发育

许多研究强调了早期肠道微生物群的重要性及其在调节神经发育和行为中的作用。流行病学研究表明，早期接触抗生素会增加个体患免疫和代谢疾病的风险。此外，临床前研究表明，长期使用抗生素诱导的早期菌群破坏可能对生理、大脑功能和行为产生持久影响。Brain Behavior and Immunity近期发表的文章，在小鼠产后（P2-9）、断奶前（P12-18）或断奶后（P21-27），使用广谱抗生素混合物（氨苄青霉素、庆大霉素、万古霉素和亚胺培南），评估关键发育节点的菌群破坏对小鼠后期生理和行为的影响。

生命早期菌群早期抗生素暴露关键节点发育行为

发育

摄食-胃肠激素-甲状腺形态发生

发育中的动物通过胎盘或从摄入的食物中吸收营养；然而，胚胎利用外部营养物质进行个体器官形态发生的机制仍有待阐明。Current Biology近期发表的文章，发现非洲爪蟾蝌蚪摄取食物后，上调胃肠激素，进而调控甲状腺滤泡的形成，同时这种胃肠激素依赖性的甲状腺形态发生在小鼠中也存在，在哺乳动物中具有保守性。

发育甲状腺胃肠激素

宿主-菌群互作

Cell子刊：菌群定植如何影响斑马鱼肠道细胞的基因表达？

肠道菌群的代谢物可直接影响动物宿主的生长、分化和发育，但目前对菌群诱导的细胞特异性反应缺乏系统性的了解。Cell Reports近期发表的文章，通过对常规和无菌条件下饲养的斑马鱼幼虫肠道和相关组织的细胞转录组进行分析，提供了发育中鱼肠道中肠道细胞组成的高分辨率图谱，并详细说明微生物组对每种细胞类型的影响。

宿主-菌群互作斑马鱼肠道菌群发育

环境性肠功能障碍

Nature子刊：环境性肠功能障碍可致恒河猴幼崽发育迟缓

环境性肠功能障碍（EED）与营养不良、婴儿生长发育迟缓有关，通常表现为绒毛变钝、隐窝与绒毛比率降低以及小肠炎症。近日发表在Nature Communications上的文章，利用群居恒河猴作为模型研究自然获得的人类肠道疾病EED，发现恒河猴在早期暴露于肠道病原体并在幼崽期获得EED表型。恒河猴模型不仅可以确定胃肠道各个隔室的肠道损伤程度，还可以确定组织学异常的程度与婴儿生长发育迟缓的潜在关联。这项工作提供了对EED潜在机制的深入了解，并表明大肠在EED中的重要性并可作为治疗干预EED的靶标。

环境性肠功能障碍发育大肠

肠道内稳态

国内团队：HP1c抑制Notch信号调节发育和肠道内稳态

Notch信号和表观遗传因子在大多数多细胞生物的组织内稳态调节中起着关键作用，但两者如何协调来控制分化仍不清楚。来自清华大学的倪建泉、李梢和同济大学的孙方霖合作在EMBO Reports上发表文章，鉴定出异染色质蛋白1c（HP1c）是果蝇肠道内稳态的一个重要表观遗传调节因子，且通过抑制Notch信号来调控正常发育和肠道内稳态。

肠道内稳态 Notch信号通路果蝇发育

肠道生态位发育

Cell子刊：绘制人类肠道生态位发育的转录图谱

人类肠道干细胞生态位支持上皮细胞的自我更新和功能，但其自身的发育知之甚少。Cell Stem Cell近期发表的文章，利用scRNA-seq和原位验证的方法对受孕后7-21周的人类肠道发育进行研究，表征发育中的人类肠道干细胞生态位中细胞多样性。同时转录组和空间图谱显示，NRG1表达于表皮下间充质细胞中，NRG1而不是EGF促进分泌系细胞的分化，从而增加细胞多样性。研究强调了肠道中EGF/ERBB信号的复杂性，描绘了发育中肠道关键生态位的细胞和信号。

肠道生态位发育 scRNA-seq 发育 NRG1

肠上皮细胞

Science子刊：LSD或调控肠上皮的新生/修复

Science Advances近期发表的文章，揭示出新生儿肠道发育的一个重要调节因子LSD1，并确定其可作为药物靶点，重编程肠上皮细胞，加速肠损伤修复过程。

肠上皮细胞发育修复 LSD1

发育

Nature：肠道中的膳食锌感受器，促进果蝇进食和生长

锌是生物体所需的金属元素，Nature发表的一项最新研究，在果蝇中鉴定出一种表达在肠细胞中的锌感受器，通过调控进食和胰岛素样信号，来促进果蝇幼虫生长。这些发现为金属元素等微量营养元素调控宿主生长发育，提供了一种新机制。

发育进食 developmental biology Drosophila feeding behaviour

儿童行为

儿童的行为和社会经济风险，与肠道微生物组的组成和功能存在关联

儿童行为和心理发育受到多种因素的影响，mBio上发表的一项研究表明，学龄初期儿童的行为问题和社会经济风险与肠道菌群的物种和功能的组成，都存在显著关联，而这种关联性受到看亲子关系以及父母压力等父母相关因素的影响。

儿童行为 behavior childhood development metagenomics

肠道免疫

Cell子刊：肠道免疫系统的成熟发生在胎儿发育早期

Developmental Cell上发表的一项最新研究，利用CyTOF技术，对比分析16周龄、23周龄的胎儿及出生后婴儿的肠道免疫细胞谱，发现在孕期16周龄时，BCR库及TCR库已存在，且多样性随着孕期增长而增加，提示在孕中期的早期阶段（14-20周龄），复杂的肠道免疫系统发育已开始。

