Jiachao Zhang

翟齐啸+张家超+黄适Cell子刊：益生菌如何改善便秘？锁定菌株特异性背后的关键遗传因子

益生菌长双歧杆菌功能性便秘肠道菌群菌株特异性

在持续的宿主选择压力下，适应性进化变化可能先于肠道微生物群落的生态变化，但其与宿主患病状态的关系尚未得到充分探讨。近日，海南大学张家超、香港大学黄适及团队在mSystems发表最新研究，通过荟萃分析描述了多个人类队列中不同健康状态下肠道微生物的普遍进化模式。发现微生物遗传变化可先于与宿主生理变化相关的生态变化，从而为疾病预测建模提供一个新的宏基因组数据信息层。此外，发现SCFAs产生的一些遗传生物标志物可以覆盖荟萃分析中涉及的大多数慢性疾病，值得关注。

单核苷酸变异肠道健康研究论文基础研究疾病状态

土著菌群

张家超+黄适+翟齐啸等：塑造益生菌的肠内进化，土著菌群vs宿主因素谁胜出？

益生菌在肠道内选择压力的作用下会发生突变，有利于其在肠道内潜在的适应性，通常由宿主及肠道微生物组驱动，但未有研究对宿主和微生物组的贡献进行区分。近日，海南大学张家超、香港大学黄适和江南大学翟齐啸及团队在npj Biofilms Microbiomes发表最新研究，利用GF和SPF小鼠区分宿主及肠道菌群对益生菌肠道内进化的驱动贡献，并确定激烈的微生物竞争是益生菌在肠道内进化的主要驱动力，而宿主贡献度小于0.5%，为利用肠道菌群进行微生物的突变驯化提供指导。此外，研究发现实验菌株在肠道内定殖期间均发生分歧性进化，进化为两个谱系，携带更多突变的谱系逐渐占据优势地位，值得关注。

土著菌群遗传进化研究论文基础研究益生菌

益生菌

张家超团队：益生菌与药物的互作，可能比想象的复杂

益生菌等肠道微生物可能通过降解药物等方式影响其宿主对药物治疗的个体化反应。Microbiome最新发表了海南大学张家超团队的研究成果，探究了益生菌是否会影响降脂药洛伐他汀的效力。结果表明，尽管益生菌可以降解洛伐他汀，但益生菌的摄入并不影响药物的疗效，反而还可起到减缓肝脏炎症反应的有益作用。这一发现可能对如何在服用药物时合理使用益生菌，具有指导和参考价值。

益生菌肠道菌群菌群-药物互作

iLABdb

张和平团队：构建基于Web的综合乳酸菌数据库—iLABdb

乳酸菌作为微生物领域重要的战略资源，在食品加工、农业种植、动物养殖以及生物制药等领域具有广泛的应用价值。然而，与其巨大的应用潜能相比，目前对乳酸菌资源的全面理解尚处于起步阶段。近日，内蒙古农业大学张和平及团队在Science Bulletin发表最新研究，构建了一个综合性的乳酸菌基因组数据库iLABdb（https://www.imhpc.com/iLABdb），可帮助科研界和产业界用户快速浏览、查询、分析及可视化乳酸菌基因组特征。iLABdb还为提交新的乳酸菌基因组或展示具备临床效益的明星菌株信息提供了平台。目前，iLABdb已整合了超62000个乳酸菌基因组及相关的元数据，包括超11000个新测序的乳酸菌基因组，覆盖了众多的地理和宿主背景。值得注意的是，iLABdb不仅提供了从菌株到全基因组的综合信息，还收录了1054项临床益生菌干预研究文献，以促进科学循证和医学研究。此外，iLABdb 还具备基于全基因组序列的搜索功能，将进一步助力于乳酸菌的精准分类和功能解析。未来，iLABdb将纳入更为广泛的乳酸菌数据，助推乳酸菌资源的深度开发和应用。

