A Kurilshikov

微生物组与肠道紊乱、代谢综合征和多种免疫疾病密切相关，越来越成为人们的共识。但是回到肠道研究的最初，究竟什么是健康的或不健康的肠道微生物组这一问题仍未被很好的回答。特别是关于人类菌群的研究，基于明确表型的大型、深入、标准化队列研究及综合分析仍是稀缺项。Nature刚刚上线来自荷兰格罗宁根大学傅静远等主导的基于荷兰微生物组项目（DMP）的研究，对荷兰人群肠道微生物组进行了全面的分析和概述，解析了遗传力与暴露组（Exposome）对菌群的影响，旨在促进微生物组靶向治疗的发展。这是继2021年，傅静远团队与合作者在Cell发表关于“人体肠道菌群的长期遗传稳定性和个体特异性”后（https://www.mr-gut.cn/papers/read/1049457684），在微生物组研究上的又一重大突破。

人类肠道微生物组暴露组研究论文基础研究

2型糖尿病

JAMA子刊：2型糖尿病的肠道菌群特征

文章基于2000余名荷兰人群的粪便菌群分析，探究了肠道菌群与胰岛素抵抗、2型糖尿病之间的关系。研究结果显示，肠道菌群的α多样性和β多样性均和胰岛素抵抗、2型糖尿病有关。并且文章进一步探究了具体与胰岛素抵抗、2型糖尿病相关的菌群种类，表明丁酸可能是其影响2型糖尿病的一个因素。

2型糖尿病肠道菌群

IBD

粪便钙卫蛋白+人β-防御素2用于IBD的诊断和监测

IBD 钙卫蛋白人β-防御素-2 诊断标志物研究论文

肠道病毒组

Cell子刊：人肠道病毒组的稳定性和无麸质饮食的影响

Cell Reports近期发表的研究聚焦人肠道病毒组，分析了其组成、动态变化、个体差异和稳定性，特别探索了无麸质饮食对肠道病毒组的影响，并对研究方法进行了探讨。

肠道病毒组饮食干预

饮食-菌群互作研究论文队列研究

来自Gut上发表的一篇letter，发现乳糖不耐受者的肠道菌群中的双歧杆菌属丰度显著升高，且双歧杆菌属的丰度与乳制品摄入及肠道不适（包括腹痛、腹部不适、腹胀）呈正相关，进一步分析显示，双歧杆菌属部分介导了乳制品摄入与肠道不适之间的关联。

乳糖不耐受研究论文基础研究饮食-菌群互作队列研究

遗传-菌群互作

Nature子刊：1.8万人数据揭示遗传因素如何影响人肠道菌群

肠道菌群的组成受到饮食、药物等诸多因素的影响，宿主遗传因素也在一定程度上影响菌群特征，但相关研究还比较缺乏。Nature Genetics最新发表了由荷兰格罗宁根大学医学中心团队领导的MiBioGen国际联盟研究，中科院微生物所王军研究员是该论文的共同第一作者，格罗宁根大学傅静远教授为共同作者。该研究纳入了欧美、中东、东亚多个国家和种族的24个队列、超过1.8万人的基因组和肠道菌群数据，揭示了肠道菌群在不同人群间的异质性，鉴定出若干可遗传的细菌类群以及31个影响菌群组成特征的基因位点（例如：乳糖酶基因可影响双歧杆菌、岩藻糖转移酶基因可影响特定瘤胃球菌），并通过基因集富集分析、全表型组关联研究和孟德尔随机化方法等，探索了遗传-微生物关联对宿主健康相关特征的潜在影响，包括特定肠道细菌与人类疾病间的因果效应等。该研究是迄今规模最大的人类遗传与肠道菌群的关联性研究，推荐专业人士参考和研读。

遗传-菌群互作 genome-wide association studies Microbiology 微生物组全基因组关联分析人肠道菌群

慢性疼痛

慢性疼痛患者的肠道菌群变化

慢性广泛性肌肉骨骼疼痛（CWP）是纤维肌痛的典型特征之一，可能与肠道菌群的变化相关。来自Rheumatology上发表的一项队列研究结果，发现相比于对照，CWP患者的肠道菌群α-多样性降低，且菌群中的Coprococcus comes丰度降低。但孟德尔随机化研究结果显示，Coprococcus comes与CWP发展并无因果关联。

慢性疼痛研究论文队列研究孟德尔随机化法全基因组关联分析（GWAS）

胆汁酸

傅静远等：遗传和菌群与肥胖者的胆汁酸的关系

胆汁酸 bile acids Genetics gut microbiome Liver

炎症性肠病(IBD)

塑造IBD肠道菌群的遗传因素

肠道微生物群和宿主遗传在炎症性肠病（IBD）的发病机制中具有重要作用，这两个因素之间的相互作用及其在IBD病因中作用需要进一步研究。《Gut》近期发表的文章，揭示出免疫系统相关的常见和罕见遗传变异或是塑造肠道菌群的关键因素，或为发展疾病治疗新方法提供机制原理。

