干细胞

肠道干细胞的持续增殖及其严格调节的上皮细胞分化对于维持肠道上皮屏障及其功能至关重要。饮食和肠道微生物组如何调节这些过程是一个重要但知之甚少的问题。以菊粉为代表的益生元具有影响肠道菌群和调节肠道上皮细胞的能力，从而改善小鼠和人类的健康。Microbiome最新研究表明外源添加菊粉改变结肠菌群组成并影响肠道干细胞功能，从而影响上皮结构。

益生元菊粉上皮细胞重塑研究论文基础研究干细胞

麻风分枝杆菌

Cell子刊：特定致病菌或可促进肝脏生长

麻风病作为一种古老且顽固的慢性传染病，已经困扰人类数千年，其根源来自麻风分枝杆菌（ML）极强的破坏力。近日，英国爱丁堡大学研究人员在Cell Reports Medicine发表最新研究，发现在部分受到感染犰狳体内，麻风分枝杆菌能够对肝细胞进行重新编程，形成新的肝细胞和肝组织，显著增加总肝脏/体重比，同时不会造成损伤、疤痕或肿瘤。总之，该研究提出了一种非常反常的机制，麻风病细菌或可促进犰狳肝脏的无创生长，值得关注。

麻风分枝杆菌肝脏再生研究论文基础研究转录组学

结直肠癌

Nature子刊：化疗或放疗增加健康干细胞的突变负担

全基因组突变分析表明，特定的抗癌药物对癌细胞具有高度诱变性，但抗癌治疗是否诱导正常细胞发生突变尚不清楚。Nature Communications近期发表文章，发现化疗或放疗的系统应用增加了正常肠道干细胞的突变负荷，增加第二癌症发生的风险。

结直肠癌化疗放疗干细胞

禁食

Cell子刊：禁食的生酮作用如何影响肌肉干细胞？

禁食可调节干细胞功能和组织修复。Cell Metabolism发表的一项最新研究发现，禁食产生的酮体可通过HDAC1-p53轴，诱导小鼠的肌肉干细胞进入一种深度静止状态。这虽然不利于肌肉损伤后的修复，但能增强肌肉干细胞的抗逆性和恢复力，从而有助于长期的肌肉组织维持。

禁食 MuSC HDAC p53 fasting

干细胞

Nature Reviews：一文读懂干细胞的代谢调控（综述）

干细胞具有独特的功能，其背后是否也有独特的代谢调控机制？Nature Reviews Molecular Cell Biology近期发表的这篇综述总结了关于干细胞代谢调控的进展，并得出结论，表明干细胞确实具有不同于限制性祖细胞和分化细胞的代谢特征，如其对氧浓度和葡萄糖代谢的偏好、合成及分解途径的调控、对饮食变化的感知和其与微环境发生互作等，以上代谢过程均可调控干细胞的功能，进而影响组织的稳态、再生和肿瘤抑制过程。

干细胞代谢调控

IL-17A

Cell子刊：免疫-干细胞互作调控肠道细胞分化的新机制

IL-17A对维持肠道完整性至关重要，可能在IBD中发挥有益作用，但其组织特异性作用的范围尚不清楚。Immunity发表的文章，发现IL-17A可特异性作用于Lgr5+肠道干细胞，诱导ATOH1表达，促进其向分泌细胞分化。此外，IL-17A通过ATOH1+细胞介导的Lgr5+ ISCs再生来修复DSS诱导的损伤。

IL-17A 肠细胞分化 Lgr5 ATOH1 干细胞

上消化道肿瘤

Cell子刊：一文读懂上消化道干细胞的起源及肿瘤的发生？（综述）

上消化道各器官之间的干细胞组分及上消化道肿瘤如何发生一直是非常复杂的问题。Cell Stem Cell发表的一项综述系统地阐述了上消化道干细胞的生物学及其作为癌症起源细胞的作用，并总结了上消化道在化生和癌变过程中的干细胞微环境和干细胞之间的互作。此外，该综述还回顾了正在开发的新方法如单细胞测序和类器官培养等，以期更好地推进对上消化道的干细胞和肿瘤领域的研究，值得一看！