肠道免疫 BCR CyTOF TCR TRM T cells

肠道干细胞

Cell子刊：果蝇幼虫感染后的肠道修复及发育机制

Cell Host and Microbe上发表的一项最新研究，发现果蝇幼虫在感染后，将利用成虫中肠前体细胞（AMP）进行肠道修复。AMP并非专职于修复肠道的肠道干细胞，其最大作用是最终分化为果蝇成虫中肠的上皮细胞，对果蝇发育是必需的，因此AMP的短暂减少将延缓果蝇幼虫的发育。而发育的延缓确保了AMP的恢复及随后果蝇幼虫的正常变态发育。

肠道干细胞动物实验成虫中肠前体细胞发育 JAK-STAT信号通路

肠-脑轴

青春期补充益生菌改善LPS引起的小鼠免疫反应和行为问题

青春期是身体和大脑关键的发育期，肠道菌群在这一时期的作用尚缺乏研究。《Brain Behavior and Immunity》近期发表的一项研究显示，给小鼠在青春期补充益生菌，或能通过改变肠道菌群组成、减少急性炎症反应、阻断应激诱导的大脑内TLR4表达增加，来防止青春期LPS暴露引起的小鼠行为异常，且该作用具有性别特异性。

肠-脑轴 Adolescence Cytokines development gut-brain axis

营养模式

足月健康新生儿，如何喂养才最好？（综述）

目前的研究认为，对于早产、出生体重的新生儿，需要在生命早期进行一定的营养干预，对孩子未来的长期发展具有很重要的作用。然而，对于健康足月产的新生儿，是否也有必要进行饮食干预呢？本综述通过大量的文献检索和归纳，发现除了母乳喂养具有微弱的健康益处以外，其他干预措施都没有意义。该综述提示，对于健康的新生儿，正常喂养即可满足儿童的生长发育。但应该注意，本文研究的只是发达国家，广大发展中国家的情况有待进一步研究。

营养模式系统综述新生儿肥胖与代谢感染

菌群-宿主互作

Cell：菌群影响宿主发育和生理的一种新机制

菌群-宿主互作 C. elegans development MiRNA Microbiome

多组学分析

国家蛋白质科学中心：小鼠发育阶段中胃蛋白组及转录组动态变化

来自国家蛋白质科学中心的团队在Nature Communications上发表的一项最新研究，对小鼠发育阶段中胃蛋白组及转录组的动态变化进行了综合分析，依据多组学数据及胃功能的发育，区分出了3个不同发育阶段，并鉴定出了在不同阶段中关键蛋白及RNA的动态变化。

多组学分析发育多组学分析蛋白组转录组

婴儿毅力

研究婴儿的早期毅力很重要

Trends in Cognitive Sciences发表的一篇观点文章，讨论了研究婴儿早期毅力的重要性及其原因。

婴儿毅力 cognition development effort infancy

肥胖

从娘胎里带出来的肥胖是怎么回事（综述）

导致肥胖的因素很多，其中之一就是母体营养失调。Trends in Endocrinology and Metabolism近期发表综述，详细探讨了肥胖的跨代表观遗传机制，值得专业人士关注。

肥胖 Developmental Origin of Health and Disease fat expansion maternal obesity perinatal period

先天免疫

Cell子刊：肠道菌群通过免疫途径调节宿主代谢

Cell Metabolism上发表的一项最新研究中，哈佛医学院团队在果蝇中发现，肠道菌群及其代谢产物乙酸，可激活肠内分泌细胞中的一种先天免疫通路，从而增加速激肽等内分泌肽的表达，促进宿主代谢稳态；当该通路被抑制或缺少肠道菌群时，果蝇幼虫发育不良。这些结果说明，先天免疫不仅在抗感染中有重要作用，也参与了肠道菌群对宿主代谢的调控。

先天免疫免疫缺陷（IMD）通路肠内分泌肽乙酸代谢

发育

肠上皮发育过程中，菌群如何影响转录组和DNA甲基化

肠道菌群在肠道发育中起重要作用，Genome Medicine[IF：7.071]近期发表研究，对有菌和无菌小鼠进行对比，表明肠道菌群在IEC发育过程中，对转录组的影响较大，而对DNA甲基化的影响则相对有限。

发育 DNA甲基化转录组肠道上皮细胞 epigenetics

发育

ME：银鲫的肠道菌群发育规律

又一篇鱼类肠道菌群的研究论文，转需。

发育异育银鲫肠道菌群 16S rRNA gene Gibel carp Gut microbiota

肠道菌群

Immunity：初步了解青少年时期的菌群发育规律

这篇介绍Gordon研究成果的简介，主要推荐大家看看图。

肠道菌群发育青少年 Mark R Charbonneau Jeffrey I Gordon

发育

有趣而值得必读的综述：肠脑轴，男女有别！

肠脑轴，男女有别，值得了解。

发育性别差异菌群寿命 Sarkis K Mazmanian

发育

Nature Reviews：肠道菌群是宿主发育和生理学的主宰（综述）

经典文献分享，2013年发表在Nature Reviews Microbiology [IF：24.727]上关于肠道菌群是宿主发育和生理学主宰的综述，立意经典，内容经典，图也经典，强烈推荐再次阅读。

发育生理学 Meri K Tulic Meri K Tulic Valérie Verhasselt