蛋白质组

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文章数：11篇

Nature：采样胶囊助力人类肠道多组学分析

目前对于肠道的微生物组、蛋白质组和代谢组的研究，基本依赖于分析粪便样本。然而，粪便样本不能反映肠道不同区域的内容物差异，人们对于肠道中的微生物分布、其所处内环境和生化活动仍所知有限。Nature最新发表的重磅研究，开发了可在正常生理状态下从受试者的特定肠段取样的可吞咽胶囊设备，并通过多组学分析鉴定出菌群结构、噬菌体诱导、抗生素抗性基因和胆汁酸谱等沿肠道变化的情况，揭示了肠道样本与粪便样本间存在的显著差异，为进一步研究肠道微生物组和代谢组在人类生理和疾病中的作用提供了有力工具。

采样方法多组学肠道菌群代谢组蛋白质组

Cell子刊：膳食组成对肝脏蛋白质组有很大的影响

近期发表于Cell Metabolism的一项动物研究成果，通过设计宏量营养素5种水平（蛋白质：碳水化合物：脂肪各占比为10:70:20，14:57:29，19:63:18，33:20:47 或55:25:20）和2个能量水平，配制10种试验饲料，在这10种饮食基础上添加二甲双胍，雷帕霉素或白藜芦醇（它们被认为是热量限制模拟物），最终有40种饮食和药物干预方法用于喂养小鼠，结果表明不同饮食对肝脏蛋白质组有明显的影响，不仅对代谢途径，而且对线粒体功能和RNA剪接等基本过程都有影响。其实关于能量及三大宏量营养素的最佳供给量和比例在许多研究都有探讨，对健康或疾病状态下所得出的最佳推荐可能存在不同，目前我国通常推荐正常成人摄入碳水化合物占总供能比50～60%，蛋白质10～15%，脂肪25～30%。

营养 Nutrition geometric framework macronutrients Proteome

炎症性肠病(IBD)

IBD患者的表型和基因型对血浆蛋白质组有什么影响？

Journal of Crohn's and Colitis发表的研究，分析了IBD表型、基因型与血浆蛋白质组的关系。研究结果表明，在一大批IBD患者中，基因型和人类血浆蛋白质组之间存在着复杂而丰富的相互作用，与人口统计学和临床特征密切相关。本研究强调了基因型、表型和循环蛋白之间的密切关联，或可有助于改善IBD疾病的防治。

炎症性肠病(IBD) 基因型蛋白质组

肠道菌群对下丘脑神经肽和蛋白的影响

Analytical Chemistry近期发表的一项研究，采用整合无标记和基于DiLeu的定量方法，对比了无菌和有菌小鼠下丘脑的神经肽组和蛋白质组的差异，表明肠道菌群或通过影响这些神经肽和蛋白来参与对宿主行为和认知功能的调控。

肠-脑轴 Gut microbiota Hypothalamus Neuropeptidomics proteomics

Cell子刊：衰老和饮食限制或影响肠上皮细胞的蛋白质组

小肠负责营养物质的吸收，是环境和身体最重要的交互界面之一。衰老过程中，上皮细胞的变化导致食物吸收障碍和屏障功能降低，增加疾病风险，但这些变化的驱动因素尚不清楚。《Cell Reports》发表的文章，对不同年龄小鼠的不同区域的小肠隐窝进行蛋白质组研究，描绘出小肠区域性和年龄依赖性蛋白质组变化的图谱。同时揭示出老化的小鼠对饮食改变缺乏适应性，而饮食限制后再进食有助于部分恢复隐窝细胞组成，并且肠干细胞的酮体代谢与分化命运存在联系。

衰老饮食限制 aging dietary restriction Hmgcs2

多组学分析结直肠癌特异性外泌体成分

外泌体是自然分泌的由生化分子（包括RNA、代谢产物、脂质和蛋白质等）组成的纳米囊泡，可作为诊断工具和疾病特异性报告。组学技术近年来较为流行，并常用来发现并鉴定外泌体成分。最新发表在Cancer Letters的一项研究，利用组学技术建立了一个系统方法，可同时分析在结直肠癌中发生改变的代谢产物、脂类和蛋白质。该研究发现，与健康对照相比，在结直肠癌中，不饱和脂肪酸合成、苯丙氨酸-酪氨酸-色氨酸合成、氨酰tRNA合成途径发生显著改变。该研究有助于发现低丰度特征成分，并解释结直肠癌的分子基础。

结直肠癌 exosome proteomics metabolomics MiRNA

国家蛋白质科学中心+解放军总医院：人胃不同区域的粘膜蛋白质组

来自国家蛋白质科学中心团队和解放军总医院团队的研究，近期在Nature Communications发表。该研究绘制了生理状态下人胃不同区域的粘膜蛋白质组参考图谱，并分析了晚期胃癌患者的癌组织和癌旁组织的蛋白质组异常，发现癌旁组织的异常蛋白类型反映了更多疾病相关信息。

胃粘膜蛋白质组胃癌癌旁组织 Andrea C Masi

在肠道菌群中发现自由基依赖性酶的新方法

自由基依赖性酶是肠道菌群适应低氧环境的重要活性蛋白，但研究难度较大。本文以甘氨酰基酶的发现和鉴定为例，总结了可用于发现新自由基依赖型酶的三种研究策略，这些策略中涉及基因组测序、宏基因组分析、蛋白质组分析和传统化学基团鉴定方法的联用，对研究肠道菌群的代谢特点具有参考价值。

方法学自由基依赖型酶宏基因组测序基因组测序蛋白质组

小儿炎症性肠病

Nature子刊：小儿IBD中人体和菌群的蛋白质组特征

Nature Communications上线的最新研究，分析了小儿炎症性肠病（IBD）中，肠道粘膜和肠腔交界抽出物样本中的人体和菌群的蛋白质组，表明肠道的胞外囊泡蛋白质组变化与IBD中宿主-菌群的异常互作相关。

小儿炎症性肠病蛋白质组胞外囊泡肠道菌群普氏栖粪杆菌

高强度间歇训练

Cell子刊：不同运动训练模式下，人体通过增强蛋白质翻译以提高代谢和身体适性

本文与菌群不直接相关，但对不同运动模式对代谢的改善做了充分介绍，值得一读。

高强度间歇训练线粒体运动适应蛋白质组抗阻训练

SR：克罗恩病 vs 肠结核，11种蛋白表达不同

①区分肠结核和克罗恩病较困难，需要更好的生物标记物。 ②文章中利用iTRAQ实验，分析了未接受治疗的肠结核、克罗恩病患者的结肠活组织切片中的蛋白质组。 ③5组iTRAQ实验的结果中，有11种蛋白在肠结核与克罗恩病患者结肠粘膜处有着不同的表达，且在不只一组iTRAQ实验中被发现。

克罗恩病肠结核结肠粘膜蛋白质组