上消化道肿瘤干细胞肿瘤发生新兴技术

干细胞

饮食干预或可调节干细胞的行为（综述）

干细胞的局部微环境可以影响干细胞的行为，而生物体的整体代谢状态或代谢物本身可以作为生态位的组成部分来改变干细胞的命运。宏观饮食干预如热量限制、生酮饮食和高脂肪饮食以不同的方式系统地改变机体的代谢状态。然而，有趣的是，这些饮食干预也倾向于增强干细胞的自我更新。Genes and Development近期发表综述文章，介绍了饮食变化对干细胞在组织中行为的影响，阐明了不同的干预措施诱发类似的干细胞表型的机制，表明了代谢对稳态和疾病状态的干细胞行为的重要性。

干细胞饮食干预

结肠癌

Nature子刊：组蛋白甲基转移酶Mll1或调控肠道肿瘤发生

Wnt/β-catenin信号对肠癌的发生及肠癌干细胞的维持至关重要。Nature Communications近期发表文章，发现组蛋白甲基转移酶Mll1是Wnt驱动肠道癌症的一个调控因子，Mll1调控干细胞基因表达，调控维持癌症干细胞的重要转录因子Gata4/6表达，从而促进Wnt驱动肠道肿瘤的发生。

结肠癌组蛋白甲基转移酶干细胞表观遗传

结直肠癌

Nature子刊：高通量自动化类器官培养辅助药物开发和诊断

干细胞来源的上皮类器官通常用于组织的生物学和生物医学模型。然而，在固体胞外基质中培养干细胞较为复杂，且缺乏标准化和质量控制，这阻碍了类器官在工业规模中的常规使用。最新发表在Nature Biomedical Engineering的研究报道了一个微工程细胞培养装置，以及可伸缩的、自动化的悬浮培养方法，可对聚合物-水凝胶基质内的微腔阵列中数以千计的单个胃肠类器官进行实时分析。该类器官培养方法可用于药物开发和诊断。

结直肠癌研究论文类器官干细胞药物筛选

结直肠癌

复旦大学团队：DACH1调控BMP信号促进结直肠癌发生

DACH1在LGR5+肠干细胞（ISCs）和结直肠癌种高度表达，但其在肠干细胞和结直肠癌发生中的作用仍不清楚。复旦大学的蔡三军、华国强和彭俊杰团队合作在EBioMedicine上发表文章，对DACH1在维持ISCs细胞干性、促进结直肠癌发生的功能进行研究，揭示出DACH1或是结直肠癌患者的一个潜在预后指标和治疗靶点。

结直肠癌 DACH1 organoid stem cells BMP signalling pathway

肠道肿瘤

抗生素联合JNK抑制剂治疗肠道肿瘤

所有动物的肠上皮形成一个紧密的屏障，上皮细胞调节营养物质的吸收，增强免疫反应，防止全身性感染。最新发表在PNAS的研究通过敲低骨形态发生蛋白（BMP）建立果蝇肠道肿瘤模型，研究微生态平衡与肠道肿瘤的关系。该研究揭示了肠道肿瘤和微生物之间一个依赖于JNK通路的反馈放大回路，并强调了控制JNK信号活性水平以维持上皮屏障功能和宿主-微生物稳态的重要性。

肠道肿瘤 stem cells epithelial barrier defects host–microbe homeostasis JNK

干细胞

Nature子刊：单细胞测序揭示胃肠道Wnt通路调控机制

Wnt信号通路在促进胃肠道表皮再生和发育中具有功能保守性，但是胃部Wnt配体来源缺乏定论。发表在Nature Communications上的研究通过单细胞转录组测序，在胃肠道中鉴别出了表达Wnt配体周细胞样基质细胞，阐释了Hh信号通路以及转录因子GLI2对这群细胞中Wnt信号通路的调控机制。该研究结果证明了胃肠道中的干细胞具有功能冗余性，从而保证消化道表皮细胞再生和发育。