iLABdb 乳酸菌数据库研究论文基础研究乳酸菌基因组

张家超团队：加氏乳杆菌CKCC1913或可治疗糖尿病

2型糖尿病是一种慢性代谢性疾病，其特征是脂质代谢失调、胰岛素抵抗和肠道菌群紊乱，近年来益生菌作为糖尿病等代谢性疾病治疗方法的潜力受到越来越多的关注。近日，海南大学张家超团队在Food and Function上发表文章，利用C57BL/6J小鼠动物模型评估格氏乳杆菌CKCC1913对高脂饮食诱导的胰岛素抵抗糖尿病的治疗效果，发现加氏乳杆菌CKCC1913介导的肠-肝轴调节可缓解2型糖尿病引起的胰岛素抵抗和肝损伤，凸显了益生菌作为糖尿病治疗方法的巨大潜力。

铅暴露

张家超+孙志宏等：发酵乳杆菌HNU312或可缓解铅引起的脑损伤

铅接触是一个全球性的公共卫生安全问题，会严重干扰大脑发育，并在生命早期对神经系统造成损害。益生菌和肠道菌群因其在减轻铅毒性方面的关键作用而受到重视。然而，它们发挥作用的潜在机制还有待充分探索。近日，海南大学的张家超、内蒙古农业大学的孙志宏及团队在Ecotoxicology and Environmental Safety发表最新研究，通过动物实验发现补充发酵乳杆菌HNU312可以通过离子吸附、靶向调节微生物-肠脑轴等策略有效缓解幼鼠的脑损伤。总之，该研究为儿童大规模铅中毒导致的脑损伤提供了新的干预措施，值得关注。

铅暴露益生菌研究论文基础研究有害物质

益生菌

张家超+翟齐啸等：补充植物乳杆菌HNU082可缓解小鼠溃疡性结肠炎

益生菌可有效改善溃疡性结肠炎（UC），但其机制尚不清楚。近日，海南大学张家超、江南大学翟齐啸及团队联合在Microbiology spectrum发表最新研究，发现植物乳杆菌Lp082能有效缓解小鼠的溃疡性结肠炎，通过宏基因组测序，转录组测序，气质联用等技术进一步论证了Lp082可通过协同优化生物屏障、化学屏障、机械屏障和免疫屏障，从而改善肠黏膜屏障进而缓解炎症。总之，本研究不仅阐明了益生菌治疗UC的复杂机制，也为未来靶向肠道菌群有效干预和治疗结肠炎提供了新思路，值得关注。

益生菌溃疡性结肠炎研究论文基础研究肠道屏障

诊断标志物

iMeta：张家超团队建立基于肠道菌群单核苷酸变异基因标记物的IBD预测模型

肠道菌群是炎症性肠病（IBD）发生发展的重要环境因素。海南大学张家超团队近期在iMeta发表研究，在IBD患者的肠道菌群中发现了基于单核苷酸变异（Single nucleotide variants, SNV）的特异性基因特征，建立了一种新的准确预测IBD的诊断方法。

诊断标志物炎症性肠病(IBD) 肠道菌群宏基因组单核苷酸变异 (SNV)

益生菌

张和平+陈永福：植物乳杆菌P9或可缓解农药暴露人群的炎症反应

在农业生产中，农药无疑是防治病虫害的最适选择，其使用量和施用范围逐年扩增。然而，环境中残留的农药会通过皮肤和呼吸道侵入人体，增加人体患慢性代谢性疾病的风险。研究也发现肠道菌群在降解和缓解多种农药的危害方面发挥着至关重要的作用，但其潜在机制尚不清楚。近日，内蒙古农业大学张和平、陈永福及华润江中制药的团队在iScience发表最新研究，发现农药暴露人群血液中促炎因子水平较高，可诱导炎症并导致免疫功能障碍。而食用益生菌P9可缓解炎症反应，维持高农药暴露受试者肠道菌群的动态平衡，降低Streptococcus gordonii和Streptococcus anginosus等病原体的丰度，促进尿苷和5-羟脯氨酸的浓度显著增加，促进农药残留的排出。总之，该研究为益生菌在农药解毒中的应用提供了新见解。

