Niv Zmora

2015年，以色列魏茨曼科学研究所的两位Eran带领团队开发了一种机器学习算法，能基于临床和菌群数据预测个人的餐后血糖反应，将机器学习与精准营养结合起来，是当年的Cell十佳论文之一（https://www.mr-gut.cn/papers/read/1053870848）。近期他们在Diabetes Care发表了后续研究的新进展，探索了针对预测餐后血糖的靶向性饮食干预对前驱糖尿病患者血糖控制的改善作用，并将其与公认的健康饮食——地中海饮食的干预效果进行了对比，为个性化的精准营养研究迈出了重要的一步。

个性化饮食干预餐后血糖血糖控制前驱糖尿病

益生菌

Nature子刊：益生菌如何影响肠道耐药组？

抗菌药物耐药性对人类健康构成严重威胁，而肠道菌群含有丰富的耐药基因，且可从共生菌向病原菌传递，被称为肠道耐药组。益生菌通常被许多健康人食用或与抗生素联合使用，而益生菌对肠道耐药组的影响仍不清楚。Nature Microbiology近期发表的文章，通过分析肠道原位（经内镜取样）的耐药组，发现虽然益生菌可减少未经抗生素治疗的易定植（而非抗定植）个体的肠内耐药基因的数量，但抗生素治疗后，益生菌会使耐药组扩张。同时，研究发现粪便样本无法反映肠道原位的耐药组，因此直接从肠道原位采样对分析益生菌和抗生素对肠道耐药组的影响非常重要。

益生菌耐药基因个体特异性抗生素

急性肝衰竭

Nature子刊：肠道菌群协同MYC通路共同驱动急性肝衰竭

急性肝衰竭（ALF）是一种突发性的，致死率极高的疾病，ALF发展过程中变化的细胞、基因以及肠道菌群的影响仍不清楚，因此治疗措施仅局限于肝移植以及辅助性的治疗。Nature Medicine上发表的一项研究，对肝衰竭小鼠模型单细胞转录组学进行分析，发现并定义了新的星状细胞、内皮细胞、Kupffer细胞的myc-依赖性的激活，并发现这些细胞的激活是由肠道菌群所介导的；同时，文章还发现了如Ly6Chi单核细胞在ALF肝组织中的浸润。该文章将单细胞转录组与肠道菌群结合，全方位的揭示了肠道菌群在ALF中的作用，为寻找设计通路特异性的干预药物的研究提供了有力的依据。

急性肝衰竭研究论文基础研究啮齿动物（小鼠）单细胞转录组学

饮食-免疫互作

在不同疾病中，营养物质如何调控先天性免疫（综述）

Annual Review of Nutrition上发表的一篇综述文章，详细介绍了各种饮食组分与先天性免疫互作的机制，以及饮食-菌群-免疫三者之间的复杂互作，并概述了饮食-先天性免疫互作在各种疾病（包括代谢疾病、过敏性疾病、自身免疫/炎症疾病、感染、癌症）中的调控作用，最后讨论了通过精准营养策略（包括益生菌，粪菌移植等）改善宿主免疫和代谢的潜在可能。

饮食-免疫互作 Nutrition innate immunity microbiota Microbiome

代谢炎症

Nature Reviews：代谢疾病中的肠道菌群与代谢炎症（一图读懂）

低度炎症是代谢疾病的一大特征，越来越多证据显示，这些疾病中存在肠道菌群及其代谢物的变化和肠道屏障功能障碍。菌群及其代谢物穿过肠道屏障发生移位，对肠道以外的代谢器官产生影响，促进代谢炎症。Nature Reviews Immunology发表的重磅综述，探讨了肠道菌群和肠屏障功能紊乱在代谢炎症中的作用。我们将其中的插图改制为一图读懂，希望能助你涨知识。

代谢炎症肠道菌群肠道屏障粘膜免疫肥胖

益生菌

Nature子刊：领域大牛解读益生菌与益生菌研究

益生菌产品广受欢迎，但是益生菌的功效却无定论。《Nature Medicine》近期发表了以色列魏茨曼科学研究院两位益生菌和肠道菌群领域专家的观点文章，介绍了目前益生菌研究的进展、挑战和发展方向，指出需重视益生菌研究的方法学以及规范化，值得参考。

益生菌益生菌研究益生菌机制研究方法 Tessy Boedt

肠道菌群干预

Science子刊：菌群靶向疗法的现状和挑战（观点）

菌群研究进展迅速，为诸多疾病的疗法研发开辟了新的道路。为了庆祝创刊十周年，Science Translational Medicine特别刊发系列文章，其中的第一篇出自Eran Elinav团队，讨论了菌群靶向疗法（饮食干预、益生菌、菌群产物、粪菌移植、噬菌体疗法和改善肠屏障）的研究现状、未来方向和挑战，有不少值得参考的观点，特别推荐给刚接触肠道菌群领域的科研和产业人士。

肠道菌群干预饮食干预益生元个性化营养粪菌移植

饮食与健康

Nature Reviews：吃出健康！解析饮食和菌群的关键作用（综述）

很多疾病都与吃有关，除了饮食本身，肠道菌群也有重要作用。Nature Reviews Gastroenterology and Hepatology本周发表了由Eran Elinav主笔的重磅综述，详细介绍了饮食/营养与菌群领域的相关研究进展：饮食如何影响肠道菌群、饮食与菌群的互作如何影响健康、如何将这些新知识和概念整合到营养干预中，也讨论了目前的研究和转化应用中面临的挑战和解决方法，非常值得专业人士关注。

