HIV

艾滋病患者经抗病毒治疗后，尽管可以有效降低病毒的复制和载量，但是有很多患者（INR）的CD4免疫细胞不能恢复到正常水平。因此，INR仍然面临着更高的合并症的发生和高的死亡率。导致INR CD4免疫细胞不能恢复的原因有很多，但是其中一个重要的发现是其记忆性CD4 T细胞的线粒体功能障碍，但其记忆性CD4 T细胞线粒体功能障碍的原因尚不清楚。近期一篇发表在Journal of Clinical Investigation上的研究工作，通过对三个独立中心的人群队列的CD4 T细胞的代谢研究发现，INR CD4 T细胞中含有较高水平的对甲酚硫酸盐（PCS）和硫酸吲哚基（IS）组分；体外实验显示这些组分在体外导致线粒体结构和功能障碍，抑制CD4 T细胞的增殖，而这些组分升高的原因可能是INR患者肠道中富集了产PCS和IS的菌群。这些研究成果为艾滋病临床治疗提供了重要的线索和科学依据。

HIV感染治疗后无免疫应答患者（INR）记忆性CD4-T细胞代谢组学对甲酚硫酸盐（PCS）硫酸吲哚基（IS）

益生菌

VISBIOME ES益生菌对HIV感染患者无治疗作用

Open Forum Infectious Diseases上发表的一项2期临床结果，在93名接受抗逆转录病毒治疗的HIV感染患者中进行24周的干预，发现VISBIOME ES益生菌（包含8种益生菌菌株）未能显著改善sCD14水平、炎症标志物及肠道通透性。

益生菌研究论文医学研究 HIV感染 2期临床试验

肠道病毒

肠道病毒组与肠道的病毒“蓄水池”作用（综述）

Gut上发表的一篇综述文章，介绍了在炎症性肠道疾病及肠道肿瘤中的肠道病毒组变化，并讨论了肠道作为病毒（HIV及SARS-CoV-2）蓄水池的机制。

肠道病毒综述 HIV 新冠病毒

HIV

SIV感染后的胃肠腔微囊泡影响易位细菌的生长

HIV感染后的菌群易位促进了持续性的炎症。Mucosal Immunology上发表的一项最新研究，在SIV感染后的恒河猴中发现，从胃肠道内腔分离出的微囊泡中，5种miRNA减少，而抗菌肽——β-防御素1增加，这些微囊泡可在体外抑制唾液乳杆菌（常见的易位细菌）的生长。

HIV 研究论文胞外囊泡基础研究 SIV

粪菌移植

粪菌移植恢复HIV感染患者的肠道菌群失调

Nature Communications上发表的一项临床研究结果，纳入29名HIV感染患者，14名服用粪菌胶囊，15名服用安慰剂，持续干预8周，并随访至48周。粪菌移植可显著增加患者的肠道菌群α-多样性，供体菌群的定殖可使毛螺菌科及瘤胃球菌科富集，从而恢复HIV感染相关的菌群失调。另外，粪菌移植可降低患者血浆中的肠道脂肪酸结合蛋白（肠道损伤的生物标志物）的水平。

粪菌移植研究论文以人为对象的临床试验医学研究 HIV

宿主-菌群互作

生活方式与肠道寄生虫对肠道菌群的影响

非洲人的基因组、表型及文化多样性为研究宿主-菌群共进化及其对适应性表型的影响提供了一个独特的机会。Genome Biology上发表的一项最新研究，通过分析对比不同种群及不同生活方式的喀麦隆人的肠道菌群、肠道寄生虫及免疫指标，发现生活方式及肠道寄生虫的存在显著影响了菌群的组成与多样性，并对宿主免疫应答产生显著影响。

宿主-菌群互作 gut microbiome hunter-gatherers parasites helminths

HIV感染

HIV感染者的口腔菌群与肺功能相关

HIV感染 HIV Microbiome Saliva Stool

HIV感染

HIV感染对肠道菌群α多样性的影响

《Clinical Infectious Diseases》上发表的一项荟萃分析结果，对超过1000份样本的原始测序数据进行分析后发现，HIV感染与肠道菌群α多样性的降低显著相关，而性别及性取向影响了这种相关性。