益生菌植物乳杆菌P9 农药暴露研究论文基础研究

结直肠癌

张家超团队：大肠癌的肠道噬菌体标志物

在结直肠癌（CRC）的微生物组标志物研究中，噬菌体相关研究还相对较少。海南大学的张家超团队近期在Microbiology spectrum发表文章，报道了5个潜在的CRC噬菌体标志物，可较好的区分CRC与对照人群，为基于微生物组的CRC诊断和噬菌体疗法带来了新启示。

结直肠癌肠道噬菌体肠道微生物组生物标志物

益生菌

张家超+翟齐啸+黄适：益生菌摄入引起原住肠道菌群普适性改变

海南大学张家超、江南大学翟齐啸和加州大学圣迭戈分校黄适与团队的研究成果。益生菌对原住肠道菌群的影响是益生菌的安全性和有效性的重要评估。本文基于11个开源宏基因组数据库，深入分析了益生菌对SNVs的影响。本文从一定程度上展现了益生菌和本土菌群的共进化，值得相关人士关注。

益生菌单核苷酸变异体(SNVs)

益生菌

张家超+陈开宁：益生菌+甲硫咪唑可改善Graves病患者的甲状腺功能

Graves病（GD）是一种自身免疫疾病，通常导致甲状腺机能亢进。海南大学的张家超团队与海南省人民医院的陈开宁团队在Communications Biology上发表的一项最新研究结果，在26名GD患者中进行6个月的干预后发现，甲硫咪唑或甲硫咪唑+豆豉可显著改善FT3、FT4及TSH等多项甲状腺功能指标，但未能改善促甲状腺激素受体抗体（TRAb）的浓度，而甲硫咪唑+益生菌（长双歧杆菌）可同时改善FT3、FT4、TSH及TRAb。机制上，益生菌可能调节肠道菌群及代谢产物，从而通过肠-脑轴及肠-甲状腺轴影响神经递质及血液微量元素。

益生菌肠-甲状腺轴 Graves病甲状腺功能研究论文

干酪乳杆菌Zhang

内蒙古农业大学：干酪乳杆菌Zhang在肠道内的“变化”

益生菌进入人消化道后，其复制和基因表达发生了哪些变化，目前人们还所知甚少。这限制了对益生菌的益生机制的理解。NPJ Biofilms and Microbiomes近期发表了内蒙古农业大学孙志宏与团队的研究，海南大学张家超为共同第一作者。该研究通过宏基因组和宏转录组分析，揭示了益生菌干酪乳杆菌Zhang进入人肠道后，其基因表达模式发生的适应性变化，以及对肠道菌群的影响，为理解益生菌与宿主肠道（包括其中定植的菌群）之间的相互作用提供了新知。

干酪乳杆菌Zhang 宏基因组宏转录组肠道菌群益生菌

益生菌植物乳杆菌HNU082

张家超+Rob Knight：趋同进化vs.差异调节-益生菌的适应性突变

益生菌在宿主肠道内定植适应的机理尚不清晰，特别是缺乏其遗传进化的体内研究。海南大学张家超团队与UCSD的Rob Knight合作在Microbiome上发表文章，以植物乳杆菌HNU082(Lp082)为益生菌模型菌株，揭示其在不同宿主肠道中高度趋同的适应过程和策略。相反，宿主肠道菌群对Lp082的引入呈现出不同反应与互作。而作为‘暂驻菌’，益生菌的引入对肠道常驻菌群遗传组成的影响常常被忽略。

