metabolome

生酮饮食是一种有趣的治疗阿尔茨海默病的候选治疗方法，因为其对代谢失调和癫痫有保护作用。肠道微生物群对于生酮饮食介导的神经保护以及胆汁酸的调节至关重要。近日，Rob Knight团队在Alzheimer's and Dementia发表最新研究，纳入9名患轻度认知障碍和11名认知正常的糖尿病前期成人，接受低脂饮食或改良地中海生酮饮食治疗6周，经6周洗脱期后更换成替代饮食，发现改良地中海生酮饮食可能通过调节GABA水平和肠道转运时间，使患有轻度认知障碍的成年人受益。

饮食干预认知障碍患者 Alzheimer’s disease ketogenic diet low-fat American Heart Association Diet (AHAD)

蜜蜂菌群

国内团队：东方蜜蜂和西方蜜蜂间肠道细菌存在遗传分歧和功能趋同

研究已发现菌株水平多样性可能导致不同宿主肠道微生物群落的功能基因谱相似或异同。目前，在自然微生物群落中，种内基因组变异对肠道菌群的功能贡献尚不清楚。东方蜜蜂和西方蜜蜂是两种关系密切的蜂种，肠道内被一组类似的由宿主特异性菌株组成的核心细菌定植，是研究种内多样性的良好模型。近日，浙江大学的郑火青、Ye Feng、胡福良及团队在Journal of Advanced Research发表最新研究，发现东方蜜蜂和西方蜜蜂核心菌种的菌株组成具有宿主特异性，两种蜂种间大多数核心菌种存在功能差异，但二者肠道菌群的总体功能谱趋同。总之，该研究为探究蜜蜂共生菌群的进化和功能作用提供了新见解。

蜜蜂菌群种内多样性研究论文基础研究昆虫（果蝇、蜜蜂等）

多组学分析

毛细支气管炎分型不同，患哮喘的风险存在差异

患有鼻病毒(RV)感染，特别是毛细支气管炎的儿童是哮喘的高危人群，并且临床证据表明鼻病毒(RV)感染的毛细支气管炎存在临床异质性。然而，对这些生物学上不同的亚群(分型)及其与患哮喘的关系知之甚少。Journal of Allergy and Clinical Immunology发表的文章，通过整合临床、病毒、鼻咽微生物组、细胞因子和代谢组数据，确定了鼻病毒(RV)感染的毛细支气管炎分型，并研究了各分型与哮喘风险的关系。结果表明，鼻病毒(RV)感染的毛细支气管炎可以分为四种类型（A、B、C、D型），这种分型具有生物学意义。对于D型，其特征是先前使用抗生素、嗜酸性粒细胞增多、IgE致敏、鼻病毒C(RV-C)感染、莫拉克斯氏菌属主导的微生物群、高T2细胞因子反应，D型儿童后期患哮喘的风险最高。本研究结果可以为早期识别处于气道发育重要时期的高危儿童提供证据基础，并将有助于进一步制定哮喘预防策略（如改变微生物群和宿主反应）。

多组学分析哮喘 integrated-omics Microbiome metabolome

焦虑

菌群代谢物或提高小鼠对应激性焦虑和抑郁的恢复力

慢行应激会破坏免疫稳态，而肠道微生物代谢产物则会减弱炎症，从而提高机体对应激诱导的免疫和行为异常的恢复能力。Brain Behavior and Immunity近期发表的文章，发现益生菌和富含多酚的后生元联用可减轻机体回肠和大脑中应激性免疫和行为异常，描述了一种新的联合生物治疗慢性应激性行为损伤的方法，同时定义了肠道微生物-宿主相互作用调节周围和脑免疫系统的潜在机制。

焦虑抑郁 gut-brain-axis Gut microbiota adaptive immunity

副干酪乳杆菌KBL382

特定副干酪乳杆菌菌株或可用于缓解特应性皮炎症状

特应性皮炎（atopic dermatitis，AD）是一种慢性、复发性、炎症性皮肤病，临床以反复发作的慢性湿疹样皮疹为主要表现，伴有显著的皮肤干燥和瘙痒。特应性皮炎目前还无法治愈，可严重影响生存质量。益生菌的使用与免疫调节和肠道菌群组成的变化有关，可缓解特应性皮炎症状。发表在Gut Microbes上的一项以AD模型小鼠的研究表明，从健康韩国人粪便中分离的副干酪乳杆菌KBL382菌株通过调节免疫反应和改变肠道菌群组成，显著改善AD小鼠的AD症状，表明KBL382在减轻AD症状方面的潜在应用。

