Danilo Ercolini

黑水虻幼虫的肠道菌群能降解塑料

在过去的几年里，人们越来越关注昆虫及其肠道微生物群的塑料降解能力，以期开发出新颖、有效和绿色的塑料废物管理策略。尽管许多基于16S rRNA基因测序的分析是可用的，但对昆虫肠道微生物群进行深入分析以识别具有塑料降解潜力的基因仍然缺乏。近期发表于Microbiome的一项研究利用含聚乙烯（PE）和聚苯乙烯（PS）颗粒的饲料喂养黑水虻（BSF）幼虫，发现BSF微生物群组成具有惊人的可塑性，并与微生物组的功能变化有关，本研究还为利用BSF幼虫作为“生物孵化器”来分离微生物菌株和酶，以开发创新的塑料生物降解策略奠定了基础。

儿童过敏

Nature子刊：与儿童过敏相关的肠道菌群特征

Nature Communications近期发表一项来自意大利的研究，通过对比分析过敏患儿和健康儿童的肠道微生物组，揭示了过敏患儿的肠道菌群失调特征，表明其具有较高的促炎潜力和较弱的纤维降解能力，活泼瘤胃球菌可能在其中有关键作用。

儿童过敏肠道菌群宏基因组活泼瘤胃球菌

microRNA

粪便miRNA谱可反映饮食和肠道菌群模式

microRNA 研究论文基础研究生物标志物队列研究

普雷沃氏菌

Nature Reviews：普雷沃氏菌的丰富性、多样性与重要性（综述）

Nature Reviews Microbiology发表的关于普雷沃氏菌的深度综述。普雷沃氏菌在人的肠道、口腔等器官都是主导菌属，但相关研究较少。值得注意的是，作者提出整体的微生物组研究特别是关于普雷沃氏菌的信息都偏向西方人群，或存在偏差。同时综述结尾提出了三个关于普雷沃氏菌研究的‘Open questions’，感兴趣的读者可以细读、深思。

普雷沃氏菌种属内多样性综述

环境菌群

Cell：绘制城市微生物组和抗生素耐药性的宏基因组图谱

Cell近期发表的文章，通过对三年内收集的来自60个城市公共交通系统的4728个样本进行分析，构建出一个高分辨率的宏基因组图谱，有助于鉴定微生物和抗生素耐药性基因，具有潜在的公共卫生和法医应用。分析发现不同城市的抗生素耐药基因、微生物分类特征具有较大差异，且与气候和地理状况有关。

环境菌群城市微生物组抗生素耐药性

粪杆菌属

Cell子刊：肠道粪杆菌属细菌的多样性

粪杆菌（Faecalibacterium）属细菌广泛存在于人体肠道中，在开发下一代益生菌（next-generation probiotics，NGPs）或生物治疗药物方面具有广阔前景。但对于其多样性的认识十分有限。发表在Current Biology上的一项研究通过宏基因组组装，系统分析了粪杆菌属细菌在人类肠道中的多样性以及与年龄、地理、疾病等的相关性，极大丰富了对该类细菌的认识。

粪杆菌属 Faecalibacterium prausnitzii gut microbiome strain diversity Pangenome

发酵食品

发酵食品、乳酸菌与人体健康（综述）

乳酸菌存在于食物、环境以及动物和人体肠道中，是一类能产生乳酸的细菌，常见的主要包括乳杆菌属、乳酸乳球菌、嗜热链球菌等。FEMS Microbiology Reviews发表的长篇综述，详细介绍了乳酸菌的多样性、在食品和肠道中的存在情况、对人体健康的潜在作用，讨论了基于基因组学和宏基因组学数据来挖掘乳酸菌的多样性和功能特性，以及未来研究方向。

发酵食品乳酸菌 lactic acid bacteria food microbiome human microbiome

血糖调控

地中海饮食或通过短链脂肪酸改善餐后血糖

文章通过对超重/肥胖患者进行膳食干预，发现在地中海膳食模式的干预下，患者餐后血糖和胰岛素敏感性均得到改善。进一步研究发现，地中海膳食组血浆丁酸浓度升高，Intestinimonas butyriciproducens（一种产丁酸菌）和Akk菌的相对丰度增加。文章认为，地中海膳食可能通过影响肠道菌群，进而改善餐后血糖代谢。

血糖调控 Mediterranean diet glucose metabolism Postprandial blood glucose Short chain fatty acids

