Purna C Kashyap

肠道菌群和宿主基因调控都可参与胃肠道疾病的发生发展，但尚不清楚这二者如何互作以影响宿主疾病。Nature Microbiology近期发表的一项研究，建立了一个用于整合多组学高维数据集的机器学习框架，并用该方法在三种肠道疾病中，鉴定了疾病间特有和共有的宿主基因-微生物组关联，为进一步研究菌群影响疾病的机理提供了新线索。

宿主-菌群互作多组学转录组肠道菌群

个性化治疗

Nature Reviews：将肠道菌群纳入精准医疗（综述）

疾病发生、发展以及治疗的多样性是医药领域的核心挑战。随着研究的深入，肠道微生物对疾病的干预作用逐渐被大家意识到。发表在Nature Reviews Gastroenterology and Hepatology上的综述，重点讨论了在6种疾病（感染、癌症、代谢性疾病、心血管疾病、自身免疫或炎症疾病、过敏）中，肠道菌群对疾病的发生发展、诊断及其可能的干预或治疗作用。

个性化治疗肠道微生物荟萃分析

肠道病毒组

肠道病毒组与IBS、饮食和肠道基因表达的互作

肠道病毒组中包括感染宿主细胞的真核病毒以及感染细菌的噬菌体，可以塑造肠道细菌群落和引发宿主应答。Gastroenterology发表的一项最新研究，分析了健康人、便秘型肠易激综合征（IBS-C）和腹泻型肠易激综合征（IBS-D）患者的肠道病毒组，及其与其他组学数据的关系。该研究表明，肠道病毒组在短期内是稳定的，但在不同IBS亚型中存在差异，它受到饮食的影响，并可能通过与肠道细菌的相互作用和/或改变宿主的基因表达，来影响宿主功能。

肠道病毒组肠易激综合征

功能性胃肠病

基于菌群的功能性胃肠病治疗，如何迈向临床转化？（综述）

Gastroenterology近期发表来自美国梅奥医学中心的综述，回顾了目前在肠道菌群与功能性胃肠病（特别是肠易激综合征IBS）的研究所取得的进展，重点探讨了未来开发菌群疗法的研究策略，推荐专业人士参考。

功能性胃肠病菌群疗法肠易激综合征

腹泻型肠易激综合征

Cell子刊：压力诱导的菌群变化或促进腹泻型肠易激综合征

压力是炎症性肠病（IBD）和肠易激综合征（IBS）爆发的已知诱因。Cell Reports Medicine近期发表的文章，发现应激压力导致小鼠粪便菌群失调，进而导致腹泻、肠屏障损伤和抗菌IgA增加；腹泻型肠易激综合征（IBS-D）患者也表现出粪便菌群失调，抗菌IgA增加，且IgA免疫反应与躯体症状的严重程度相关。表明在IgA相关的IBS-D患者中，应激压力破坏了肠道菌群，改变了胃肠功能和宿主对共生菌的免疫力，对疾病发展起重要作用。

腹泻型肠易激综合征 stress host:commensal immunity IgA Irritable bowel syndrome

肠易激综合征

Cell：纵向多组学研究挖掘IBS发病机制

肠道微生物组的变化可能参与了肠易激综合征（IBS）的发生发展，但背后的机制仍待深入挖掘。Cell最新发表了来自美国梅奥诊所Purna Kashyap团队与明尼苏达大学Dan Knights团队的研究，通过纵向取样的整合多组学方法，揭示了IBS及其不同亚型（便秘型、腹泻型）的肠道菌群组成和功能（代谢产物、基因）的变化特征，以及这些变化可能参与IBS发病的机制，相关的菌群代谢物和宿主-微生物代谢途径或是潜在的IBS治疗靶点。该研究是通过纵向多组学方法研究人类疾病机制的一个范例。

肠易激综合征 physiology functional bowel disorders Diet symptom severity

功能性胃肠疾病

Nature子刊：功能性胃肠病相关的肠道菌群失调

小肠细菌过生长与功能性胃肠病有关。《Nature Communications》近期发表研究，发现功能性胃肠疾病患者的小肠菌群发生了改变，且低纤维、高糖饮食可能有助于病症恶化。该结果对于开发针对性菌群干预、饮食干预手段具有参考价值。

功能性胃肠疾病小肠菌群菌群失调 Jia Sun Li‐Long Pan

肠道菌群

Cell：移民美国，西化的不仅是生活方式，还有肠道菌群

美国是移民大国，也是代谢疾病高发国，Cell刚刚上线的一项研究，对比了居住在泰国和美国的同族裔人群的肠道菌群组成和功能，发现移民可引起肠道菌群向着促代谢疾病的方向发生显著改变。一方水土养一方人，移民国外改变的不仅是生活环境，还有与健康息息相关的肠道菌群。

