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Nadim J Ajami
文章数:33篇
肿瘤免疫治疗
Nature子刊:肠道菌群、饮食与癌症免疫治疗结果的关联
肠道菌群可影响癌症患者对免疫检查点抑制剂(ICI)的反应,但饮食和地理因素是否影响两者的关系,尚未在前瞻性试验中得到充分研究。Nature Medicine近期发表文章,对来自不同国家的接受新辅助治疗联合ICI治疗的高风险可切除转移性黑色素瘤患者进行前瞻性分析,揭示了基线肠道菌群特征、饮食摄入和全身性炎症(以C反应蛋白为标志物)在塑造ICI应答和毒性(免疫相关不良事件)方面的新联系。
肿瘤免疫治疗
肠道菌群
饮食
营养不良
肠道菌群、肠屏障损伤和LPS,驱动小鼠营养不良的病理性炎症
急性营养不良或消瘦与五岁以下儿童的死亡有关,并增加了感染性疾病的风险。对人类和临床前模型的研究表明,营养不良与未成熟的肠道微生物群有关。对中度急性营养不良 (MAM)儿童的观察性研究也发现全身炎症的加剧和循环细菌脂多糖 (LPS,内毒素) 的增加。近期发表于Frontiers in Immunology的一项研究表明,急性营养不良引起的炎症加剧是肠道菌群变化、盲肠和结肠肠道屏障功能障碍以及系统性LPS暴露增加的结果。
营养不良
炎症
肠道菌群
肠屏障
脂多糖
胃肠道感染
多糖降解细菌促进轮状病毒感染
《Gut Microbes》上发表的一项最新研究,发现轮状病毒感染后可增加小肠中的黏蛋白分泌,并改变回肠中的菌群多样性与组成,其中增加的拟杆菌属与Akkermansia菌属可降解黏蛋白多糖,以降低黏蛋白与轮状病毒的结合能力,从而促进轮状病毒的感染。
胃肠道感染
Rotavirus
Microbiome
Mucus
Muc2
胃癌
多种细菌与蒙古人群胃癌相关
在蒙古国,尽管幽门螺杆菌的致病性较弱,胃癌的发病率和死亡率却很高。发表在Alimentary Pharmacology and Therapeutics的最新研究旨在评价胃癌患者胃黏膜菌群分布及其前体组织学状况。该研究纳入48名胃癌(GC)患者和120名非癌患者的20例正常胃黏膜(对照组),检测了20例胃炎,40例萎缩和40例肠上皮化生(IM),进行16S rRNA基因扩增子测序,并比较基于诊断组和幽门螺杆菌感染状态的分类和功能预测谱。该研究发现,除幽门螺杆菌外,其他微生物因素也可能在蒙古人群GC中起作用,并发现了GC与肠球菌属、乳杆菌属、肉杆菌属、谷氨酰胺杆菌属、梭杆菌属等之间的新关联。
胃癌
胃粘膜菌群
蒙古人群
幽门螺杆菌
代谢
肠道病毒组
Nature子刊:肠道病毒感染与儿童胰岛自身免疫和1型糖尿病
破坏胰岛β细胞的自身免疫反应,可导致胰岛素分泌不足和1型糖尿病(T1D)。有研究显示,这种胰岛自身免疫的发生可能与病毒感染有关,比如某些能感染β细胞的肠道病毒。Nature Medicine近期发表了一项来自TEDDY队列的报告,对有T1D风险的儿童进行前瞻性分析,鉴定出与胰岛自身免疫和/或T1D风险相关的肠道病毒和参与抗病毒应答的遗传突变,为进一步设计实验来检验特定肠道病毒在胰岛自身免疫和T1D中的作用和机制,以及开发潜在的抗病毒预防方法,打下基础。
肠道病毒组
胰岛自身免疫
1型糖尿病
前瞻性队列研究
肠病毒B
炎症性肠病
Nature:炎症性肠病肠道微生态系统的多组学分析
《Nature》最新发表来自Curtis Huttenhower和Ramnik J. Xavier团队合作主导的研究,对132名受试者一年内多个时间点的粪便、活检和血液样本,进行纵向多组学分析,全面揭示了炎症性肠病(IBD)相关的肠道菌群及其功能失调,以及宿主和菌群的分子互作关联,对于阐释IBD机制、寻找防治IBD的新靶点有重要价值。