副干酪乳杆菌KBL382 特应性皮炎 Lactobacillus paracasei atopic dermatitis Immunomodulation

色氨酸代谢产物

肠道菌群衍生的色氨酸代谢产物及其激活芳香烃受体的能力

肠道菌群产生的一系列色氨酸代谢产物，可通过激活芳香烃受体（AHR）等机制，影响宿主生理功能。Gut Microbes近期发表的一项研究，对小鼠盲肠内容物和人类粪便中提取的色氨酸代谢物进行了鉴定和量化，包括4种新的色氨酸代谢物，并研究了这些代谢物在生理相关浓度下激活AHR信号的能力等问题。

色氨酸代谢产物芳香烃受体 Ah receptor cecal content indole

褐藻寡糖

农科院：褐藻寡糖调节肠道菌群或能缓解小肠黏膜炎

化疗可诱导肠道粘膜炎，先前的研究发现，褐藻寡糖（AOS）可缓解化疗药物白消安（busulfan）诱导的肠道菌群失调。中国农业科学院的张宏福团队及Yong Zhao团队基于此结果，在Microbiome上发表的一项最新研究，发现在白消安诱导的小肠黏膜炎小鼠中，移植喂食了AOS的小鼠的粪菌后，可调节前者的肠道菌群组成，增加肠道屏障功能相关蛋白的表达，恢复血液代谢产物，从而改善小肠功能。

褐藻寡糖 Fecal microbiota transplantation Alginate oligosaccharides mucositis Busulfan

磷虾油

中国海洋大学：磷虾油调节菌群并缓解肠道炎症的机制

ω-3多不饱和脂肪酸（PUFA）具有抗炎作用，但其在炎症缓解及粘膜愈合中扮演的角色尚未明确。磷虾油是一种富含PUFA的天然产品。来自中国海洋大学的薛长湖团队与国外研究者合作在Microbiome上发表的一项最新研究发现，磷虾油可通过抑制多个炎症信号通路，在体外（THP1细胞系）抑制炎症因子表达，并在体内（小鼠结肠炎模型、猪结肠炎模型）调节肠道菌群并缓解肠道炎症。机制上，磷虾油可通过抑制组氨酸代谢以发挥其抗炎作用。

磷虾油 balance Citrobacter rodentium Colitis helminth

阴道菌群

北京大学深圳医院：阴道菌群或是胚胎反复植入失败的元凶

北京大学深圳医院的钱卫平和樊尚荣合作在mBio发表文章，通过对胚胎反复植入失败（RIF）患者的阴道菌群及代谢产物的研究，首次阐明了RIF的可能发病机制。研究显示阴道菌群中乳酸菌与第一次冷冻胚胎移植妊娠结局具有相关性，且RIF患者的阴道菌群代谢产物具有差异，其中甘油磷脂和苯并吡喃则含量较低。而缺乏由甘油磷脂代谢而来的溶血磷脂酸和前列腺素将导致延迟着床和胚胎拥挤，苯并吡喃作为一种选择性雌激素受体调节剂，可能影响妊娠结局。

阴道菌群 recurrent implantation failure RIF Vaginal microbiota metabolome

菌群-代谢物

东非狒狒不同肠段菌群和代谢物的组成

目前关于不同肠段菌群组成的研究主要集中在老鼠、鸡和狗等动物模型，而对人体或非人类灵长类动物的研究较少。《mSystems》的这篇文章介绍了关于和人类同属灵长类的东非狒狒的研究。相比人类，对东非狒狒的研究避免了取样前的肠道准备工作，因此能保证肠道菌群组成不被影响。该研究发现东非狒狒大肠段关于癌症相关的代谢途径多余小肠，或许能解释人了大肠癌发的概率高于小肠癌发的概率，另外也发现芸苔属蔬菜与肠道有益菌群有关，认为其可作为益生元的候选。

菌群-代谢物 microbiota metabolome Host-Microbiota Interactions nonhuman primate

饮食干预

发育不良学龄儿童接受饮食干预后的代谢组及菌群变化

Clinical Nutrition上发表的一项RCT结果，100名发育不良学龄儿童摄入基于高质量豆类蛋白的微量营养素强化饮食，发现短期（1个月）的饮食干预并未显著促进收受试儿童的生长发育。同时，鉴定出了一些与生长发育相关的血清代谢产物变化及菌群变化，这些变化或可作为衡量饮食干预对儿童生长发育的影响的生物标志物。