饮食与健康肠道菌群营养个性化营养 Karine Clément

益生菌

Cell：抗生素治疗后，益生菌干预不利于菌群复原

抗生素治疗后常用益生菌来调理菌群失调，但尚不清楚该过程中益生菌在肠粘膜菌群重建中扮演什么角色。Cell刚刚发表来自以色列魏茨曼研究所两位Eran等主导的另一项研究，表明抗生素治疗后的益生菌干预，并不利于肠粘膜菌群和肠道基因表达的复原，而自体粪菌移植（aFMT）可使其快速恢复。这些发现提示，aFMT或个性化益生菌干预，应是抗生素后促进菌群复原的更佳方法。

益生菌抗生素肠道菌群 Mohammad Miri Ramezanali Khamirchi

肠粘膜菌群

Cell：未来趋势——个性化益生菌干预

益生菌被认为有益健康甚至能预防疾病，然而益生菌在肠粘膜的定殖情况仍待研究。Cell刚刚发表了来自以色列魏茨曼研究所两位Eran等主导的最新研究，分析了小鼠和人体消化道不同部位的样本，提出不应用粪便菌群来近似估计肠粘膜菌群。还通过多组学方法，着重分析了益生菌在人体肠粘膜的定殖情况和规律，及其对宿主的影响。这些结果表明，益生菌干预的效果可存在很大的个体间差异，因此个性化干预应是未来研究和转化应用的趋势。

肠粘膜菌群益生菌粪便菌群肠粘膜菌群个性化干预

结肠炎

Cell子刊：调节一氧化氮代谢可缓解结肠炎及相关结肠癌

一氧化氮在许多生理及病理过程中其重要作用。Cell Reports上发表的最新研究显示，不同细胞产生的一氧化氮在结肠炎中的作用不同，通过调节细胞的一氧化氮代谢可缓解结肠炎及炎症相关的结肠癌。

结肠炎结肠癌一氧化氮 IBD inflammation-associated colon cancer

遗传关联研究

Nature：对菌群的影响，环境大于宿主基因！

# Nature再发菌群分析强文！# 宿主的遗传背景对人类肠道菌群的影响程度一直不甚明了。Nature杂志（IF:40.137）最新发布了以色列魏茨曼科学研究所Eran Elinav & Eran Sega课题组的研究成果，通过一系列遗传学和统计学相关性分析，指出环境因素比宿主基因对肠道菌群结构的影响更加显著，开创性地将“菌群相关性系数（microbiome-association index）”纳入计算模型，利用肠道菌群数据提高对血糖、肥胖等体质特征的预测精度。作者还鲜明提出，通过菌群来改善治疗效果，无须考虑太多宿主遗传背景，可针对人群特征推动。这篇文献具有较强的研究和应用参考价值，非常值得认真看看，特别推荐给大家。

遗传关联研究人类遗传学人肠道菌群 Genetic association study Genetics

先天免疫系统

Nature：先天免疫系统如何与肠道菌群打交道？

① 肠道微生物整合环境、基因和免疫信号影响宿主肠上皮细胞、骨髓细胞、先天淋巴细胞，调节先天免疫系统，影响宿主代谢、免疫和对感染应答产生；② 免疫系统与微生物的反馈环分为肠壁上皮层（抗菌肽）、固有层（细胞因子、趋化因子）、淋巴结和肝脏（菌群产物）；③ 感染、代谢疾病、肿瘤和自身免疫疾病受天免疫和微生物群互作影响，如肝幽门螺杆菌促进免疫细胞过度释放NO致瘤；④ 饮食干预改变微生物群-免疫互作可用于疾病治疗。

先天免疫系统固有免疫系统造血细胞代谢产物生理学

艾滋病

BMC医学：肠道菌群作HIV治疗靶点，可能么？

一篇肠道菌群与HIV关系的综述，值得一读。

艾滋病 HIV 抗逆转录病毒疗法肠道失衡 CD4+ T细胞

餐后血糖

Cell：通过精准预测血糖反应，实现个体化营养

① 纳入800人的研究队列，持续监测一周累计46898次餐后血糖水平，分析相同和不同食物对个体餐后血糖的影响；② 建立了“机器学习”算法，将肠道菌群、血液参数、饮食习惯、健康问卷、身体测量指标等数据结合进行分析，该算法可准确预测受试者的餐后血糖水平，并在100人的独立队列对该算法的准确性等进行了验证；③ 基于该算法的盲法随机对照实验表明，短期的个性化饮食干预成功地降低了餐后血糖水平，并改善了肠道菌群组成。

餐后血糖肠道菌群糖尿病个体化营养血糖水平

生物钟

Cell：生物钟被扰乱，肠道菌群会失调并促进肥胖！

① 小鼠和人体的肠道菌群表现出受摄食节律影响的昼夜振荡，导致一天中菌群组成及功能具有时间特异性；② 宿主的分子生物钟被消除或诱导产生时差均导致摄食节律性受损，驱动肠道菌群异常的昼夜波动及生态失调；③ 时差诱导小鼠或人体肠道菌群失调，促进葡萄糖不耐受及肥胖，该效应可通过肠道菌群移植过继给无菌小鼠；④ 宿主昼夜节律失调导致菌群微生态失调，从而驱动代谢失衡，表明宿主和菌群昼夜节律之间相互作用参与了现代人类代谢疾病发生。

生物钟昼夜节律代谢紊乱肥胖减肥

人工甜味剂

Nature：人工甜味剂伤害小鼠菌群并引起葡萄糖耐受不良

这是2014年发表在Nature上的食品添加剂如何影响菌群并导致葡萄糖耐受不良的研究，这项研究可以与两篇食品乳化剂文献（第一篇：http://www.xunludkp.com/papers/read/1091914540，第二篇：http://www.xunludkp.com/papers/read/1096108812）一起读，必有收获。

人工甜味剂葡萄糖耐受 Lisa Rizzetto Lisa Rizzetto