Philippe Langella

Dectin-1和Dectin-2是先天免疫中识别真菌细胞壁成分的受体，在抗真菌免疫中发挥作用。Microbiome发表的这项研究，探索了Dectin-1和Dectin-2在肠道炎症中的作用，意外发现同时敲除Dectin-1和Dectin-2可通过影响肠道细菌群的组成，增强小鼠对结肠炎的抵抗力，并鉴定出介导这种保护作用的肠道细菌。

肠道炎症肠道细菌群真菌

自闭症谱系障碍

菌群代谢物对甲酚可引起自闭症？

菌群-肠-脑轴可能通过特定的菌群代谢产物，影响自闭症（ASD）的发病和症状。Microbiome近期发表的一项动物研究表明，在ASD患者中增高的菌群代谢物对甲酚，能在小鼠中诱导ASD的核心症状，且这种作用依赖于肠道菌群的变化。这提示，靶向肠道菌群和对甲酚生成的干预方法，或能用于治疗ASD。

自闭症谱系障碍菌群-肠-脑轴肠道菌群代谢产物对甲酚

炎症性肠病(IBD)

Cell子刊：短链脂肪酸或调节γδ T细胞产生IL-17

肠道产生白细胞介素-17A（IL-17）的γδ T细胞是组织驻留细胞，参与宿主防御和肠道炎症的调节。Cell Reports近期发表的文章，发现肠道菌群来源的短链脂肪酸，尤其是丙酸盐，抑制小鼠肠道γδ T细胞和炎症性肠病患者的产IL-17的γδ T细胞中IL-17的产生，且这些代谢物以HDAC依赖性方式直接作用于γδ T。文章增加了我们对肠道γδ T细胞功能调控的了解，同时提供了治疗炎症性肠病的思路。

炎症性肠病(IBD) 肠道菌群短链脂肪酸（SCFA）肠道γδ T细胞

乳糜泻

Science子刊：激活AhR通路可以改善乳糜泻肠炎

乳糜泻是一种由于谷蛋白过敏导致的慢性肠道炎症，DQ1和DQ8基因是该疾病重要的易感基因。然而全世界40%的人群携带有至少1个易感基因，但是最终发病的患者不到1%。已有研究发现肠道菌群的构成对于乳糜泻的发生有重要的作用。但是，具体的机制尚不清楚。近期一篇发表在Science Translational Medicine上的一篇文章，通过在非肥胖糖尿病小鼠（NOD）中过表达DQ8建立了乳糜泻小鼠模型，应用该模型发现高色氨酸膳食可以激活芳香烃受体通路，从而显著抑制乳糜泻的发生，改善谷蛋白过敏造成的肠道炎症表型，提出肠道菌群通过调节芳香烃受体通路抑制乳糜泻疾病发生的机制，为乳糜泻的临床治疗提供了新策略。

乳糜泻色氨酸代谢研究论文基础研究动物实验

抗生素

肠道菌群组成可影响抗生素对菌群和宿主的作用

抗生素对肠道菌群和宿主的影响存在个体差异，有的人用了抗生素可能会拉肚子，而有的人可能没啥不适。Microbiome发表的一项研究表明，这种对抗生素的个体化应答，受用药前的肠道菌群组成的影响。这些发现再次提示，优化用药需考虑菌群因素。

抗生素 antibiotics Gut Microbiome Transcriptome

Nature Reviews：益生菌研究需要结合临床实践

《Nature Reviews Gastroenterology and Hepatology》近期发表评论文章，回顾了以色列团队去年在Cell发表的两篇益生菌研究，指出其中所用的益生菌菌株、使用方法和效果/风险评价指标与临床应用存在差距，强调了在益生菌研究、开发上需要结合临床运用现状和检测指标。

益生菌

Nature Reviews：益生菌研究需要结合临床实践

《Nature Reviews Gastroenterology and Hepatology》近期发表评论文章，回顾了以色列团队去年在Cell发表的两篇益生菌研究，指出其中所用的益生菌菌株、使用方法和效果/风险评价指标与临床应用存在差距，强调了在益生菌研究、开发上需要结合临床运用现状和检测指标。

益生菌观点评论益生菌益生菌有效性益生菌风险

脂肪组织

肠道失调和炎症诱导脂肪积累

《FASEB Journal》近期发表研究，发现肠道菌群通过内毒素间接调节血清中的磷脂酰甘油，该炎症反应性脂类具有调节脂肪组织内稳态的作用。该研究对阐释肠道菌群与宿主肥胖间的关系具有参考价值。

脂肪组织 adipocyte lipolysis lipidomic profiling phosphatidylglycerol synthesis serum phospholipidome

肠道致病菌感染

Gut：抗腹泻性细菌感染的新机制

肠道致病菌感染免疫肠道菌群

微生物疗法

Nature子刊：活菌生物疗法在临床上的应用（新闻和观点）

微生物疗法是指用基因工程菌来对抗疾病。这一领域近年来发展得很快，人们已经在动物模型和人体内看到了成功的希望。发表在《Nature Biotechnology》上的一项新闻观点对Isabella等人的微生物疗法（Isabella et al., Nat Biotechnol, 2018）及相关成果进行了评论。Isabella等人使用表达苯丙氨酸羟化酶的大肠杆菌Nissle 1917菌株成功治疗小鼠和非人灵长类的苯丙酮尿症，成为微生物疗法的一个重要里程碑事件。此外，Nissle 1917和乳酸细菌在多种动物疾病模型中表现出治疗潜力，有望开展人类临床研究，从而造福个体与公众健康。