HIV感染 HIV AIDS Microbiome 荟萃分析

细菌易位

细菌易位促进HIV感染者产生自身抗体

细菌易位 Autoantibodies Plasma microbial 16S rDNA staphylococcus HIV

HIV感染

老年HIV感染者的肠道菌群变化

HIV感染 aging HIV Inflammation Microbiome

糖尿病

与HIV感染或高危女性的糖尿病相关的肠道菌群及血浆代谢产物

糖尿病 Diabetes Gut microbiota HIV Metabolite

肠道菌群失调

Nature子刊：肠道菌群失调不足以加剧慢病毒感染疾病进程

HIV感染者中存在肠道菌群失调，可能加剧疾病进程。Nature Medicine近期发表一项在恒河猴中的研究，却给出了不同的结论。

肠道菌群失调 SIV HIV Fabrice Laurent Andrés Palencia

骨折

COHA：HIV感染者的肠道菌群改变，或增加骨折风险（综述）

这是关注HIV感染者的骨密度改变与肠道菌群相关性的综述，值得关注，特别推荐。

骨折 HIV感染 HIV

阴道菌群

Science：预防病原体感染，阴道菌群至关重要

阴道菌群不同，抗HIV药物替诺福韦的预防效果显著不同，菌群之作用，可见一斑。Science的重量级研究和简介一并推荐给大家。

阴道菌群乳酸菌阴道加德菌 HIV感染 HIV

阴道菌群

Science：阴道细菌不同，抗HIV药物的疗效迥异！

阴道菌群不同，抗HIV药物替诺福韦的预防效果显著不同，菌群之作用，可见一斑。Science的重量级研究和简介一并推荐给大家。

阴道菌群乳酸菌阴道加德菌 HIV

转录组

PLoS P：HIV感染后，肠道里的CD4+ T细胞的转录组变化

关于HIV感染后，肠道特定细菌如何决定CD4+ T细胞的转录组变化，推荐阅读。

HIV 转录组

生殖道菌群

Immunity：黏膜微生物如何帮助抵抗病毒感染？

这是对之前我们分享的一篇文章（http://mc.gutgutgut.cn/papers/read/1070673792）的简介，老规矩，这样的文献，看看图就有大收获。

生殖道菌群 HIV Lilian Calderón-Garcidueñas Lilian Calderón-Garcidueñas

HIV

JI：肠道菌群与HIV感染到底有何关联？（综述）

关于HIV感染和肠道菌群的综述，特别推荐！

HIV gut microbiome host response mechanism analytical method biomolecules

Bronchial brushing

BMC PM：HIV感染对肺部菌群有何影响？

慢阻肺(COPD)是HIV感染者的一个重要并发症，HIV感染者的肺部菌群会发生什么变化？这篇文章值得看看。

Bronchial brushing Bacterial microbiome HIV Lungs GENE EXPRESSION

中国HIV感染者

SR：感染HIV的中国人，粪便菌群有何变化？

李兰娟院士等新发表的研究，值得看一看。

中国HIV感染者高效抗逆转录病毒治疗 HIV 肠道菌群多样性肠道菌群紊乱

婴儿菌群

STM：母亲感染HIV改变婴儿菌群，并让婴儿更易夭折

最近有很多关于HIV感染对肠道菌群影响的研究，这篇Science Translational Medicine上的研究关注母亲的HIV感染对未感染婴儿的影响，水平很高，值得一看。

婴儿菌群母乳寡糖 HIV Laure Bindels Jens Walter

HIV

TR：HIV感染中的肺部菌群（综述）

HIV感染后，肺部菌群会如何变化，这篇综述再次带给我们启示。

HIV Brandy Frost Kristen M Welsh

艾滋病

BMC医学：肠道菌群作HIV治疗靶点，可能么？

一篇肠道菌群与HIV关系的综述，值得一读。

艾滋病 HIV 抗逆转录病毒疗法肠道失衡 CD4+ T细胞

肠道菌群

SR：HIV感染后，肠道菌群代谢有何特殊改变？

HIV感染造成肠道菌群代谢改变，这种改变与系统性红斑狼疮、艰难梭菌感染相关腹泻等疾病造成的改变不同，具体是怎样的？看看本文。

HIV 肠道菌群代谢 Claudia Barelli Davide Albanese

肠道菌群

艾滋病中的肠道及口腔菌群：专题讨论会报告

① 近期的许多研究表明HIV感染后宿主体内菌群受到扰动； ② 包括潜在致病菌在内的细菌易位与许多HIV并发症相关； ③ 开始出现更多的将益生菌及益生元应用于HIV相关疾病的研究； ④ 菌群与艾滋病的关联仍需更多的研究； ⑤ 本文为相关领域的专题讨论会报告总结。

HIV 肠道菌群口腔菌群细菌易位益生菌

艾滋病

与HIV相关肠道微生物已经逐步“病毒化”

HIV 艾滋病微生物组病毒组真菌组

艾滋病

SIV感染引起的肠道细菌微生物组和病毒组变化与免疫缺陷有关，并可通过疫苗预防

① 对恒河猴进行猴免疫缺陷病毒（SIV）感染后，CD4 T细胞减少个体的肠道病毒体和细菌微生物群的变化更为突出；② 感染动物中检测到的腺病毒科序列数量增加，其中胃肠腺病毒、腺相关病毒和小核糖核酸病毒的含量升高，进而引发胃肠道疾病；③ SIV感染严重的恒河猴肠道菌群β多样性明显改变，肠杆菌科和摩拉菌科细菌丰度增加；④ 有效接种疫苗后，可以预防免疫缺陷，抑制破坏肠道上皮屏障的潜在致病细菌和病毒，防止肠道中病原体的出现。

艾滋病 SIV 腺病毒圆环病毒小核糖核酸病毒

艾滋病

人类免疫缺陷病毒-获得性免疫缺陷综合征中病毒和细菌微生物的改变

① 对乌干达感染或未感染艾滋病毒、接受抗逆转录病毒治疗或未经治疗的受试者肠道病毒和细菌微生物进行分析，探讨与免疫缺陷的关系；② 外周血CD4 T细胞的降低与肠腺病毒序列的扩增有关，但这种扩增与抗逆转录病毒的治疗无关；③ CD4 T细胞降低的患者肠道菌群系统发育多样性和丰度降低；④ 特异性细菌的丰度存在差异，与炎症相关的肠杆菌科细菌增多；⑤ 艾滋病毒感染者的免疫缺陷与肠道病毒、细菌菌群的改变有关，有助于艾滋病相关肠病的进展。

HIV 艾滋病艾滋病相关肠病腺病毒全身性炎症