Paul Cotter

运动员综述

肠道菌群是一个巨大的微生物库，其中一些微生物产生称为细菌素的抗菌肽，可以抑制与疾病相关的特定细菌。具核梭杆菌是一种新出现的与包括结直肠癌（CRC）在内的胃肠道疾病相关的人类细菌病原体。发表在Gut Microbes上的一项研究从健康供体的粪便样本中筛选到了一株对具核梭杆菌具有窄谱抗菌活性的唾液链球菌菌株DPC6993，其对模拟结肠环境中的其他细菌影响较小。该研究强调了天然肠道细菌靶向与CRC相关的细菌病原体的能力，或可作为生物疗法降低CRC发展的风险，并对结直肠癌的预后产生积极影响。

唾液链球菌细菌互作细菌素肠道细菌具核梭杆菌

菌群-肠-脑轴

Nature子刊：年轻的肠道菌群或能让衰老的大脑重焕青春

肠道菌群与大脑健康和衰老都有着密切关系。Nature Aging近期发表了来自John Cryan团队的研究工作，重点对比了移植年轻或老年小鼠的粪菌对老年小鼠的菌群、免疫（外周免疫+神经免疫）、大脑代谢组和基因表达以及行为的影响，表明年轻的肠道菌群可通过代谢和免疫等机制，部分逆转衰老引起的大脑功能和行为缺陷，或能为相关疾病的干预治疗带来新思路。

菌群-肠-脑轴衰老认知功能行为

自闭症

开菲尔改善自闭症小鼠的菌群-肠-脑轴损伤

开菲尔是一种发酵乳制品，Brain Behavior and Immunity近期发表的一项研究表明，在特定自闭症模型小鼠中，开菲尔可改善重复行为并调控免疫，这些作用与开菲尔对菌群的组成和功能的调控有关。

自闭症菌群-肠-脑轴开菲尔免疫调节

高脂饮食

蛋白质与肠道菌群互作影响机体脂代谢

文章探究了不同来源的蛋白（酪蛋白和乳清蛋白）的不同剂量（10-30%）对高脂饮食小鼠体重和组织脂肪。研究结果显示，高脂饮食增加小鼠体重和组织重量，但不同的膳食蛋白对小鼠菌群、体重等影响不同。

高脂饮食膳食蛋白

发酵食品

Nature Reviews：正式定义“发酵食品”，ISAPP发布重磅共识

发酵食品有着悠久的历史，伴随着近年对肠道菌群的研究开展，人们对发酵食品的关注也逐渐增加。国际益生菌和益生元科学协会（ISAPP）于2019年召开专家会议，明确了发酵食品的准确定义和类型以及与益生菌的区别，探讨了其安全性、风险和健康益处（包括其营养属性和潜在的改善健康的机制），并回顾了发酵食品的监管和在膳食指南中的现状。这些内容形成的共识声明文章已于近期发表在Nature Reviews Gastroenterology and Hepatology上，内容非常丰富，推荐专业人士仔细参考。

发酵食品共识声明

耐药组

猪场抗生素耐药组-何为关键影响因素？

集约养殖好还是粗放养殖好？在抗生素耐药性（AMR）已成为全球健康威胁的今天，除了回答是不是，还要探讨缘何而来。来自Microbiome上发表的最新研究，对西班牙全国38个猪场共467个微生物相关样品进行了分析。结果表明环境样品耐药基因（ARG）多样性较高。而比较生产系统则显示集约养殖ARG增多。这是否意味着从科学管理的角度出发，可以有效的减少ARG对人类的影响？

耐药组集约养殖研究论文基础研究养猪场

发酵食品

发酵食品：底物是最主要驱动力

研究利用鸟枪法宏基因组测序技术，通过对58种常见发酵食品进行分析发现，食品类型是发酵食品的主要驱动因素。并且，不同发酵食品中的菌群被鉴定，其相关的生物活性被关注和分析。发酵食品中的功能因子、功能菌群及其携带的相关基因成为未来关注重点。

发酵食品

细菌素

新一代抗菌剂——细菌素：毒副作用与监管（综述）

近年来，细菌素作为一种潜在的新型抗菌剂，受到了越来越多的研究与关注。FEMS Microbiology Reviews上发表的一篇综述文章，详细介绍了细菌素的分类及应用（食品工业、临床医疗、兽医等），重点关注了的细菌素的潜在安全性问题，并讨论了监管部门对于应用于不同领域的细菌素的指导法规。

