应用中显示出较好的效果。

MiRKAT 微生物丰度丰度方法学 Yvonne J Huang