益生菌植物乳杆菌HNU082 进化适应研究论文

诊断模型

张家超等：基于肠道菌群标志物诊断格雷夫斯病

格雷夫斯病（GD）又称“毒性弥漫性甲状腺肿”，是一种自身免疫疾病的多系统综合征，通常引起甲亢。目前GD的临床诊断较为耗时，且可能与帕金森病混淆，因此需要研发便捷、准确的诊断方法。海南大学张家超团队、Kaining Chen团队与Rob Knight团队合作，在ISME Journal发表文章，对GD患者肠道菌群特征进行分析，鉴定出具有疾病特异性的GD菌群标志物，构建了疾病诊断模型，具有临床应用潜力。

诊断模型格雷夫斯病自身免疫疾病肠道菌群

菌群-肠-脑轴

张家超+潘永贵：褪黑素或通过菌群-肠-脑轴，改善神经递质分泌紊乱

海南大学张家超、潘永贵与研究团队近期在Frontiers in Cell and Developmental Biology发表研究，在咖啡因诱导的斑马鱼神经过度活跃模型中，探索褪黑素和益生菌对神经递质分泌紊乱的调节作用，及其潜在的菌群-肠-脑轴机制。

菌群-肠-脑轴神经递质褪黑素益生菌斑马鱼

结直肠癌

张家超+翟齐啸：基于肠道菌基因变异的大肠癌预测模型

Gut Microbes近期发表了海南大学张家超和江南大学翟齐啸与研究团队的成果，在肠道微生物单核苷酸变异（SNV）的层面上，构建了能用于区分大肠癌患者和健康人的无创诊断模型，并对在大肠癌中富集的4个SNV进行了功能预测，并进一步探究了这些SNV对大肠癌的疾病特异性。这些SNV在大肠癌肠道菌群的功能变化中的作用值得进一步研究。

结直肠癌单核苷酸变异（SNV）诊断标志物肠道菌群宏基因组学

肠道菌群发育

张和平、魏泓等：生命早期环境暴露影响肠道菌群发育

生命早期的环境暴露可影响肠道菌群的组装与发育。内蒙古农业大学的张和平团队、中科院青岛生物能源与过程研究所的黄适团队及华中农业大学的魏泓团队在Gut Microbes上发表的一项最新研究，发现生命早期（60天）的不同土壤环境暴露与小鼠的肠道菌群组成及功能显著相关，且在将小鼠转移至其它环境中后，尽管肠道菌群组成及功能逐渐变得与新土壤环境一致，但生命早期相关的肠道菌群特征仍持续存在。

肠道菌群发育基础研究研究论文啮齿动物（小鼠）环境暴露

低聚半乳糖

张家超等：益生元促进益生菌有益作用的机制

稳定的肠道菌群在维持宿主健康方面起着关键作用，而肠道菌群失调被认为是各种代谢疾病的危险因素。摄入的益生菌和原生肠道菌群之间不可避免的竞争会导致不稳定性的增加。在摄入益生菌时，外源性益生元是否以及如何改善肠道菌群的整体稳定性，目前仍不清楚。海南大学张家超团队与中科院青岛能源所孙政、内蒙古农业大学孙志宏等人合作的研究近期发表在《Gut Microbes》，该研究使用植物乳杆菌HNU082（Lp082）作为模型益生菌，评估了低聚半乳糖（GOS）对摄入益生菌后小鼠肠道菌群稳定性的影响，表明持续补充益生元对肠道菌群生态和遗传稳定性具有有益效果。

低聚半乳糖 probiotics Prebiotics Intestinal microbiome Lactobacillus plantarum HNU082

张和平团队：益生菌或可改善航海期间水手的肠道健康

漫长的航海过程中，水手的心理及生理均面临较大压力，可能对健康产生影响。来自内蒙古农业大学的张和平团队在Gut Microbes上发表的一项最新研究，发现在30天的航海中，益生菌可缓解水手的压力及焦虑，并抑制肠道菌群组成及功能的改变。该研究结果提示，在长时间的海上航行过程中，益生菌或可用于改善水手的肠道健康。