乳酸菌

Nature子刊：肠道中的乳酸菌可能主要来自食物

很多发酵食品都富含乳酸菌，包括一些被认为是益生菌的菌株。人们在吃发酵食品的过程中，会大量摄入活的乳酸菌，但是这些吃进去的乳酸菌有多少会驻扎在肠道菌群中呢？《Nature Communications》发表的一项新研究，通过大规模的食物宏基因组和人类宏基因组分析，以及在株水平进行比较基因组分析，认为食物（特别是发酵食品）应该是人体肠道中的乳酸菌的主要来源。

乳酸菌食物菌群肠道菌群发酵食品

地中海饮食

地中海饮食改善超重和肥胖人群的代谢健康并调节肠道菌群

地中海饮食（MD）是一种有益的饮食方式，可以预防多种疾病。Gut近期发表了一项关于MD对超重和肥胖人群的干预试验，探究MD对代谢健康、肠道微生物组和系统性代谢组的影响。采取与日常能量摄入一致的MD后，受试者血液胆固醇和血浆及尿液中肉碱水平的降低与MD的依从性成正比；同时MD导致了微生物组和代谢组的多种变化，如增加了降解膳食纤维的普氏粪杆菌和降低了潜在促炎的活泼瘤胃球菌。这一结论有助于制定改善代谢健康的饮食策略。

地中海饮食随机对照干预试验营养代谢健康 Guangping Huang

动物双歧杆菌Bb-12

BB-12或可帮助治疗婴儿肠绞痛

婴幼儿肠绞痛是一种功能性胃肠道疾病，发病机制尚不明确。肠道菌群失调可能导致肠绞痛的发生。Alimentary Pharmacology and Therapeutics的一项随机双盲实验，招募了80名婴儿，均分成两组，分别接受BB-12(1 × 10^9 CFU/天)和安慰剂干预80天，对婴儿平均哭泣时间、哭泣频率、排便频率、肠道菌群结构、丁酸盐、sIgA等指标进行了分析，发现BB‐12或可通过免疫和非免疫机制及调节肠道菌群结构和功能，控制婴儿肠绞痛。

动物双歧杆菌Bb-12 研究论文以人为对象的临床试验随机双盲对照实验（RCT）婴儿肠绞痛【有显著改善】

Bifidobacterium animalis subsp. lactis BB‐12®

BB-12或可帮助治疗婴儿肠绞痛

婴幼儿肠绞痛是一种功能性胃肠道疾病，发病机制尚不明确。肠道菌群失调可能导致肠绞痛的发生。Alimentary Pharmacology and Therapeutics的一项随机双盲实验，招募了80名婴儿，均分成两组，分别接受BB-12(1 × 109 CFU/天)和安慰剂干预80天，对婴儿平均哭泣时间、哭泣频率、排便频率、肠道菌群结构、丁酸盐、sIgA等指标进行了分析，发现BB‐12或可通过免疫和非免疫机制及调节肠道菌群结构和功能，控制婴儿肠绞痛。

Bifidobacterium animalis subsp. lactis BB‐12® infant colic Butyrate sIgA beta‐defensin‐2 (HBD‐2)

人肠道细菌

Cell子刊：揭秘西化人群中缺乏的Prevotella copri

Prevotella copri是常见的人类肠道细菌，尤其存在于非西化人群中，这种菌在健康与疾病中的作用仍有不小的争议。Cell Host and Microbe近期发表的一项研究，分析了超过7000个宏基因组中>1000个P. copri基因组，结合对古人类化石样本的分析，充分揭示了这种菌的种内多样性和在不同人群中（西化vs非西化）的存在情况，及其与人类共生的进化史，表明西化进程（尤其是相关的饮食变化）可能导致了这种菌在人类肠道中不断减少。

人肠道细菌 human microbiome metagenomics Prevotella copri comparative microbial genomics

维生素D

缺乏维生素D改变小鼠肠道菌群并介导慢性疼痛

《Brain Behavior and Immunity》上发表的一项最新研究，发现缺乏维生素D的小鼠的肠道菌群多样性及组成改变，脊髓及肠道中的内源性大麻素水平也发生了显著变化，并导致小鼠的慢性疼痛。