炎症性肠病
CROHN'S DISEASE
Microbiome
Systems analysis
ULCERATIVE COLITIS
鼻腔菌群
鼻腔菌群结果如何影响婴儿期急性呼吸道感染
鼻腔菌群会调节局部免疫,从而影响呼吸道感染的发生发展。《Thorax》近期发表研究,纳入800余名健康婴儿,发现婴儿鼻腔菌群可以按照主要菌群类型分为5类,其中以莫拉克斯氏菌属为主的鼻腔菌群与发生消化道感染的风险相关。该结果提示莫拉克斯氏菌属可能是增加婴儿呼吸道感染及严重程度的因素。
鼻腔菌群
呼吸道感染
Children
Infant
Lower respiratory tract infection
胃部菌群
幽门螺杆菌阳性及阴性胃炎患者的胃部菌群差异
来自《Cancers》上发表的一项最新研究,对比分析了胃癌高发地区中幽门螺杆菌阴性胃炎、幽门螺杆菌阳性胃炎及幽门螺杆菌阴性健康人的胃部菌群差异,发现幽门螺杆菌阳性患者菌群的丰度度显著下降,阴性患者菌群中存在潜在病原菌,该结果对于研究幽门螺杆菌患者的胃部菌群特征、探究潜在致病菌具有参考价值。
胃部菌群
Helicobacter pylori
non-Helicobacter pylori
gastritis
microbiota
噬菌体
Cell子刊:噬菌体可能加重肠道炎症
噬菌体是广泛分布于肠道菌群中。Cell Host and Microbe近期发表研究,发现噬菌体可改变哺乳动物粘膜免疫,进而影响健康。本研究有助于阐释人类结肠炎病症程度和治疗有效性,也有助于拓展肠道病毒组研究,值得参考。
噬菌体
肠道炎症
动物实验
人体研究
肠道免疫
绿茶多酚
赵立平团队:绿茶多酚改善糖尿病小鼠血糖
赵立平团队近期在《Molecular Nutrition and Food Research》上发表一项研究,发现绿茶多酚(而非茶黄素)可调节糖尿病小鼠模型的肠道菌群,并抑制β细胞损伤,从而改善血糖水平。
绿茶多酚
db/db mice
Diabetes
Intestinal Microbiota
Metabolism
轮状病毒感染
Nature子刊:母乳成分影响婴儿的轮状病毒感染症状
婴儿感染轮状病毒后的症状表现与否具有差异。本研究发现母乳中的人乳寡糖、母乳菌群和婴儿肠道菌群的建立在感染症状的表现方面具有相关性,人乳寡糖可促进轮状病毒疫苗感染活性。本研究结果对研究婴儿胃肠道感染、指导母乳喂养、开发婴儿配方奶和疫苗研发具有参考价值。
轮状病毒感染
婴儿肠道症状
人乳寡糖
母乳菌群
婴儿粪便菌群
Nature:早发1型糖尿病的早期菌群特征
1型糖尿病(T1D)是一种自身免疫疾病,与遗传和环境因素有关。TEDDY研究是一项美国和欧洲的多中心纵向队列研究,分析有T1D遗传风险的婴幼儿的肠道菌群等潜在T1D风险因素。Nature刚刚上线两项基于该队列的研究,本研究主要分析了与T1D相关的肠道菌群功能和组成特征,表明短链脂肪酸对T1D有潜在预防作用。该研究也分析了婴幼儿期肠道菌群发育的规律,不妨与另一项研究(http://www.mr-gut.cn/papers/read/1083526450)搭配阅读。
1型糖尿病
Nature:早发1型糖尿病的早期菌群特征
1型糖尿病(T1D)是一种自身免疫疾病,与遗传和环境因素有关。TEDDY研究是一项美国和欧洲的多中心纵向队列研究,分析有T1D遗传风险的婴幼儿的肠道菌群等潜在T1D风险因素。Nature刚刚上线两项基于该队列的研究,本研究主要分析了与T1D相关的肠道菌群功能和组成特征,表明短链脂肪酸对T1D有潜在预防作用。该研究也分析了婴幼儿期肠道菌群发育的规律,不妨与另一项研究(http://www.mr-gut.cn/papers/read/1083526450)搭配阅读。
