Alain Stintzi

抗性淀粉是不被健康人体小肠所吸收的淀粉及其降解物的总称，过往研究发现其具有改善肠道菌群等有益作用。近期发表于American Journal of Clinical Nutrition的一篇系统综述表明在健康受试者和有潜在疾病的受试者中，抗性淀粉补充的耐受良好，此外，在大多数研究中人体补充抗性淀粉后短链脂肪酸生成增加。

小檗碱

小檗碱及其结构类似物对肠道菌群功能的影响

小檗碱 gut microbiome Functionality Butyrate Akkermansia

药物-菌群互作

快速测定个体肠道菌群药物反应的新方法

很多口服药物都可以影响肠道菌群的组成和功能，《Microbiome》发表的一项研究介绍了一种称为RapidAIM的体外检测方法，可测定药物对人体肠道菌群的组成和功能的影响。

药物-菌群互作 gut microbiome Drug response In vitro culturing Metaproteomics

多组学研究

多组学策略推进微生物组的功能和转化研究（综述）

现有研究发现药物（如糖尿病药物二甲双胍）可通过肠道菌群产生对个人不同的影响。Microbiome的这篇综述回顾了现有的研究微生物组功能的多组学技术和多组学整合研究策略，并讨论了如何将多组学整合研究策略和微生物离体筛查技术运用到人类疾病的精准用药领域。

多组学研究微生物功能性 Drug-microbiome interactions Host-microbiome interactions meta-omics

肠道菌群体外培养

Nature子刊：可用于高通量菌群靶向药物筛选的体外模型

肠道菌群的体外培养，对于微生物组的转化研究有重要意义。Nature Communications近期发表的一项研究，建立了一种高通量的肠道菌群体外培养模型MiPro，能较好的维持菌群的组成和功能稳定性。结合宏蛋白质组学检测技术，MiPro可作为高通量筛选平台，用于肠道菌群靶向药物的筛选与评价。

肠道菌群体外培养高通量筛选平台药物-菌群互作宏蛋白质组学 Jiang-Ning Hu

小儿炎症性肠病

Nature子刊：小儿IBD中人体和菌群的蛋白质组特征

Nature Communications上线的最新研究，分析了小儿炎症性肠病（IBD）中，肠道粘膜和肠腔交界抽出物样本中的人体和菌群的蛋白质组，表明肠道的胞外囊泡蛋白质组变化与IBD中宿主-菌群的异常互作相关。

小儿炎症性肠病蛋白质组胞外囊泡肠道菌群普氏栖粪杆菌

抗生素

母体肠道菌群可影响后代的菌群和免疫

Microbiome近期发表一项研究，表明孕期和哺乳期口服抗生素改变母体肠道菌群，可能通过产道菌群和母乳等途径，影响后代的肠道菌群和免疫。

抗生素孕期哺乳期肠道菌群免疫

蛋白组学

AJG：蛋白组学鉴定儿童IBD相关生物标志物

儿童IBD缺乏有效的诊断及疾病进展标志物。这项研究利用蛋白组学技术，鉴定出了一些特定的蛋白质组合，或可用于儿童IBD的诊断，以及评估儿童溃疡性结肠炎的疾病进展。

蛋白组学炎症性肠病生物标志物溃疡性结肠炎全结肠炎

宏蛋白组学

Microbiome：全自动宏蛋白组数据分析平台MetaLab

这是一项重要的方法学研究，研究者开发了直接利用质谱原始数据快速进行微生物蛋白质鉴定和分类分析的全自动分析软件，多位中国年轻学者在美国参与研究和软件开发，他们未来的研究成果值得长期持续跟踪。

宏蛋白组学 Inés Martínez Jens Walter

肠道菌群体外培养

JPR：体外培养肠道菌群，需注意培养基成分

Journal of Proteome Research[IF：4.268]发表的这篇文章关注培养肠道菌群时，不同的培养基成分会对细菌的组成和功能产生显著影响。这是很有启发意义的文章，特别推荐。

肠道菌群体外培养培养基正交实验设计蛋白质组学 Ken Cadwell

肠道菌群

体外培养需要注意培养基成分

① 文章采用了正交实验设计与蛋白组学分析的方法；② 蛋白组学分析对不同培养基成分，如无机盐、胆汁盐、粘蛋白以及短链脂肪酸的应答不同；③ 多因素方差分析显示无机盐、胆汁酸以及粘蛋白对不同功能性肠道菌群蛋白组有显著的主要和相互作用；④ 培养基成分对基础代谢通路有广泛的调节作用；同时，不同的培养基成分对细胞壁、细胞膜以及包膜的生物合成，细胞功能性迁移也有调节作用；尤其是鞭毛合成相关蛋白对黏蛋白的存在有显著回应。

肠道菌群肠道菌群体外培养培养基正交实验设计蛋白质组学

克罗恩病

Nature子刊：肠道菌群与宿主线粒体互作，影响克罗恩病

最近关于IBD的文献非常多，作为对肠道健康有重大威胁的疾病，随着发病率不断上升，也随着肠道菌群等相关研究的进展，人们对此也是越来越关注，最近NC上这篇文献，特别推荐给大家。

克罗恩病线粒体硫化氢 chronic inflammation CROHN'S DISEASE

宏蛋白组学

Microbiome：新的宏蛋白质组学定量定性分析工具

相比于宏基因组学研究，宏蛋白组学研究能更好解读肠道菌群的生物活性，那么有什么靠谱的分析工具呢？本文推荐一读。

宏蛋白组学肠道菌群定性定量分析 Shahla Abdollahi-Roodsaz

炎性肠病

Gut：蛋白组学，区分儿童克罗恩病和溃疡性结肠炎？

采用蛋白组学和多元统计分析进行CD和UC的生物标志物识别，转需。

炎性肠病克罗恩症溃疡性结肠炎蛋白组生物标记物

结肠炎

Science：炎症毁菌，菌增炎症，终而癌也！

① 炎症反应改变结肠炎易感的IL-10敲除小鼠的肠道菌群组成；② 在AOM（致癌物偶氮甲烷）处理的IL-10敲除小鼠体内定植大肠杆菌NC101促进侵袭性癌的发生；③ 除炎症外，结肠炎相关结直肠癌的发生还需细菌特异性因子pks（聚酮合成酶），敲除NC101的pks导致肿瘤侵袭性降低，但不影响肠道炎症反应；④ 粘膜相关psk阳性大肠杆菌在炎症性肠炎及CRC中比例明显升高；⑤ 小鼠中，结肠炎通过改变微生物组成和诱导具有遗传毒性的微生物扩张来促进肿瘤的发生。

结肠炎结肠直肠癌聚酮合成酶 Francesco Strati Carlotta De Filippo