炎症性肠病(IBD) 全外显子组测序基因-微生物相互作用

药物-菌群互作

Nature子刊：常用药物与肠道菌群组成和代谢功能的关联

肠道菌群可影响药物效力，反过来药物也影响肠道菌群。Nature Communications发表的一项最新研究，对荷兰3个队列的数据进行了分析，鉴定出19种常用药物与肠道菌群特征的关联，重点列举了质子泵抑制剂、二甲双胍、SSRI抗抑郁药以及非抗生素药物与菌群变化的关联。这些发现对于研究药物-菌群互作有参考意义。

药物-菌群互作肠道宏基因组队列研究炎症性肠病肠易激综合征

骨关节炎

Nature子刊：链球菌属与膝关节炎症及膝盖疼痛相关

肠道菌群产生的内毒素可能刺激巨噬细胞以产生炎症，导致关节炎相关疼痛。Nature Communications上发表的一项最新研究，在2个不同队列研究中均发现，骨关节炎患者的膝盖疼痛程度与肠道菌群中链球菌属的丰度显著相关，而链球菌属丰度的增加与膝关节炎症显著相关。

骨关节炎队列研究链球菌属骨关节炎 Jing Lu

脑-肠-菌群轴

Nature子刊：肠道菌群如何影响心理健康？

肠道菌群在肠脑轴中具有重要作用。近期发表在Nature Microbiology的一项人群队列研究显示，粪杆菌属、粪球菌属和小杆菌属等肠道细菌以及肠道菌群的丁酸代谢、多巴胺代谢等过程可能与心理健康相关，从人群层面一定程度上揭示了肠道菌群与心理健康的关联性，值得参考。

脑-肠-菌群轴队列研究心理健康欧洲人群抑郁

炎症性肠病

Science子刊：IBD及IBS患者的肠道菌群组成及功能变化

Science Translational Medicine上发表的一项最新研究，对近2000名受试者（包括355名IBD患者、412名IBS患者）的肠道菌群进行了宏基因组测序，对菌群组成及功能的异同进行了全面的剖析对比。

炎症性肠病肠易激综合征炎症性肠病肠易激综合征宏基因组测序

系统性红斑狼疮

干燥综合征vs系统性红斑狼疮，肠道和口腔菌群有何异同？

干燥综合征和系统性红斑狼疮，是两种有密切关联的系统性炎症性自身免疫疾病，在流行病学、临床、病原学和病因学等方面有相通之处。来自Journal of Autoimmunity上发表的一项最新研究，对比了干燥综合征患者、系统性红斑狼疮患者及健康人在肠道菌群及口腔菌群上的异同，发现两组患者的肠道菌群组成无显著差异，但均异于健康人，而两组患者的口腔菌群组成存在显著差异。

系统性红斑狼疮干燥综合征系统性红斑狼疮干燥综合征

动脉粥样硬化性心血管疾病

肠道菌群与低度炎症，及其对心血管疾病的影响（综述）

Obesity Reviews近期发表一篇系统综述，纳入14项研究（大多数是观察性和小型研究），分析人体肠道菌群与低度炎症标志物的关联，及其在动脉粥样硬化心血管疾病中的潜在作用机制，值得专业人士关注。

动脉粥样硬化性心血管疾病 atherosclerotic cardiovascular disease gut microbiome Inflammation Obesity

宿主-菌群互作

王军等：宿主基因组与菌群关系研究要有大动作！

Microbiome近期发表一项宣告，宣布大型研究计划MiBioGen的启动。该计划由中科院微生物所王军以及比利时和荷兰的多位科学家发起，旨在从全基因组的层面研究人体基因对肠道菌群的影响。目前MiBioGen已收集了全球18个不同人群，约19000人的肠道菌群和基因组数据，建立了完整、开源、标准化的分析流程，并邀请和号召更多研究者加入。

宿主-菌群互作肠道菌群全基因组关联研究(GWAS) 荟萃分析 gut microbiome

遗传关联研究

Nature：对菌群的影响，环境大于宿主基因！

# Nature再发菌群分析强文！# 宿主的遗传背景对人类肠道菌群的影响程度一直不甚明了。Nature杂志（IF:40.137）最新发布了以色列魏茨曼科学研究所Eran Elinav & Eran Sega课题组的研究成果，通过一系列遗传学和统计学相关性分析，指出环境因素比宿主基因对肠道菌群结构的影响更加显著，开创性地将“菌群相关性系数（microbiome-association index）”纳入计算模型，利用肠道菌群数据提高对血糖、肥胖等体质特征的预测精度。作者还鲜明提出，通过菌群来改善治疗效果，无须考虑太多宿主遗传背景，可针对人群特征推动。这篇文献具有较强的研究和应用参考价值，非常值得认真看看，特别推荐给大家。

遗传关联研究人类遗传学人肠道菌群 Genetic association study Genetics

宿主基因

TI：一文读懂宿主基因与肠道菌群的极密切关系！（必读综述）

Cell旗下的知名期刊Trends in Immunology[IF：13.287]，刚刚online了这篇超强综述，对宿主基因如何影响肠道菌群进行了全面阐述。这是必读的文献，强烈推荐！

宿主基因