肠道菌群移民 Marta Guasch-Ferré Marta Guasch-Ferré

艰难梭菌感染

Science子刊：肠道菌群失调促艰难梭菌感染的新机制

Science Translational Medicine上发表的一项最新研究，发现在腹泻患者中，肠道菌群失调可增加肠道中的游离氨基酸（特别是脯氨酸），艰难梭菌可利用这些氨基酸作为能量来源，从而促进艰难梭菌感染。另外，在一项对腹泻患者的回顾性队列研究中，鉴定出一些临床风险因素（抗生素、住院、免疫抑制、先前的CDI），可预测肠道菌群失调及更高的CDI易感性。

艰难梭菌感染艰难梭菌感染脯氨酸氨基酸 Peng Zheng

减肥

梅奥学报：肠道菌群可影响减肥

同样的减肥方法，为什么对有些人有效，对另一些人无效？Mayo Clinic Proceedings发表的一项最新研究表明，肠道菌群中特定细菌的丰度以及菌群代谢碳水化合物的能力，可能是影响减肥效果的重要原因。虽然仍需更大规模的试验来验证，但这些发现提示，个性化减肥应考虑菌群因素。

减肥肠道菌群功能肠道菌群组成减肥干预 Lisa Ronan

性别差异

非甾体抗炎药引起肠道屏障及菌群变化，男女有别

FASEB Journal上发表的一项最新研究，发现健康女性与健康男性的肠道屏障通透性及肠道菌群多样性存在差异，在服用非甾体抗炎药——吲哚美辛后，男女之间的菌群变化也存在差异。

性别差异非甾体抗炎药肠道屏障功能 gender indomethacin

胃肠动力

Cell子刊：刺激胃肠蠕动的菌群代谢物，或能治疗便秘

Cell Host and Microbe上发表的一项梅奥诊所主导的最新研究，肠道菌群代谢色氨酸产生的色胺可激活结肠上皮细胞上的GPCR/5-羟色胺受体，从而增加结肠分泌，促进胃肠道转运，为治疗便秘带来启示。

胃肠动力便秘肠道菌群代谢产物色胺 G蛋白偶联受体

复发性艰难梭菌感染

Microbiome：粪菌移植治疗CDI可能受到IBD的影响

一项关于粪菌移植治疗艰难梭菌感染的重要研究，发现本身有IBD的CDI患者，菌群变化不大，复发可能性增加。很有意义的临床研究，推荐阅读。

复发性艰难梭菌感染粪便移植（FMT）炎性肠病 Clostridium difficile infection Fecal microbiota transplantation

5-羟色胺3受体

AJP：人体肠道菌群调节小鼠结肠分泌

一篇关于人体肠道菌群如何通过生成乙酸以调节小鼠短路电流的研究，有新意，值得认真看看。

5-羟色胺3受体结肠分泌 IBS Microbiome motility

人源化小鼠

mSystems：不同人的菌群对饮食干预的反应显著不同

把健康人的菌群移植到无菌小鼠，而后设计不同碳水化合物比例的饮食进行干预，发现来自3名健康人的3种肠道菌群对饮食干预产生的反应显著不同。结果虽然符合预期，但之前做这方面定量研究的不多，为此特别分享一下这篇文章。

人源化小鼠饮食干预肠道菌群个性化反应 Lydia E Wroblewski

减肥

Physiology：肠道菌群如何调控肥胖人群的生理？（综述）

关于肠道菌群和肥胖的综述文章，非常值得一读。

减肥肥胖代谢性疾病 B Sampaio-Maia R Araujo

神经递质

Cell子刊：肠道菌群的脱羧酶帮助产生神经递质

① 结合遗传学、晶体学等手段鉴定人肠道菌中2种不同脱羧酶：梭状芽胞杆菌CLOSPO_02083和活泼瘤胃球菌RUMGNA_01526 ；② 这类酶可将色氨酸脱羧形成β-芳基胺类神经递质色胺；③ 尽管这类酶在多数细菌中罕见，但至少有10%的人肠道菌群至少含有一种编码色氨酸脱羧酶的细菌；④ 色氨酸脱羧酶产物色胺促进肠上皮细胞分泌金属离子，影响肠道功能；⑤ 研究提示了一种潜在的机制，即肠道菌群可产生宿主调节化合物进而通过该机制影响宿主生理，包括行为。

神经递质色胺 β-芳基胺类色氨酸脱羧酶 Kotryna Simonyte Sjödin