Colin Hill

肠道微生物组是人体消化道中密集且活跃的微生物和病毒的集合体。其中，细菌和噬菌体是最丰富的成员。相比于肠道细菌，肠道噬菌体的研究处于初步阶段。肠道噬菌体可能与肠道疾病的发生和发展有关。为了了解它们在人类健康和疾病中的作用，研究它们的生物学特性和相互作用非常重要。一篇发表在《Annual Review of Microbiology》上的综述总结了近期在研究肠道噬菌体群的分类结构和生态功能方面取得的进展。进一步研究肠道噬菌体的功能和机制，有助于深入了解肠道微生物与宿主之间的相互作用，为预防和治疗肠道相关疾病提供新的思路和方法。

肠道噬菌体肠道微生物噬菌体-菌群-宿主互作

粪菌移植

Nature Reviews：FMT和益生菌干预需考虑潜在风险

Nature Reviews Gastroenterology and Hepatology最近发表的一篇新闻/小综述，对粪菌移植和益生菌干预引起重症病人感染等潜在风险进行了讨论，提出粪菌移植和益生菌干预时，不仅要关注其有益作用，也要记录并公开承认其中出现的不良事件，考虑其潜在的风险，当粪菌移植和益生菌干预的有益作用大于其中的风险时，可以用于预防和治疗疾病。

粪菌移植益生菌干预 Shu Xu Xiaozhi Li Shixian Hu

IBD

Cell子刊：全病毒组分析揭示IBD肠道病毒组中的“暗物质”

Cell Host and Microbe上发表的一项最新研究，对公开数据库中的病毒组序列进行重新分析，鉴定出了IBD患者的肠道病毒组的特异性变化，并发现肠道病毒组的变化反映了肠道细菌的变化。

IBD Virome Phageome INFLAMMATORY BOWEL DISEASE IBD

肠道病毒组

Cell子刊：稳定、个体化的人类肠道病毒组

人类的肠道中含有大量的病毒，其中绝大部分是噬菌体。在人肠道微生物组的研究中，关于病毒组的研究还比较缺乏。Cell Host and Microbe发表的一项研究，开发了基于宏基因组学的方法工具，能更为深入全面的分析人类肠道病毒组。该研究通过纵向队列分析表明，人肠道病毒组是稳定且高度个体化的，且每个人都存在“持久稳定的个体病毒组”（PPV），由靶向主要肠道细菌类群的烈性噬菌体组成。这些发现为进一步深入研究人类肠道病毒组打下了基础。

肠道病毒组 Bacteriophages human microbiome Virome Phageome

菌群研究科学

菌群研究需要精准描述、据实汇报、明确因果！

菌群研究科学观点评论绝对丰度菌群紊乱因果性研究

肠道噬菌体组

Cell子刊：人体肠道噬菌体，我们到底知道多少？（综述）

肠道噬菌体组信息对研究肠道菌群-宿主互作具有重要意义。本综述总结了目前研究肠道噬菌体组的方法，以及对噬菌体组组成、结构和动态的了解，同时指出了研究瓶颈和未来发展方向，值得参考。

肠道噬菌体组综述噬菌体组人体肠道噬菌体 Olivier Disson

病毒组

病毒组分析，选对软件很关键

迄今为止最完整的病毒组组装软件评测，包含了16个宏基因组组装软件（方法），结果表明SPAdes一致性表现最好。

病毒组 Assembly Bacteriophage Benchmark Comparison

饮食

高脂饮食增加李斯特菌感染风险

饮食 Diet Goblet cell Immunity infection

肠道噬菌体

Nature子刊：人体肠道中的一类常见噬菌体——ΦCrAss001

Nature Communications上发表的一项最新研究，从人粪便中分离出了一种可感染拟杆菌目细菌的噬菌体——ΦCrAss001，并对其基因组大小、基因组结构、病毒形态、复制方式等进行了细致分析。

肠道噬菌体

肠道病毒组

Cell子刊：揭秘人肠道中最多的病毒——crAss样噬菌体

crAss噬菌体是人体肠道中最多的病毒，但相关基因组数据并不丰富。本研究通过组装粪便病毒组/噬菌体组数据，很大程度上填补了基因组数据匮乏的空缺，证明了crAss噬菌体在人体肠道中的丰富性和多样性，并且通过离体培养观察到了病毒结构。本研究对探索crAss噬菌体与肠道菌群的互作，以及对人体健康的影响具有借鉴作用。

肠道病毒组 crAss样噬菌体噬菌体结构人粪便

益生菌

益生菌需要更深入的机制研究（必读综述）

这是Current Opinion in Biotechnology [IF: 8.38]发表的关于益生菌需要更多机制研究以支持更广泛应用的综述，文章篇幅不长，却系统性论述了益生菌的作用、现有研究的局限性，并举例说明了如何利用动物模型、分子机制研究来阐明益生菌的确切作用机制，并讨论机制的阐明对益生菌行业发展的重大意义。这是非常有启发性的研究，特别推荐益生菌专业人士阅读！

益生菌抗生素相关腹泻坏死性小肠结肠炎动物模型分子机制

病毒组

分娩方式影响一岁婴儿的肠道病毒组

病毒组分娩方式噬菌体 Tine Mejlbo Sundfør Tine Mejlbo Sundfør

细菌素

细菌素或为生物被膜克星（综述）

本文总结了以羊毛硫抗生素为代表的细菌素用于防御和清除生物被膜的相关研究，指出细菌素与其他抗生素具有良好的协同抗菌作用，联用后具有高效、经济的优点，并可以一定程度规避抗生素耐药性的形成，拥有客观的运用潜力。作者同时也总结了目前细菌素运用的局限性，以及相关领域的瓶颈和发展方向，值得专业人士参考。

细菌素生物被膜

实验方法

可重复的提取分析人粪便噬菌体组的实验流程

实验方法噬菌体组 Bacteriophage human gut microbiome metagenomics

噬菌体疗法

BJP：对抗抗生素耐药性，不应忽视噬菌体疗法（综述）

这是 British Journal of Pharmacology[IF：5.491]发表的关于噬菌体可能在对抗抗生素耐药性方面的作用的系统性论述，看过会有一定的启发意义，值得特别关注。

噬菌体疗法抗生素耐药性 David Schnadower David Schnadower