干细胞单细胞测序胃肠道基质细胞 Wnt信号通路胃肠干细胞

结直肠癌

Nature子刊：大肠癌转移起始细胞的再生来源

具有干细胞样特性的转移启动细胞提高癌症致死率，但其起源及其与原发肿瘤启动干细胞的关系尚不清楚。最新发表在Nature Cancer的研究发现人结直肠癌（CRC）中表达L1CAM的细胞具有转移启动能力，并定义了它们与组织再生的关系。

结直肠癌 L1CAM 类器官干细胞转移起始细胞

衰老

Cell子刊：禁食和二甲双胍，重焕衰老干细胞活力，促髓鞘再生

随着衰老，少突胶质前体细胞（OPC）无法生成新的少突胶质细胞，与多发性硬化（MS）中不可逆的神经退变相关，因此，再生疗法在治疗慢性脱髓鞘疾病方面有很大的潜力。Cell Stem Cell近期发表的一项研究发现，在衰老过程中OPC的促分化能力逐渐降低，与细胞内在的衰老特征有关，而禁食和二甲双胍治疗可使衰老的OPC重焕活力，促进髓鞘再生，或能用于治疗MS等慢性脱髓鞘疾病。

衰老 CNS regeneration adult stem cell aging dietary restriction

胃干细胞

Cell子刊：胃峡干细胞是胃腺上皮更新的主力军

胃腺是胃粘膜上皮凹陷形成的腺体结构，从下往上可分为基底部、颈部、峡部和凹部四个区域。与肠隐窝底部的肠道干细胞不同，胃腺基底部的干细胞在大多数时间都处于静息状态，仅在上皮损伤时才被激活，因此必然存在其它干细胞来维持胃腺和胃上皮的快速细胞更新。有研究认为，胃腺的峡部也存在干细胞，但对于这种干细胞，人们所知有限。Cell Stem Cell近期发表的一项研究，通过多种试验手段对小鼠的胃峡干细胞的特性进行了深入分析。

胃干细胞 gastric corpus isthmus stem cell two stem cell compartments punctuated neutral drift unbiased genetic labeling

干细胞

Nature子刊：Rspo维持胃肠干细胞，也促进其抗菌表型

R-Spondin（Rspo）蛋白家族是一类分泌型蛋白，可激活Wnt信号，调节干细胞。Nature Cell Biology近期发表研究，用小鼠和类器官等试验方法，表明Rspo不仅参与维持Lgr5+胃干细胞的干细胞特性，还可促进其向分泌型表型分化，产生抗菌蛋白，可抵抗幽门螺杆菌定植。

干细胞幽门螺杆菌感染干细胞分化抗微生物蛋白抗感染

益生菌

庾庆华：肠道益生菌调控肠干细胞增殖和分化机制的研究

南京农业大学动物医学院的庾庆华副教授发表了《肠道益生菌调控肠干细胞增殖和分化机制的研究》，介绍了罗伊氏乳杆菌D8对肠道干细胞的影响

益生菌干细胞

饮食与细胞发育

Cell子刊：膳食胆固醇影响干细胞分化

组织稳定性受发育信号和环境因素对干细胞功能的影响，与肿瘤发生相关。本研究发现膳食胆固醇可通过调控细胞内发育信号和代谢状态，长期影响肠道等组织的干细胞分化，对研究饮食结构对特定肿瘤的形成具有参考价值。

饮食与细胞发育 Drosophila Notch signaling cholesterol development

潘氏细胞

Cell子刊：辐照损伤可诱导潘氏细胞的多能性

潘氏细胞参与许多胃肠道疾病的发病机制。Cell Stem Cell上发表的一项最新研究显示，辐照可诱导部分潘氏细胞去分化而获得干细胞多能性，辐照后的潘氏细胞可在体外分化成类器官。在机制上，辐照可通过激活Notch信号通路以诱导潘氏细胞的去分化。

潘氏细胞干细胞

干细胞

Immunity：静息状态的干细胞可逃避免疫监视

在肠道、卵巢及乳腺等部位中，活跃状态下的干细胞可被T细胞清除；而在毛囊及肌肉等组织中，静息状态下的干细胞可逃脱T细胞的杀伤。这项发现或可解释，早期的肿瘤细胞为何能够躲过免疫系统的监视。