维生素D vitamin D deficiency pain Gut microbiota Endocannabinoids

饮食-菌群-宿主

Cell子刊：具体哪株菌，饮食来决定

肠道普雷沃菌对人类健康的影响具有争议。本研究纳入多个意大利人粪便菌群研究数据，发现Prevotella copri菌株类型和功能的人群间个体差异受饮食结构的影响显著，可能因此对宿主健康带来不同的影响。本文的结果对研究饮食-微生物-宿主互作具有重要参考价值。

饮食-菌群-宿主 Prevotella copri 意大利人人体研究宏基因组

鼠李糖乳杆菌14E4株对健康人粪便菌群的影响

Food Research International上发表的一项最新研究，从奶酪中分离出一株具有益生菌特性的鼠李糖乳杆菌并添加于发酵乳中，并分析其对健康志愿者粪便菌群的影响。

益生菌

鼠李糖乳杆菌14E4株对健康人粪便菌群的影响

Food Research International上发表的一项最新研究，从奶酪中分离出一株具有益生菌特性的鼠李糖乳杆菌并添加于发酵乳中，并分析其对健康志愿者粪便菌群的影响。

益生菌益生菌鼠李糖乳杆菌14E4 Shaminie J Athinarayanan Sarah J Hallberg

改善肠道菌群或能帮助治疗牛奶过敏

牛奶过敏可能由IgE介导，也可能由非IgE机制介导。Scientific Reports上发表的一项最新研究结果，鉴定出了非IgE介导的牛奶过敏患儿的肠道菌群特征，发现其与IgE介导的牛奶过敏患儿的肠道菌群有部分相似之处，利用鼠李糖乳杆菌治疗可更好地改善患儿的菌群失调。

牛奶过敏

改善肠道菌群或能帮助治疗牛奶过敏

牛奶过敏可能由IgE介导，也可能由非IgE机制介导。Scientific Reports上发表的一项最新研究结果，鉴定出了非IgE介导的牛奶过敏患儿的肠道菌群特征，发现其与IgE介导的牛奶过敏患儿的肠道菌群有部分相似之处，利用鼠李糖乳杆菌治疗可更好地改善患儿的菌群失调。

牛奶过敏过敏牛奶过敏 IgE

食品研发

健康食品研发的新思路（综述）

食物成分、特质对肠道菌群具有不可忽视的影响，相关研究领域不仅仅为基础研究提供了数据和实验支持，也为健康食品的研发提供了新思路。改变现有食品加工工艺和补充有益代谢物前体为基础，个性化的新食品研发有利于有效控制人体营养摄入、维护肠道菌群健康，甚至可能调节其他身体机能。作者也阐述了肠道菌群在代谢产物转化过程中的两面性，指出了食物干预菌群、人体的局限性。

食品研发肠道菌群代谢植物素 George F Gao Xin Zhao

牛奶过敏

Nutrients：防治食物过敏，菌群或许是靶点（综述）

牛奶过敏免疫耐受益生菌短链脂肪酸丁酸盐

中肠菌群

PNAS：苏云金芽孢杆菌毒素如何抗虫害？

苏云金芽孢杆菌毒素，会让昆虫的中肠菌群不受控制地增值并进入体腔，以此让昆虫死亡，这个毒素的毒性机理，就此揭开。

中肠菌群宿主免疫力苏云金芽孢杆菌昆虫 Vitaly Citovsky

意大利式无谷蛋白饮食

从不平衡到新的不平衡：意大利式无谷蛋白饮食改变非洲乳糜泻儿童的唾液菌群及代谢组

① 食用非洲式无谷蛋白饮食至少两年的14名非洲儿童接受60天意式无谷蛋白饮食； ② 唾液菌群及代谢组改变； ③ 颗粒链菌属、卟啉单胞菌属及奈瑟氏菌属增加，梭菌属、普氏菌属及韦荣球菌属减少； ④ 氨基酸、维生素及辅助因子代谢增加； ⑤ 丙酮及2-丁酮增加说明意式饮食造成的代谢紊乱。

意大利式无谷蛋白饮食乳糜泻唾液菌群代谢组 Zhi Liu

Diet

Gut：地中海饮食对肠道菌群和代谢组有何好处？

去年Gut上关于地中海饮食如何影响肠道菌群和相关代谢组的重要文献，特别分享给大家。

Diet DIETARY FIBRE ENTERIC BACTERIAL MICROFLORA INTESTINAL BACTERIA Short chain fatty acids