饮食干预 stunting intervention Legume protein metabolome

4-甲酚

Cell子刊：4-甲酚或能改善葡萄糖稳态

发表在Cell Reports上的文章，研究结合了体内和体外实验，探究肠道菌群代谢物4-甲基苯酚对胰岛的干预和由此带来的对血糖代谢的调节。研究结果显示，4-甲酚可以促进胰岛素的的分泌和β细胞增殖，从而改善葡萄糖稳态。其相关的作用机理与激酶DYRK1A下调有关。

4-甲酚葡萄糖稳态胰岛β细胞功能 metabolome gut microbiome

饮食-菌群互作

江南大学：不同糖脂比的高能量饮食，导致功能相似的促肥胖菌群

来自江南大学的陈永泉团队在mSystems上发表的一项最新研究，发现给小鼠喂食具有不同的脂肪/糖比值的高能量饮食，均可引起小鼠的前驱糖尿病症状；虽然不同的糖脂比导致小鼠有着不同的菌群组成，但小鼠表现出了类似的菌群基因谱、代谢功能及代谢产物。

饮食-菌群互作 high-energy diet prediabetes Gut microbiota metagenome

脊柱关节炎

脊柱关节炎中的“殊途同归”：不同的菌群失调、相似的代谢扰动

白细胞表面抗原HLB-B27可能通过改变肠道菌群，来促进脊柱关节炎（SpA）发病。《Arthritis and Rheumatology》发表的一项研究，通过分析肠道菌群组成与宿主基因表达的关联，在不同背景的大鼠中鉴定出不同的与炎症相关的肠道细菌，这些肠道菌可能通过扰动相似的代谢途径，来促进SpA炎症。

脊柱关节炎 HLA-B27 Spondyloarthritis (SpA) candidate causal microbes host genetics

食物恐新症

食物恐新症与饮食质量降低及代谢疾病风险增加相关

食物恐新症与不良的饮食方式及较差的食物质量有关，并可能增加肥胖风险。American Journal of Clinical Nutrition上发表的一项前瞻性队列研究结果，发现食物恐新症与患者的饮食质量较差相关，并与2型糖尿病风险增加相关。

食物恐新症 Baltic Sea Diet Score Estonian Biobank cohort cardiovascular disease dietary behavior

慢性肾病

西北大学：茯苓可改善慢性肾病大鼠的菌群和代谢物变化

《Cellular and Molecular Life Sciences》近期发表了由西北大学赵英永团队主导的研究，在慢性肾病大鼠模型中，分析了肠道菌群和血液代谢组的改变，并表明用茯苓和茯苓酸A治疗具有改善作用。相关发现对于研究慢性肾病中肠道菌群的变化和作用，以及通过膳食干预改善疾病，有参考意义。

慢性肾病 Creatinine clearance rate Gut microbiota Hypertension metabolome

自闭症谱系障碍

Cell：自闭症肠道菌群如何促进行为症状？

自闭症谱系障碍（ASD）的特点是重复性和社会性的行为异常，除了遗传因素，ASD患者的肠道菌群也与正常发育人群有异，但菌群对ASD症状有多大作用仍不清楚。《Cell》上线的最新研究，通过对小鼠进行菌群移植，确认了ASD患者的肠道菌群可引起小鼠的ASD样行为异常，并鉴定出调节小鼠ASD行为的特定菌群代谢物，为阐释ASD发病机制和开发新疗法带来启示。

自闭症谱系障碍 Autism spectrum disorder autism gut microbiome microbiota

多组学分析

多组学分析饮食、代谢产物和肠道菌群的关系

《Frontiers in Genetics》近期发表一项基于健康人的研究，着重分析了饮食、肠道微生物组和人体代谢组之间的关联。

多组学分析 Microbiome Diet metabolome Multi-omics analysis

菌群-宿主互作

解码介导宿主-菌群互作的微生物代谢产物（综述）

微生物代谢产物是共生菌群-宿主互作的媒介。《Trends in Pharmacological Sciences》近期发表综述，系统性总结了近年来对菌群代谢产物-宿主互作的研究成果，列举了一系列菌群代谢产物及其作用机制，对于研究菌群-宿主互作的分子机制具有重要参考价值。

菌群-宿主互作菌群代谢物 Gut microbiota Microbiome metabolites

小鼠模型

Cell子刊：研究菌群-饮食-宿主互作的人源化小鼠模型

肠道菌群通过与饮食成分互作，影响宿主代谢，但由于饮食和菌群的复杂性，研究菌群-饮食-宿主互作存在比较大的挑战。《Cell Reports》发表的一项最新研究，建立了一种简化的人肠道菌群小鼠模型，并用该模型分析了膳食纤维、饱和脂肪和蔗糖对肠道菌群的影响，以及菌群-饮食互作对血液代谢物和宿主代谢的具体影响，对于研究菌群内互作和菌群-饮食-宿主代谢互作都很有参考价值。

