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Ruixin Zhu
文章数:11篇
单核苷酸变异
朱立新/刘占举/朱瑞新/焦娜等:肠菌单核苷酸变异助力大肠癌早期无创筛查
结直肠癌是全球第三大恶性肿瘤,影像学检查、内镜检查、粪便隐血检测以及液体活检等是常见的筛查策略。然而,目前这些方法仍存在假阳性高、敏感性低等问题,亟需开发准确度和敏感性更高的早筛标志物。近日,中山大学朱立新、同济大学附属第十人民医院刘占举和朱瑞新、浙江大学焦娜及团队在Gut Microbes发表最新研究,整合了多队列全宏基因组测序数据,并系统评估了多模态微生物标志物对于结直肠腺瘤的诊断效能,最终揭示了微生物单核苷酸变异作为疾病诊断标志物的潜力巨大,值得关注。
单核苷酸变异
早期诊断
研究论文
基础研究
肠道菌群
疾病诊断
朱立新+刘占举+朱瑞新等:基于肠菌基因的炎症性肠病AI诊断模型
炎症性肠病与肠道菌群关系非常密切,可作为一种有前途的非侵入性诊断工具。近日,同济大学朱瑞新、中山大学六院朱立新、上海市第十人民医院刘占举、中山大学附属第六医院贺青及团队在Gut Microbes发表最新研究,整合了来源于多中心的CD和健康对照共1418例样本的粪便微生物测序数据,全面描绘了CD患者中微生物多维度特征的变化模式,利用AI构建了微生物多维度诊断模型,评估了各个维度特征诊断潜能的优劣,以鉴定最优诊断模型,并验证其疾病特异性,值得关注。
疾病诊断
人工智能
研究论文
基础研究
微生物物种
多组学
刘占举+郭天南+朱瑞新Cell子刊:多组学破译克罗恩病中宿主与肠道菌群互作的空间特征
宿主-菌群互作失调在克罗恩病 (CD) 肠炎的发生发展中起着关键作用,然而肠道及其附属组织的空间分布和相互作用网络尚不清楚。近日,同济大学刘占举、朱瑞新团队联合西湖大学郭天南在Cell Reports Medicine发表文章,通过对克罗恩病患者的肠道及其附属组织的整合多组学分析,揭示了宿主蛋白和肠道菌群的空间特征及其相互作用,为CD发病机制以及基于蛋白和微生物的潜在诊断标志物提供了新见解。
多组学
炎症性肠病
肠道菌群
蛋白质组学
克罗恩病
因果推理
朱瑞新+朱立新等iMeta: 靶向基石菌种可恢复NASH中失调的产丁酸菌
产丁酸菌的生态失调是非酒精性脂肪性肝病(NAFLD)发展的关键因素之一。同济大学朱瑞新团队和中山大学六院朱立新团队与合作者近期在iMeta发表研究,收集了来自纽约的22名非酒精性脂肪性肝炎(NASH)患者、25名肥胖患者和16名健康个体的粪便样本,进行16S rRNA基因测序,并基于因果推理理论和动态干预模拟(DIS)建立了一种疾病关键菌种识别算法。该研究发现多个关键菌种可有效地使NAFLD的菌群组成向正常肠道菌群恢复,提示了一种新的潜在的NAFLD微生物治疗方法。
因果推理
动态干预模拟
肠道菌群
关键物种
非酒精性脂肪肝病(NAFLD)
冠心病
李后开+朱瑞新等:冠心病患者肠菌与机体代谢有何特征?
