Thaddeus S Stappenbeck

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Thaddeus S Stappenbeck

文章数：17篇

饮食-菌群-免疫互作

Cell子刊：益生元果胶低聚糖如何诱导肠道IgA？

免疫球蛋白A（IgA）是维持粘膜表面稳态的重要因素，但肠腔内IgA水平差异很大。近日，发表在Cell Host and Microbe上的这篇文章，证明益生元果胶低聚糖（pec-oligo）通过富集有限数量的微生物来提高肠道中的IgA水平。

饮食-菌群-免疫互作益生元肠道菌群果胶低聚糖 IgA

Cell子刊：西式饮食如何伤肠？新机制被揭示

肠道潘氏细胞是肠道先天免疫的“守门人”，其功能缺陷可引起肠道炎症，增加发生感染和炎症性肠病（IBD）的风险。Cell Host and Microbe发表的一项最新研究，揭示了促肥胖的西式饮食引起潘氏细胞缺陷的机制，阐述了肠道菌群、胆汁酸、FXR和1型干扰素信号通路在其中的作用，为理解IBD等与潘氏细胞缺陷有关的肠道疾病机理，带来了新启示。

潘氏细胞西式饮食肠道菌群

Science：一种食源性酵母可阻碍肠损伤愈合

真菌是肠道菌群的重要成员，对于肠道真菌的研究近年也越来越受到关注。Science发表的一项最新研究发现，一种常用于食品工业（如制作奶酪和火腿肉）的真菌——汉森德巴利酵母（Debaryomyces hansenii）能在发炎和损伤的肠黏膜组织中过度生长。研究者严格按照科赫法则的鉴定方法，证明了这种真菌是阻碍肠组织损伤修复的真凶，并揭示了其阻碍伤口愈合的免疫分子机制。该研究不仅为治疗炎症性肠病提供了新思路和新靶点，也提示粪便不能很好的反映出肠黏膜的真菌构成，而联合应用培养和非培养的研究方法将有助于鉴定参与疾病机理的致病微生物，这种研究思路对于今后的微生物组研究有重要参考价值。

肠道真菌炎症性肠病汉森德巴利酵母科赫法则伤口愈合

肠道代谢产物或影响隐孢子虫对新生小鼠的感染

寄生虫隐孢子虫是导致免疫系统受损或不发达的人患腹泻病的主要原因，尤其是资源贫乏地区的婴幼儿。隐孢子虫是一种肠道病原菌，侵入肠上皮细胞的顶端表面，靠近肠腔的代谢物。mBio近期发表的文章，发现肠道代谢物，无论是来自饮食还是微生物群产生的，都会影响隐孢子虫体外生长，并可能导致幼年动物对隐孢子虫病的早期易感性。

隐孢子虫新生小鼠肠道菌群及代谢产物

肠道干细胞

Cell：长期2D培养技术重现结肠干细胞的损伤-修复周期

来自Cell上发表的一项最新研究，鉴定出了一种干细胞群体（Hopx+结肠炎相关再生干细胞群，CARSC）促进结肠炎小鼠模型的结肠上皮再生，并通过建立一个长期2D培养系统，重现了结肠隐窝中的“稳态-损伤-再生”周期。

肠道干细胞 HopX Lgr5 stem cell intestine colon

炎症性肠病

Nature：炎症性肠病肠道微生态系统的多组学分析

《Nature》最新发表来自Curtis Huttenhower和Ramnik J. Xavier团队合作主导的研究，对132名受试者一年内多个时间点的粪便、活检和血液样本，进行纵向多组学分析，全面揭示了炎症性肠病（IBD）相关的肠道菌群及其功能失调，以及宿主和菌群的分子互作关联，对于阐释IBD机制、寻找防治IBD的新靶点有重要价值。

炎症性肠病 CROHN'S DISEASE Microbiome Systems analysis ULCERATIVE COLITIS

炎症性肠病

Science子刊：PAI-1恶化结肠炎中的粘膜损伤

《Science Translational Medicine》发表的一项研究发现，在活动性IBD患者及对抗TNF治疗不应答的IBD患者的肠道活检样本中，纤溶酶原激活物抑制剂-1（PAI-1）表达升高，PAI-1可抑制组织纤溶酶原激活物（tPA）介导的抗炎作用，从而加剧肠道炎症及粘膜损伤。