微生物疗法大肠杆菌Nissle 1917 Lactobacillus lactis 生物疗法细菌-宿主互作

肠杆菌科

肠杆菌科帮助真菌调节小鼠的结肠炎

C. albicans Colitis Enterobacteriaceae Fungi microbiota

肠道菌群代谢物

Cell子刊：菌群产生的AhR配体，改善代谢综合征

肠道菌群的代谢产物对宿主健康有重要影响，Cell Metabolism上线的最新研究揭示了代谢综合征背后的菌群机制。该研究表明，菌群生成芳香烃受体（AhR）配体的能力下降，可引起肠道屏障损伤、减少肠促胰岛素GLP-1分泌，从而加剧代谢综合征。补充AhR激动剂或能生成大量AhR配体的益生菌，可改善这些问题，是防治代谢紊乱的新策略。

肠道菌群代谢物代谢综合征芳香烃受体配体罗伊氏乳杆菌CNCM I-5022 Lactobacillus reuteri CNCM I-5022

Nature子刊：鼠李糖乳杆菌限制沃氏嗜胆菌对代谢的不良影响

Nature Communications刚刚上线一项关于菌群与肥胖的小鼠研究，表明沃氏嗜胆菌与高脂饮食协同促进炎症和代谢障碍，加剧血糖问题和脂肪肝，而补充鼠李糖乳杆菌CNCM I-3690可显著改善部分症状。这些发现对研究饮食-菌群-代谢的互作有参考意义，且具有一定的人体转化应用潜力，值得关注。

代谢紊乱

Nature子刊：鼠李糖乳杆菌限制沃氏嗜胆菌对代谢的不良影响

Nature Communications刚刚上线一项关于菌群与肥胖的小鼠研究，表明沃氏嗜胆菌与高脂饮食协同促进炎症和代谢障碍，加剧血糖问题和脂肪肝，而补充鼠李糖乳杆菌CNCM I-3690可显著改善部分症状。这些发现对研究饮食-菌群-代谢的互作有参考意义，且具有一定的人体转化应用潜力，值得关注。

代谢紊乱沃氏嗜胆菌高脂饮食鼠李糖乳杆菌CNCM I-3690 Lactobacillus rhamnosus CNCM I-3690

柔嫩梭菌群

Microbiome：肠道中的柔嫩梭菌群噬菌体或与IBD相关

柔嫩梭菌群噬菌体 Geoffrey D Hannigan Patrick D Schlossa

益生菌

FM：下一代益生菌候选——柔嫩梭菌

这是系统研究柔嫩梭菌不同菌株的特性，并阐述其潜在的益生作用，推荐阅读。

益生菌柔嫩梭菌群 Zengliang Jiang Minjie Zhao Hui Zhang

脊柱关节炎

ARD：脊柱关节炎患者的粪便菌群失调

① 分析比较脊柱关节炎患者、类风湿关节炎患者及健康对照者的粪便菌群组成；② 与健康人相比，脊柱关节炎患者、类风湿关节炎患者的粪便菌群均失调，且呈现出疾病特异性，菌群多样性降低；③ 脊柱关节炎患者的粪便菌群中，活泼瘤胃球菌的丰度相对于另外2组人群增加了2-3倍，且与有IBD病史的患者的疾病活动度呈正相关；④ HLA-B27+与HLA-B27-的健康兄弟姐妹之间的菌群组成亦表现出显著差异，说明遗传背景可能影响肠道菌群组成。

脊柱关节炎 Ankylosing spondylitis infection Inflammation rheumatoid arthritis

early life

ISME：生命早期的特定肺部菌群对哮喘至关重要

生命早期，怎样的细菌会对哮喘产生决定性作用？至少在这个小鼠实验中发现：鼻腔内接种肺部细菌影响过敏性哮喘发展的结果，菌株CNCM I 4970加剧某些哮喘特性，而pro-Th1菌株CNCM I 4969却有保护作用。很重要的研究，推荐给大家。

early life allergic asthma lung microbial components susceptibilities Hamed Khalili

结肠炎

Nature子刊：CARD9基因缺失，菌群代谢色氨酸受阻，结肠炎加重

宿主基因如何影响肠道菌群，并进而影响肠道炎症和健康，这个重要研究给了直接的证据，好文推荐。

CARD9 IL-22 结肠炎芳香烃受体配体 IBD

真菌

Gut：IBD患者的肠道环境利于真菌而不利于细菌？

① 分别用16S及ITS2测序方法测定235例炎症性肠病（IBD）患者与38名健康受试者（HS）粪便中细菌与真菌的组成；② 与HS相比，IBD患者肠道环境更有利于真菌生长，多样性及组成发生改变，酿酒酵母比例降低，白色假丝酵母比例增加，担子菌门与子囊菌门比值升高；③ 对同一受试者菌群的共存分析表明细菌和真菌成分之间存在相关性，IBD患者与HS不同，提示特定疾病性跨界改变的存在；④ 与IBD或IBD严重程度相关的遗传多态性可能影响真菌微生物群失调。

IBD 真菌