Alexander Khoruts

粪菌移植复发性艰难梭菌感染研究论文

70%的造血细胞移植(HCT)受者发生中性粒细胞减少热(NF)，预防和治疗NF的抗生素会破坏肠道菌群，菌群的失衡预示着更高的移植后死亡率。Clinical Infectious Diseases近期发表的文章，发现异体造血干细胞移植（HCT）后发生中性粒细胞减少性发热（NF）的患者，其肠道菌群中Blautia的丰度较低。提示Blautia可能有助于预防NF，从而减少抗生素使用和移植相关的死亡率。

造血干细胞移植中性粒细胞减少性发热肠道细菌

肠道菌群代谢

肠道菌群影响吃荤或吃素后的硫化氢产生

硫化氢是结肠菌群发酵产生的一种毒性终产物，也是让放屁有臭味的一种物质，可能参与多种疾病的发病机制。Clinical Nutrition上发表的一项最新研究，在12名健康志愿者中进行交叉饮食干预，发现相比于植物性饮食，在摄入动物性饮食后，粪便硫化氢水平显著升高，但个体差异较大。进一步研究表明，受试者的肠道菌群组成显著影响了在摄入不同饮食后的硫化氢产生。

肠道菌群代谢研究论文植物性饮食动物性饮食硫化氢

抗生素

肠道菌群对抗生素的个体化反应

抗生素对菌群的扰动程度因人而异。有假说认为，这种个体化的反应与治疗前的菌群组成有密切关系。然而，这一假说还需要更多人体研究数据的支持。Microbiome近期发表的一项研究，在一个小型的临床队列中进行了分析，表明治疗前菌群中的特定细菌类群可预测抗生素对菌群的扰动程度。因此，针对治疗前菌群的精确干预，或能减少抗生素引起的菌群失调及其不良影响。

抗生素肠道菌群个体化干预

急性白血病

中性粒细胞减少症的菌群和代谢组分析

大多数接受化疗的急性白血病患者虽然进行了抗生素预防，但仍会出现中性粒细胞减少症（NF），其中许多病例没有明确的病因。Blood Advances近期发表的文章，对两群白血病病患进行分析，发现肠道中Akkermansia扩增预示着NF的风险更高。Akk是一个粘液分解菌属，可能影响肠腔代谢物的吸收，对血清代谢组分析表明氧化应激或是主要介导途径，为个体化预防提供了潜在靶点。

急性白血病中性粒细胞减少症代谢互作

肝硬化

菌群耐药基因对肝硬化患者有啥影响？

肝硬化与肠道菌群变化有关，可导致肝性脑病和耐药微生物的感染。然而，肠道微生物抗生素耐药基因(ARG)丰度对临床结果的影响尚不清楚。Gastroenterology近期发表的文章，纳入163例肝硬化患者(43例代偿性肝硬化，20例腹水肝硬化患者，30例肝性脑病患者，70例同时患有腹水肝硬化和肝性脑病的患者)和40例正常个体，研究肝硬化病人肠道微生物组中抗生素耐药基因(ARG)丰度对肝病进展和预后的影响，及利福昔明对抗生素耐药基因(ARG)的影响，同时还比较了肝硬化、慢性肾病和糖尿病患者中ARG的丰度模式。结果表明，肝硬化患者呈现较高的肠道微生物ARG基因，并且通过分析先前的两项研究结果，发现肝硬化的ARG丰度可能高于糖尿病和慢性肾病患者。本研究结果提示，肠道微生物组中ARGs的检测或可用于评估肝硬化预后及作为治疗肝硬化的靶标。

肝硬化抗生素耐药基因肠道微生物组机器学习肝性脑病

非酒精性脂肪肝炎

肠道菌群通过促炎B细胞加重脂肪肝炎

非酒精性脂肪肝炎（NASH）已成为肝移植和肝衰竭的首要原因。肝脏炎症是NASH的关键特征，但其中的免疫学通路尚未充分阐明。Hepatology近期发表一项研究，在小鼠模型中表明，肝脏中的促炎B细胞积累和活化，驱动了NASH中的炎症和纤维化。这种B细胞活化涉及天然免疫和适应性免疫机制，并且在一定程度上是由肠道菌群驱动的。

非酒精性脂肪肝炎肠-肝轴 B细胞肠道菌群

益生菌

如何破除益生菌市场乱象，让大众更好的了解益生菌产品？（综述）

Gastroenterology近期发表的综述，回顾了益生菌的发展历史，介绍了益生菌产品的监管分类，针对如何改善目前益生菌产品健康益处声明中存在的问题，提出了一种解决方案，希望能够促进开展高质量的益生菌研究，增加公众信任，改善市场秩序。

益生菌监管

粪菌移植

Nature Reviews：粪菌移植治疗艰难梭菌感染的机制与药理学

粪菌移植可治愈约90%的复发性艰难梭菌感染。Nature Reviews Gastroenterology and Hepatology上发表的一篇Perspectives，详细讨论了在粪菌移植产品的监管审批中，需要关注的药理学、药代动力学、药效动力学及毒理学评估的各项重点。

粪菌移植艰难梭菌感染药物审批

囊性纤维化

囊性纤维化患者的宿主-肠道菌群互作

囊性纤维化（CF）是白种人中常见的常染色体隐性遗传病，早发性大肠癌是CF患者的一个潜在并发症。Genome Medicine近期发表的一项研究，分析了CF患者结肠粘膜的基因表达和菌群组成的变化，以及二者间的关联，表明宿主-微生物互作可能在CF大肠癌的发病机制中有关键作用。这些结果为CF患者的大肠癌风险预测，提供了潜在的生物标志物。