1型糖尿病
TEDDY研究
婴儿肠道菌群
母乳喂养
Chikako Shimokawa
婴儿肠道菌群
Nature:婴幼儿肠道菌群发育的3个阶段
Nature刚刚上线的第二篇基于TEDDY研究的论文,由美国贝勒医学院主导,用16S和宏基因组学法分析903名婴幼儿从3月龄至接近4岁期间的1.2万份粪便样本,主要总结了幼年期人体肠道菌群的发育特征,也分析了1型糖尿病相关的菌群因素,可与另一项研究(http://www.mr-gut.cn/papers/read/1056909634)搭配阅读。相关发现对于理解婴幼儿肠道菌群建立和发育规律、喂养方式对肠道菌群的影响,以及以此为基础的菌群相关疾病研究,都有重要参考价值,不过这些规律背后的生理意义和对健康的影响,仍需后续研究阐释。
婴儿肠道菌群
母乳喂养
肠道菌群发育
分娩方式
环境因素
高血压
干预菌群增加乙酸,或能治疗高血压
高血压与肠道菌群失调有关。美国心脏协会旗下刊物Hypertension近期发表一项动物研究,在阻塞性睡眠呼吸暂停(OSA)大鼠模型中证实,菌群失调导致的乙酸生成减少,在OSA引起的高血压中有关键作用。通过益生菌/元和灌注等方法,增加肠道内的乙酸浓度,可显著改善模型大鼠的高血压和炎症,为治疗高血压提供了潜在干预策略。
高血压
阻塞性睡眠呼吸暂停
大鼠
丁酸梭菌
益生菌
病毒组
Nature子刊:分析病毒组的新工具
Nature Communications近期发表研究,报导了用于对宏基因组数据中的分析病毒组的新工具VirMAP,比其它工具有更好的表现。
病毒组
宏基因组学
病毒分类
L Shi
R Landberg
中风
年龄相关的菌群组成影响小鼠的中风结果
Annals of Neurology上的一项最新研究发现,小鼠中风后的存活率及行为表现与菌群相关,对衰老的菌群进行调节可能是改善中风结果的潜在策略。
中风
缺血性卒中
衰老
aging
Dysbiosis
吸烟
吸烟及电子烟对口腔及肠道菌群的影响
越来越多的人在用电子烟代替传统的烟草,但电子烟对口腔及肠道菌群的影响尚未明确。PeerJ上的最新研究选取了吸烟者、吸电子烟者及非吸烟者,分析鉴定了菌群的差异。未来需更大样本量的研究以揭示电子烟对菌群的影响。
吸烟
电子烟
结直肠癌
抗生素促进大肠癌小鼠模型的癌症进展
家族性结肠息肉病患者常见Apc基因突变。在结直肠癌小鼠(Apc min/+)模型中,抗生素的使用不均匀地减少了肠道菌群,并减少了可分泌黏液的杯状细胞的数量,使黏液保护层变薄,促进肿瘤的发生。该研究表明,Apc突变个体长期使用抗生素可能促进肿瘤进展。
结直肠癌
抗生素
肠道菌群
APC基因突变
杯状细胞
鼻前孔
Microbiome:鼻拭子样本或许久可用于婴儿支气管炎的诊断
这是Microbiome[IF:8.496]发表的一篇有临床指导价值的研究,对比分析了入院治疗的815名支气管炎婴儿的鼻拭子和鼻咽吸出样本中的菌群异同,提出虽然存在差异,但鼻拭子样本的菌群特征依然可用于婴儿支气管炎的诊断。很值得临床专业人士参考,特别推荐。
鼻前孔
支气管炎
鼻咽
Anterior nares
Asthma
肠道真菌
Microbiome:HMP中健康人样本的肠道真菌群
这是Microbiome[IF:8.496]发表的关于利用人类微生物组计划中317份健康人粪便样本做真菌群分析的研究,实验设计并无太大新意,但样本来源于HMP,一下就高大上了。话说华大基因的同志们,metaHIT里有没有类似的宝贝可以挖挖?[呲牙]