干细胞免疫逃逸 Nlrc5 MHC class I T cell

干细胞

Nature Reviews：肠胃和结肠癌领域中的干细胞研究亮点（年度回顾）

这是近期在Nature Reviews Gastroenterology and Hepatology[IF：13.678]发表的与消化道功能和癌症相关的干细胞研究的年度回顾，重点总结了肠道和胃部干细胞的信号调控、新的干细胞标记物和体外类器官培养等方面的进展，值得专业人士特别关注。

干细胞 stem cell Falk Hildebrand Peer Bork

生物钟

Cell：衰老和热量限制如何影响肝脏代谢通路的节律性

生物钟 circadian clock aging Acetylation NAD

干细胞

CMBL：母乳里都有什么细胞？（综述）

母乳里除了基本的营养物质，还包含免疫细胞、母乳菌群等细胞，这篇综述全面介绍迄今为止关于母乳中细胞的研究，IF不高，但值得特别推荐。

干细胞淋巴细胞母乳祖细胞母乳菌群

衰老

COM：控制干细胞和菌群的“衰老蛋白”（综述）

这是Current Opinion in Microbiology[IF：6.635]发表的关于叉头框蛋白O3（FoxO）如何在调控与衰老、免疫有关的菌群结构中发挥作用的综述，干货不少，特别推荐专业人士阅读。

衰老先天性免疫抗菌肽干细胞叉头框蛋白O3

同种异体脂肪间充质干细胞

Lancet：间充质干细胞治肛瘘，有巨大进步！

评论Julián Panés和同事的研究，特别提到干细胞治疗克罗恩病人的肛瘘，虽然目前还比较昂贵，但未来费用会降下来。

同种异体脂肪间充质干细胞复杂性肛瘘同种异体干细胞干细胞 IBD

复杂性肛瘘

Lancet：干细胞治疗克罗恩病人的复杂性肛瘘，有效！

复杂性肛瘘同种异体脂肪间充质干细胞同种异体干细胞干细胞 IBD

方法学

TM：研究肠道微生物组，都有哪些新兴技术？（必读综述）

① 系统总结90年代以来肠道菌群研究的技术发展历程；② 下一代测序技术：彻底改变了确定微生物种类、它们在健康和疾病中角色的研究方法；③ 新培养技术：许多之前不能培养的微生物现在得以培养，得以洞察群落的动态和网络关系；④ 干细胞和组织工程技术：类器官构建成为现实，助力经济的、高通量的微生物组研究；⑤ 菌群干预技术：益生元、益生菌、噬菌体、粪菌移植等成为塑造微生物群落组成和功能、预治疾病的新工具。

方法学下一代测序细菌培养微生物培养干细胞

高脂饮食

干细胞：饮食中的脂肪促进肠道的调节异常

这是介绍《高脂饮食促进肠道祖细胞的多能性和致癌性》这篇文章的新闻报道。简单的说，就是在小鼠实验中发现，一种高脂饮食能够促进肠道母细胞转变为更加像干细胞的状态，从而能够改变肠道的大小，并增加发生肿瘤的可能性。

高脂饮食脂肪营养学干细胞癌变

高脂饮食

高脂饮食提高肠道细胞干性和致癌性

① 高脂饮食（HFD）过氧化物酶增殖受体δ（PPAR-δ）信号在肠道干细胞和祖细胞的中表达，其诱导的肥胖会使哺乳动物的Lgr5+肠道干细胞数目及功能增加；② 药物刺激PPAR-δ活性增加也会引起同样的细胞增生；③ HFD中的脂肪酸能在体外以激活PPAR-δ方式促进肠道类器官的自我更新潜力；④ 激活的PPAR-δ信号通路赋予类器官形成祖细胞的能力，而当肿瘤抑制因子Apc缺失后， PPAR-δ信号通路可导致肠道祖细胞形成肿瘤，与上调β-catenin基因有关。

高脂饮食脂肪营养学干细胞癌变