益生菌

张和平团队：益生菌或可改善航海期间水手的肠道健康

漫长的航海过程中，水手的心理及生理均面临较大压力，可能对健康产生影响。来自内蒙古农业大学的张和平团队在Gut Microbes上发表的一项最新研究，发现在30天的航海中，益生菌可缓解水手的压力及焦虑，并抑制肠道菌群组成及功能的改变。该研究结果提示，在长时间的海上航行过程中，益生菌或可用于改善水手的肠道健康。

益生菌 probiotics sea voyage intestinal microbiota homeostasis metagenome

内蒙农大张和平团队：乳双歧杆菌V9调节多囊卵巢综合征患者的性激素分泌

来自内蒙古农业大学张和平团队在mSystems上发表的一项最新研究，发现乳双歧杆菌V9可改善多囊卵巢综合征患者的激素分泌，该作用可能与其对短链脂肪酸水平的影响相关。

益生菌

内蒙农大张和平团队：乳双歧杆菌V9调节多囊卵巢综合征患者的性激素分泌

来自内蒙古农业大学张和平团队在mSystems上发表的一项最新研究，发现乳双歧杆菌V9可改善多囊卵巢综合征患者的激素分泌，该作用可能与其对短链脂肪酸水平的影响相关。

益生菌肠-脑轴多囊卵巢综合征乳双歧杆菌V9 益生菌

羊奶

陕西师范邵玉宇等：羊奶抑制诱发型小鼠肝损伤和菌群失调

来自陕西师范大学邵玉宇团队发表在Frontiers in Immunology上的最新研究，发现羊奶可抑制四氯化碳引起的小鼠急性肝损伤，并防止四氯化碳引起的肠道菌群失调。

羊奶 Muhammad Shahid Nadeem Firoz Anwar

摩拉水牛

张家超等：哪些细菌会影响牛奶蛋白？

海南大学张家超团队的工作，对比分析摩拉水牛与中国荷斯坦牛的肠道菌群，值得看看。

摩拉水牛中国荷斯坦牛肠道菌群牛奶蛋白 Allison Clark

fecal microbiota

张和平团队：瘦肉鸡和脂肪鸡的粪便菌群显著差异

内蒙古农业大学张和平教授和团队近期的一篇文章，不同品系鸡的肠道菌群进行了分析，发现有很大差异，具体内容大家可以仔细读读。

fecal microbiota broiler chicken metagenomics Ya-Shu Kuang Sheng-Hui Li

蒙古族

张和平 & 秦楠团队：蒙古族人肠道菌群的特点

内蒙古农业大学张和平和浙江大学秦楠团队合作的研究成果，推荐阅读。

蒙古族肠道菌群宏基因组 William B Miller William B Miller

Gout

张和平团队：肠道菌群为预测痛风提供可靠参考

现行痛风临床诊断标准灵敏度低且滞后。①痛风患者与健康人肠道菌群构成差异显著，且缺乏F.prausnitzii并富含B.caccae和B.xylanisolvens。②编码黄嘌呤脱氢酶基因在痛风患者肠道内显著富集，而尿囊素酶却大幅减少。③痛风微生物指数模型诊断准确率高达88.9%。

Gout Intestinal Microbiota Shotgun Metagenomic MIG

肠道菌群

赵立平+陈卫+张和平团队：东西南北中，国人菌不同！

① 分析我国9个省市7个民族的314名健康年轻人粪便菌群结构，菌群组成主要按地理及民族聚类；② 9种与合成短链脂肪酸相关的主要属种（布劳特氏菌、梭菌属、瘤胃球菌属、粪杆菌属、subdoligranulum、罗斯氏菌属、粪球菌属、拟杆菌属及考拉杆菌属）在所有人中共同出现；③ 这九种微生物的分布根据研究个体的民族、地理和生活方式仍有不同；④ 这些共有菌群是人体肠道菌群多样性的核心，也是人体功能不可或缺的生态系统服务提供者（ESP）。

肠道菌群健康