肠道真菌
Raphael Chevre
Raphael Chevre
Oliver Soehnlein
毛细支气管炎
AJRCCM:鼻咽菌群及代谢产物与婴儿毛细支气管炎的严重性相关
这项研究发现,婴儿毛细支气管炎严重不严重,与鼻咽的菌群和其代谢产物有关,值得认真读一读。
毛细支气管炎
婴儿
代谢组学
鞘脂
鼻咽菌群
菌群稳定性
GM:住院白血病患者的菌群动态
一个纳入59例急性骨髓性白血病供800余份样本的研究,很值得读一读。
菌群稳定性
急性骨髓性白血病
化疗
抗生素
口腔菌群
克罗恩病
STM:克罗恩病伴生脊柱关节炎?某些大肠杆菌在作怪
一些克罗恩病患者会同时伴有痛苦的脊柱关节炎,研究者发现这些病人的免疫系统似乎更容易识别一种特定类型的大肠杆菌,这样的大肠杆菌是什么?它们怎样发挥作用?看看这篇文章。
IBD
克罗恩病
脊柱关节炎
Th17
Jay Liu
Dysbiosis
生理基因组学:肠道菌群改变,促进大鼠高血压
之前我们分享了中国科学家合作的关于肠道菌群与高血压的文献(http://mc.gutgutgut.cn/papers/read/1083526920),最近还有一篇相关文献发表,也特别推荐给大家。
Dysbiosis
Hypertension
microbiota
Short chain fatty acids
spontaneously hypertensive rat
Nasal Airway Microbiota
PIDJ:婴儿鼻气道菌群与支气管炎关系密切
菌群与感染性疾病息息相关,这篇IF不高的文献再次证明。未来我们看待感染性疾病,特别是不同个体的异质性,恐怕不能再是单一因素去看待,综合菌群在内的因素来看感染,可能更能找到造福于患者的靠谱解决方案。
Nasal Airway Microbiota
Severe Bronchiolitis
Case-Control Study
John E Levine
John E Levine
LL-37
JACI:婴儿先天免疫、呼吸道菌群和支气管炎发病机制
观察1005名支气管炎住院儿童,发现血清LL-37抗菌肽的水平和疾病严重程度的鼻咽菌群组成之间有显著相互作用关系,这个研究值得一看。
LL-37
airway
bronchiolitis
cathelicidin
cohort study
microbiota
CR:肠道菌群与终身心血管疾病风险有何联系?
哪些肠道细菌与终身心血管疾病风险有关?Circulation Research [IF-11.551]这篇文章值得感兴趣的人好好读一读。
microbiota
cardiovascular disease risk factors
lipids
blood pressure
blood glucose.
婴儿菌群
PI:兄弟姐妹对婴儿鼻腔和粪便菌群有何影响?
最早的卫生假说提出的一个背景是,科学家发现家庭里兄弟姐妹多的孩子,不易发生过敏等疾病,后来有很多研究支持多接触人和动物对婴儿共生微生物多样性的建立和免疫系统的训练有好处。这篇文章IF不高,但值得简单看看结果。
婴儿菌群
粪便菌群
鼻腔菌群
兄弟姐妹
Swee-Ling Lim
心血管疾病
CR:肠道菌群显著影响心血管疾病发生风险
对有最高心血管疾病风险的参与者进行研究,发现特定属细菌的存在、细菌多样性低,与心血管疾病密切相关。IF-11.6的paper,该看还是要看滴!
心血管疾病
菌群多样性
Suetonia C Palmer
Giovanni F M Strippoli