炎症性肠病 IBD 纤溶酶原激活物抑制剂-1（PAI-1）人体研究 Weixin Liu

菌群-免疫互作

Science子刊：饮食调节特定细菌抗原表达以调控肠道免疫

Science Immunology上发表的一项最新研究，发现饮食中的特定成分可通过调节特定细菌抗原的表达，以调控细菌特异性T细胞的活性，从而影响肠道免疫稳态。

菌群-免疫互作肠道免疫饮食菌群-免疫互作多形拟杆菌

菌群代谢物

菌群代谢物如何参与固有免疫调节（综述）

微生物代谢物通过介导共生菌群与宿主免疫系统互作来协调肠道稳态。本综述总结了短链脂肪酸、氨基酸代谢物以及次级胆汁酸在调节宿主固有免疫中的作用以及机制，有助于了解微生物代谢产物和宿主免疫系统之间的关系，值得参考。

菌群代谢物固有免疫综述固有免疫菌群代谢物

肠道运动障碍

Cell：慢性便秘，可能是病毒感染损伤了肠道神经

西尼罗河病毒和寨卡病毒等黄病毒，均可造成神经系统疾病。Cell最新发表的一项研究则表明，这些嗜神经病毒还可导致小鼠的慢性肠道运动障碍，其原因与病毒感染肠神经系统及其引发的免疫反应有关，或许是肠易激综合征等疾病的潜在病因，如果这些发现在人体中得到确认，将为相关疾病的诊治提供新方向。

肠道运动障碍黄病毒肠神经系统 Patrice D Cani Clara Depommier

肠道损伤修复

Cell子刊：结肠损伤修复需要菌群代谢物

肠道菌群通过多样化的代谢产物，对宿主造成多方面的影响。Cell Host and Microbe上周发表的最新研究表明，肠道细菌代谢物——脱氧胆酸（DCA）在结肠损伤的修复过程中起了关键作用，通过与宿主间的有序互动，帮助结肠伤口顺利完成修复。这或许是与微生物共生中建立起的一种机制，再次提示人体的很多正常生理功能，需要我们的old friend（共生微生物）的帮助。

肠道损伤修复肠道菌群代谢物脱氧胆酸前列腺素E2 Carmen Escudero-Martinez

Nature子刊：多种方法助菌群因果性研究

这是Nature Microbiology针对之前发表在Nature的研究（http://www.xunludkp.com/papers/read/1084051336）的报道，老规矩，这样的文章看看图就会有收获。

共生菌菌群功能因果性研究 Yongguo Li Katharina Schnabl

儿童营养不良

Gordon团队：特定有毒菌株，让营养不良儿童体重减轻

最新一期Science Translational Medicine上Jeffrey I Gordon和团队的研究，发现转移到无菌小鼠中的营养不良儿童的菌群中包含了一个产肠毒素的脆弱拟杆菌菌株，它造成了体重减轻，而这样的表型可传递给后代，且与宿主能量代谢紊乱相关。Science子刊 + Jeffrey I Gordon，值得你必须看一看。

儿童营养不良无菌小鼠模型肠道病原体 Brennan Spiegel Brian E Lacy

菊粉、阿拉伯木聚糖、β-葡聚糖等

Cell：膳食纤维缺乏，肠道菌群降解黏膜屏障并促进感染

今天上线的Cell，看题目就知道要不要看，重磅文献！

菊粉、阿拉伯木聚糖、β-葡聚糖等膳食纤维益生元研究论文啮齿动物（小鼠）动物实验

Cell：膳食纤维缺乏，肠道菌群降解黏膜屏障并促进感染

今天上线的Cell，看题目就知道要不要看，重磅文献！

限菌小鼠黏膜屏障糖蛋白结肠炎膳食纤维

Nature：你的实验设计充分考虑宏基因组了么？

人和实验动物的表型都不仅仅受到自身基因组的影响，微生物组的影响必须充分考虑，实验设计和实验动物选择必须严谨。宏基因组到底有何影响，我们应该如何应对，未来如何提高实验的可重复性和可解释性，这篇文章值得所有人认真阅读。

实验科学同窝出生对照鼠宏基因组方法学实验可重复性

利贝昆氏隐窝

Cell：结肠隐窝如何保护肠道干细胞？

Cell最新上线的论文，值得关注。

利贝昆氏隐窝肠道干细胞肠道修复宿主-微生物共进化 Joan Font-Burgada