小鼠模型饮食-菌群-宿主互作 microbiota Diet Transcriptome

哮喘

儿童哮喘肠道代谢组学的综合分析

《Journal of Allergy and Clinical Immunology》发表的一项研究，综合分析了VDAART临床试验中的361名儿童在3岁时的数据，揭示出儿童哮喘相关的肠道代谢物、肠道菌群成员、血浆代谢物和饮食因素，以及这些因素之间的相互关联，对于进一步鉴定哮喘相关标志物以及治疗靶点很有参考意义。

哮喘肠道代谢组 Christensenellaceae Asthma Breastfeeding

吲哚

吲哚在肝病中的保护作用（综述）

《Journal of Internal Medicine》上发表的一篇综述，详细介绍了肠道菌群代谢产物——吲哚在肝病发展中起到的保护性作用，对研究菌群代谢产物对于宿主健康的影响有参考价值。

吲哚 Dysbiosis gut-liver axis metabolome Tryptophan

酒精性肝病

靶向肠道菌群治疗酒精性肝病（综述）

Journal of Hepatology上发表的一篇综述文章，详细介绍了在酒精性肝病中，肠道菌群所起的重要作用，并讨论了以肠道菌群为靶点治疗酒精性肝病的潜在可能。

酒精性肝病 bacterial translocation Dysbiosis Fungi Innate immune system

自闭症谱系障碍

复旦附属儿科医院：自闭症儿童的肠道菌群及谷氨酸代谢变化

来自复旦大学附属儿科医院团队在《mSystems》上发表一项研究，对比自闭症谱系障碍（ASD）儿童与健康儿童，发现ASD患儿的肠道菌群组成发生变化，并伴随着谷氨酸代谢的改变，谷氨酸代谢产物或可作为ASD的潜在生物标志物，而肠道菌群也可能在ASD的发病机制中起到重要作用。

自闭症谱系障碍 autism Glutamate Gut microbiota liquid chromatography-mass spectrometry

酒精性肝病

Gut：生成IL-22的工程菌可减少小鼠酒精性肝病

长期酗酒可使肠道内的抗微生物C-型凝集素Reg3g表达下降，从而增加肠道菌群向肝脏移位，促进酒精性肝病。Gut发表的一项最新研究进一步阐释了其中的菌群-宿主互作机制，揭示了菌群产生的芳香烃受体配体IAA的关键作用，并在小鼠模型中证实，补充生成IL-22的工程益生菌，可减少慢性酒精摄入引起的肝病，有临床应用前景。

酒精性肝病 ILC immune response metabolome Microbiome

益生菌

对一种潜在二代益生菌的安全性评估

mSystems上发表的一项在30名健康志愿者中进行的安全性评估试验，发现产丁酸菌Butyricicoccus pullicaecorum 25-3的安全性及耐受性良好，有成为二代益生菌的潜力。

益生菌 Butyricicoccus pullicaecorum metabolome Microbiome next-generation probiotic

阿尔兹海默症

胆汁酸谱改变与阿尔兹海默症患者的认知障碍相关

来自《Alzheimer's and Dementia》上的一项最新研究，发现在阿尔兹海默症患者中，胆汁酸谱发生了显著变化，而这一变化与认知衰退显著相关，提示了肠道菌群及肠-肝-脑轴在阿尔兹海默症中的重要作用。

阿尔兹海默症 Alzheimer's disease Atlas for Alzheimer Genetic variants gut microbiome

非酒精性脂肪性肝炎（NASH）

浙大一院李兰娟：丁酸盐改善小鼠NASH

非酒精性脂肪性肝炎（NASH） Butyrate microbiota metabolome methionine–choline-deficient diet

性别差异

Cell子刊：短期禁食后，肝脏代谢有性别差异

Cell Metabolism上发表的一项最新研究，发现小鼠肝脏对于短期禁食的应答存在性别差异，雌鼠更倾向于在禁食状态下利用氨基酸合成脂质，而雌激素受体（ERα）在其中起到了重要作用。该研究对开发用于调节能量代谢的性别特异的饮食和药物干预策略，很有参考价值。

性别差异短期禁食氨基酸代谢糖异生雌激素受体

他克林

Hepatology：服用老年痴呆药物他克林之前，检查下菌群？

这是对我们之前分享的文献（http://www.xunludkp.com/papers/read/1083256228）的简要介绍，老规矩，这样的文章看看图就会有收获，特别推荐！

他克林肝脏毒性 Dysbiosis metabolome metagenome