细菌素 Antimicrobials Bacteriocins gastrointestinal bioavailability Toxicity

食品菌群

Nature子刊：奶酪品质好不好？菌群很关键

Nature Food近期发表的一项研究，对爱尔兰55种奶酪进行宏基因组及品质分析。结果表明，不同奶酪中菌群各异，受生物或非生物因素的影响呈一定动态变化。这些菌群通过分泌菌素或其它抗菌素，抵御噬菌体等的入侵。同时，宏基因组检测到的47个新品种可能影响奶酪质量。该研究彰显了宏基因组技术在研究发酵食品等方面的巨大潜力。

食品菌群 Applied microbiology Microbiome 奶酪

发酵乳制品

发酵饮料开菲尔对小鼠菌群-免疫-肠-脑轴的改善作用

开菲尔（Kefir）是一种以牛乳、羊乳或山羊乳为原料的发酵饮料。来自Microbiome上发表的一项最新研究，对比分析了2种不同kefir（Fr1及UK4）对小鼠的作用，发现不同的开菲尔可对肠道菌群组成产生不同影响，并对小鼠的行为及免疫产生不同的调控作用。

发酵乳制品 kefir 动物实验肠-脑轴菌群-免疫互作

饮食

高脂饮食增加李斯特菌感染风险

饮食 Diet Goblet cell Immunity infection

炎症性肠病

克罗恩病和溃疡性结肠炎有不同的肠系膜淋巴结菌群

Journal of Crohn's and Colitis近期发表一项研究，分析克罗恩病和溃疡性结肠炎患者的肠系膜淋巴结菌群，表明二者间存在明显不同。

炎症性肠病 INFLAMMATORY BOWEL DISEASE Microbiome mesenteric lymph nodes 肠系膜淋巴结菌群

病毒组

优化噬菌体组分析流程，解析噬菌体母婴传播

Microbiome近期发表研究，以分析母婴样本为例，对噬菌体组的分析流程进行优化，还开发了分析测序数据的新工具，值得专业人士关注。

病毒组 Gastro intestinal tract Gut microbiota metagenome metagenomics

运动

短期运动及蛋白补剂对肠道菌群的影响

锻炼可改变肠道菌群，但尚不清楚菌群变化是否介导了锻炼对体质的改善。mSystems近期发表一项人体研究，表明短期锻炼对人体肠道菌群的影响有限，而运动人士经常使用的蛋白补剂可显著改变肠道病毒组。文章作者认为，长期运动相关的肠道菌群变化，可能是对锻炼和体质改善的响应。

运动蛋白质补剂肠道菌群肠道病毒组 Lei Zhang

细菌素

细菌素或为生物被膜克星（综述）

本文总结了以羊毛硫抗生素为代表的细菌素用于防御和清除生物被膜的相关研究，指出细菌素与其他抗生素具有良好的协同抗菌作用，联用后具有高效、经济的优点，并可以一定程度规避抗生素耐药性的形成，拥有客观的运用潜力。作者同时也总结了目前细菌素运用的局限性，以及相关领域的瓶颈和发展方向，值得专业人士参考。

细菌素生物被膜

短读长测序

AEM：短读长测序用于食品污染安全监测，大有可为！

这篇研究很有意义，发现利用短读长测序方法，有效监测到被奶牛肠道菌群污染的发酵乳制品，其快速、高效、成本低廉，或可称为食品安全利器！值得关注！

短读长测序宏基因组发酵乳制品饮料食品安全病原菌

BJSM：运动医学中的肠道菌群，值得关注！

运动会改变代谢，也会改变菌群，在运动医学中充分注重肠道菌群的重要性，很关键，很有必要，推荐阅读。

Juan Duarte Iñaki Robles-Vera

farm practices

AEM：污染原奶的细菌主要从哪里来？

在乳品工业中，原奶被污染是一个可能严重影响产品质量的事件，而原奶的微生物污染会从哪里来呢？这个研究值得看看。

farm practices food chain food safety metagenomics microbial source tracking

克菲尔

发酵克菲尔饮料（酸乳酒）的微生物组及其健康促进作用

① 克菲尔是一种复杂的发酵乳制品，由乳酸菌及酵母发酵牛奶制成； ② 与其他发酵乳制品一样，克菲尔也有一些有益健康的功能； ③ 例如胆固醇代谢、对血管紧张素转化酶的抑制、抗菌活性、肿瘤抑制、加速愈伤及调节免疫系统； ④ 本综述介绍了克菲尔中的微生物组组成及其对于健康的益处。

克菲尔微生物组 Lei Chen Yu-Dong Cai

阑尾

mBio：切下来的阑尾里，有什么细菌？

一个有意义的研究，这也算是人（虽然得阑尾炎的人，炎症状态比较高）的活体肠道中菌群检测的一个案例。

阑尾微生物 Chi Luo Pere Puigserver