Falk Hildebrand

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Falk Hildebrand

文章数：13篇

Cell 子刊：细菌传播策略如何影响人肠道菌的维持和进化？

人肠菌群之间不断地相互作用，并与我们的身体相互作用，进而影响我们的健康、免疫系统等，但人体肠道菌群是如何维持的呢？Cell Host and Microbe近期发表的文章，利用粪便样本宏基因组数据，研究了细菌持久性策略。结果发现人类肠道细菌有三种主要的传播策略：遗传持续性、空间持续性和顽强性传播策略（heredipersistent，spatiopersistent，and tenacious）。本研究结果有助于增加对不同的传播策略如何影响人类肠道微生物的长期持续，并对肠道菌群调节产生影响的认识。

传播策略肠道菌群

Cell子刊：帕金森病患者的肠道菌群代谢功能有何变化？

Cell Reports近期发表研究，研究了帕金森病患者的肠道菌群组成和功能变化，及其与疾病程度、胃肠症状等的关系，为揭示肠道菌群在帕金森病中的作用带来新启示。

帕金森病肠道菌群肠-脑轴代谢功能

肠-肝-免疫轴

巨噬细胞通过影响肠道通透性及菌群组成促进胆汁淤积性肝病

许多研究表明，胆汁淤积性肝病与肠道菌群组成的变化相关。来自Hepatology上发表的一项最新研究，揭示了肠道菌群参与胆汁淤积性肝病的发生发展的机制：巨噬细胞中NLRP3炎性小体的活化可促进肠道通透性增加，并改变肠道菌群组成，从而增强了肠道菌群及内毒素向肝脏的流动，内毒素可增强胆汁酸诱导的肝细胞死亡，以介导胆汁淤积引发的肝脏损伤。

肠-肝-免疫轴肠道通透性巨噬细胞菌群-免疫互作肠-肝轴

抗生素干预

Gut：抗生素诱导产生的肠道单优势菌

抗生素的使用会导致肠道菌群剧烈的变化，但也为发现一些低丰度细菌提供了可能。本研究发现了使用头孢霉素后显著增殖、获得定殖优势的新菌种，阐释了抗生素使用后对肠道菌群的负面影响，以及停药后菌群恢复特征，对于研究肠道菌群变化、抗生素副作用等具有参考价值。

抗生素干预 antibiotics bacterial overgrowth INTESTINAL MICROBIOLOGY molecular genetics

生物信息学工具

Nature子刊：带你玩转人微生物组和代谢组数据

本文介绍了一个曾被用于揭示肠道菌群在宿主胰岛素抵抗的背景下如何影响循环系统代谢物的数据挖掘方法。对应研究可参考此前日报中的报道：两种肠道细菌改变血清代谢组，增加糖尿病风险（http://www.mr-gut.cn/papers/read/1095814020）。

生物信息学工具微生物组代谢组血液代谢组学 Ⅱ型糖尿病

IBD患者的芽囊原虫携带率较低

在人体肠道菌群的研究中，常常忽略了对单细胞真核生物（例如芽囊原虫）的关注。来自Gut上发表的一项最新研究发现，IBD患者中芽囊原虫的携带率较低，而芽囊原虫亚型与肠道菌群的组成有着显著关联。研究结果提示，芽囊原虫的携带及其亚型可能与人体健康相关，在粪菌移植时或应关注其影响。

寄生虫炎症性肠病寄生虫芽囊原虫 Gustavo Mostoslavsky

Nature：土壤菌群特点或影响全球物质循环

土壤菌群的高度多样性在全球物质循环中具有重要作用。本研究通过分析全球189个位点、7560余份土壤样本中的物种和功能基因多样性，发现环境因子和细菌-真菌的相互作用影响全球土壤菌群的丰度、结构和功能，或可为全球物质循环的区域性特点提供解释，值得专业人士关注。

土壤菌群菌群分布模式细菌-真菌拮抗作用 Pilar Guallar-Castillón Ruth Blanco-Rojo

Nature子刊：利用“肠型”对肠道菌群进行分类

这是Nature Microbiology发表的重要文献，包括王俊、赵立平等两位中国科学家在内的29位菌群研究领域的重量级科学家，针对“肠型”这个概念进行了新的探讨，以求推动对这个重要概念的统一认识并将其推到实践。新方案是综合之前多种分型方案之长但充分考虑菌群功能、生态学及临床需求的在线方法。具体方法值得专业人士去深挖，我们仅简要介绍。特别推荐！

肠型 Trevor Beaudoin Charles M Deber

MSB：人体肠道菌群中的亚种

这是 Molecular Systems Biology[IF：9.750]发表的针对2144个人体粪便宏基因组、676个人体口腔样本的大规模物种分析，特别是分析了亚种的数量和功能，巨量数据研究，都值得好好看看。

亚种 genetic variation metagenomics Microbiome Population structure

血清代谢组学

Nature：两种肠道细菌改变血清代谢组，增加糖尿病风险

最新online的nature，关注肠道菌群如何影响血清代谢组、胰岛素抵抗、代谢和心血管疾病，值得一读。

血清代谢组学胰岛素抵抗支链氨基酸转运蛋白葡萄糖不耐受

物种-功能关系

Nature微生物学：菌群结构不同，生态学功能各异

关于菌群中物种与其功能间关系的Nature Microbiology杂志最新文章。

物种-功能关系生态学特性细菌生存策略代谢一致性厚壁菌

粪菌移植(FMT)

Science：粪菌移植菌能和原有菌和平共处么？

① 代谢综合征患者分为移植健康供体粪菌组、移植自身粪菌组，以健康人为对照；② 宏基因组测序对移植后的粪菌分析，与安慰剂组和健康个体相比，异体移植者物种组成改变较大，且持续3个月以上；③ 使用单核苷酸变异分析来追踪特定菌株，发现异体移植菌株水平上差异更大；④ 供体和受体的同种菌株相比于供体特异菌种，更容易在受体内共存；⑤ 不同受体、相同的供体表现出的治疗效果不一，可能与供体的的兼容性及受体的微生物组成及疾病状态相关；

粪菌移植(FMT) 供体菌株受体菌株共生宏基因组学

Nature：二甲双胍对糖尿病人的肠道菌群到底有何影响？

去年Nature上的重量级研究，证实二甲双胍通过微生物调节而产生的药效是通过产生短链脂肪酸，并增加埃希氏杆菌达成的。强烈推荐重温经典。

二甲双胍二型糖尿病短链脂肪酸埃希氏杆菌 Grace Hewon Shin