囊性纤维化结直肠癌 cystic fibrosis Host-microbe interactions gene regulation

血流感染

肠道菌群的特定变化预示着化疗后的血流感染

50%以上的实体瘤患者及80%以上的血液瘤患者在接受化疗后可能发生中性粒细胞减少性发热（NF），其中10-25%的NF是由血流感染造成的。来自Leukemia上发表的一项最新研究，对20名接受化疗的白血病患者进行了一个月的跟踪，发现在粪便菌群中的一些特定变化发生在血流感染及NF之前。

血流感染血流感染中性粒细胞减少性发热化疗 Kevin Champagne-Jorgensen

菌群-免疫互作

Cell子刊：菌群暴露影响小鼠的免疫应答

菌群-免疫互作 infection Listeria monocytogenes polymicrobial sepsis Toll-like receptors

粪菌移植

胶囊式粪菌移植后，患者肠道菌群如何变化

用口服胶囊的形式进行粪菌移植（cFMT），可简单便捷的治疗艰难梭菌感染（CDI），mBio近期发表的一项研究对接受cFMT的CDI患者进行长达1年的随访，分析其肠道菌群变化，揭示出供体菌群对受体菌群的持久影响，鉴定出拟杆菌属在维持受体菌群与供体相似性中具有关键作用。

粪菌移植 Bacteroides capsule FMT donor Engraftment

造血细胞移植

骨髓移植后，肠道菌群多样性恢复，但组成结构面目全非

来自Bone Marrow Transplantation的一篇通信文章，报道了3名白血病患者进行骨髓移植治疗前后的肠道菌群变化，表明虽然菌群的多样性逐渐恢复，但其组成结构与原来有很大差异，这种菌群变化的影响有待进一步研究。

造血细胞移植肠道菌群多样性肠道菌群组成和功能 Christopher M Mazzone Jing Liang-Guallpa

粪菌移植

粪菌移植治疗7天后的菌群，或可预测艰难梭菌感染复发

粪菌移植 Clostridium difficile Encapsulated microbiota Fecal microbiota transplantation machine learning

生物信息学工具

一种新的菌群失调的非参数检验方法

生物信息学工具非参数检验菌群失调 Hans Bisgaard Jonathan Thorsen

粪菌移植

粪菌移植治疗消化道疾病的现状（综述）

来自Clinical Gastroenterology and Hepatology上发表的一篇综述文章，详细介绍了粪菌移植在艰难梭菌感染之外的胃肠道疾病、肝脏疾病中的应用及最新研究进展。

粪菌移植 Clostridium difficile infection Fecal microbiota transplantation INFLAMMATORY BOWEL DISEASE Irritable bowel syndrome

垂直套管胃切除术

AS：抗生素破坏肠道菌群可使减肥手术失效

胃切除术会影响肠道菌群的组成，而肠道菌群是否影响手术结果尚未明确。在小鼠中的研究发现，抗生素破坏肠道菌群，并可能减弱胃切除术的减肥效果。

垂直套管胃切除术抗生素 Suzanne C Segerstrom Suzanne C Segerstrom

粪菌移植(FMT)

Cell子刊：在菌株水平追踪FMT前后的菌群变化

粪菌移植（FMT）是治疗艰难梭菌感染的有效手段，其要素之一是来自供体的细菌在患者肠道中定殖（植入）。哈佛-麻省理工Broad研究所的两位大牛Ramnik Xavier和Eric Alm教授领衔，在菌株水平进行追踪分析，结合机器学习，成功建模预测FMT后患者肠道菌群的植入情况，发现并总结了其中的若干规律。这是FMT疗法研究的重要突破，于上周在Cell Host and Microbe[IF：14.946]上线，值得关注。

粪菌移植(FMT) 细菌植入规律细菌定殖

复发性艰难梭菌感染

Microbiome：粪菌移植治疗CDI可能受到IBD的影响

一项关于粪菌移植治疗艰难梭菌感染的重要研究，发现本身有IBD的CDI患者，菌群变化不大，复发可能性增加。很有意义的临床研究，推荐阅读。

复发性艰难梭菌感染粪便移植（FMT）炎性肠病 Clostridium difficile infection Fecal microbiota transplantation

Autism spectrum disorders (ASD)

Microbiome：粪菌移植显著改善自闭症儿童症状

最近备受关注的一篇日报分享文章，针对18名自闭症儿童的粪菌移植疗法取得很好效果，再次推荐阅读。

Autism spectrum disorders (ASD) clinical trial Fecal microbiota transplant (FMT) gut bacteria Gut bacteriophage

Nature Reviews：彻底理解粪菌移植的机制（综述）

最近一期 Nature Reviews Gastroenterology & Hepatology 上关于粪菌移植机制的综述，希望了解粪菌移植的人可以好好读一读。

Hilary Browne Hilary Browne

微生物组学

Microbiome：人体微生物组学的未来在哪里？

① 2013年7月24日至26日在美国马里兰州的贝塞斯达召开了题为“人类微生物组学:憧憬未来”的学术会议；② 会议汇集了人类微生物组研究领域的专家，旨在全面介绍微生物组研究的现行状态，但更重要的是确定并讨论这个新兴领域研究的不足，挑战和机遇；③ 本报告将总结一下专家演讲报告，并阐述了在继续推动并提供医学转化应用方面，人类微生物组该做什么样的研究。

微生物组学 Jing Sun Jiaming Liu