先前研究表明,肠道菌群失调与冠心病间存在密切的关系,但目前关于临床稳定性冠心病心绞痛患者(SCAD)的肠道菌群与机体代谢特征尚不完全清楚。近日,上海中医药大学李后开、同济大学朱瑞新、上海中医药大学张卫东、北京中医药大学附属东直门医院沈晓旭及团队在Microbiology Spectrum发表最新研究,纳入42名稳定性冠心病心绞痛患者(SCAD)和46名健康人,发现患者肠菌α多样性显著降低,29个物种丰度显著改变。此外,患者肠道中富集的Ralstonia Pickettii可能是其体内不饱和脂肪酸降低的重要原因。总之,该研究为探究SCAD形成的机制提供了新证据,值得关注。
冠心病
肠道菌群
研究论文
基础研究
菌群代谢功能
结直肠癌
朱瑞新+朱立新等Nature子刊:基于多界微生物的大肠癌跨队列诊断模型
Nature Microbiology最新发表了上海交通大学医学院王慧、同济大学朱瑞新、中科院上海营养与健康研究所张国庆、复旦大学陈兴栋、中山大学附属第六医院朱立新作为共同通讯作者的研究论文,通过对结直肠癌(CRC)大样本宏基因组数据集进行综合分析,揭示了与CRC相关的4界肠道微生物(细菌、真菌、古菌、病毒)各自的变化和彼此的互作,并建立了基于多界微生物和宏基因组功能标志物的CRC诊断模型。这些发现对于基于肠道微生物组的CRC筛查诊断,以及进一步研究相关机制、寻找治疗靶点,具有重要参考价值。
结直肠癌
肠道微生物组
诊断模型
丁酸
刘占举+李明松:丁酸抑制中性粒细胞功能,改善肠炎
上海市第十人民医院刘占举、广州医科大学附属第三医院李明松与团队,近期在Gut Microbes发表研究,报道了菌群代谢产物丁酸对炎症性肠病(IBD)患者的中性粒细胞的免疫调节作用,以及对结肠炎模型小鼠的保护性作用,并揭示了相关生物学机制,为治疗IBD提供了新见解。
丁酸
中性粒细胞
免疫调节
炎症性肠病
结直肠癌
朱瑞新等:结直肠腺瘤及结直肠癌的菌群标志物
同济大学朱瑞新和田川、上海交大医学院刘宁宁、中山大学附属第六医院朱立新与研究团队,近期在Nature Communication上发表研究,对4项研究(共1056例受试者的粪便菌群数据)进行总结,鉴定出了可区分结直肠腺瘤与健康对照、结直肠腺瘤与结直肠癌的菌群标志物,或有助于结直肠癌的早期诊断。
结直肠癌
诊断标志物
研究论文
队列研究
新冠肺炎
Lancet子刊:国内团队报道新冠患者的胃肠道后遗症
中山大学附属第六医院兰平与研究团队近期在Lancet Gastroenterology & Hepatology发表文章,报道了新冠患者出院后3个月的胃肠道后遗症及其相关临床因素。
新冠肺炎
后遗症
胃肠道症状
非酒精性脂肪肝
同济大学等:NAFLD中肝脏胆汁酸信号通路受损
胆汁酸通过法尼醇X受体(FXR)等信号通路,调控糖脂代谢和肝脏等组织的炎症状态,可能参与非酒精性脂肪肝(NAFLD)等疾病进程。Gut近期发表了同济大学与纽约州立大学布法罗分校团队合作的研究,表明NAFLD患者的菌群改变,血液胆汁酸增多、初级和次级胆汁酸比例改变,肝脏中FXR和FGF4介导的胆汁酸相关信号通路受损。这些发现提示FXR信号通路中的组分,包括将初级胆汁酸转化为次级胆汁酸的肠道菌,都是潜在的NAFLD治疗靶点。
非酒精性脂肪肝
胆汁酸
FXR信号通路
人体
小鼠
肥胖
同济大学等:胖瘦鼠肠道菌群荟萃分析
Physiological Genomics发表的由同济大学团队主导的研究,纳入9项啮齿动物研究的原始数据,分析饮食诱导的肥胖与菌群组成和功能变化的关联,值得专业人士关注。
肥胖
Gut microbiota
high-fat diet
META-ANALYSIS
Obesity